Quimera (biología molecular)


En genética y biología molecular , una quimera es una sola secuencia de ADN que se origina a partir de múltiples transcritos o secuencias parentales. Puede ocurrir en varios contextos. Las quimeras generalmente se consideran un contaminante, ya que una quimera puede interpretarse como una secuencia nueva cuando, de hecho, es un artefacto . Sin embargo, la formación de quimeras artificiales también puede ser una herramienta útil en biología molecular. Por ejemplo, en la ingeniería de proteínas , la "quimeragénesis (formación de quimeras entre proteínas codificadas por ADNc homólogos )" [1] es una de las "dos técnicas principales utilizadas para manipular secuencias de ADNc". [1]

Una quimera puede presentarse como una única secuencia de ADNc que se origina a partir de dos transcritos . Por lo general, se considera que es un contaminante en las bases de datos de transcripciones y etiquetas de secuencias expresadas (lo que da como resultado el apodo de quimera EST ). [2] Se estima que aproximadamente el 1% de todas las transcripciones en la base de datos Unigene del Centro Nacional de Información Biotecnológica contienen una "secuencia quimérica". [3]

Una quimera también puede ser un artefacto de la amplificación por PCR . Ocurre cuando se aborta la extensión de un amplicón y el producto abortado funciona como cebador en el siguiente ciclo de PCR. El producto abortado se hibrida con la plantilla incorrecta y continúa extendiéndose, sintetizando así una sola secuencia procedente de dos plantillas diferentes. [4]

Las quimeras de PCR son un tema importante a tener en cuenta durante la metabarcodificación , donde se utilizan secuencias de ADN de muestras ambientales para determinar la biodiversidad. Una quimera es una secuencia novedosa que muy probablemente no coincidirá con ningún organismo conocido. Por lo tanto, podría interpretarse como una nueva especie que infla la diversidad.

Una lectura quimérica es una secuencia de ADN digital (es decir, una cadena de letras en un archivo que se puede leer como una secuencia de ADN) que se origina a partir de una quimera real (es decir, una secuencia física de ADN en una muestra) o que se produce debido a una lectura incorrecta de la muestra. Se sabe que esto último ocurre con la secuenciación de geles de electroforesis . [5]