Quinasa 9 dependiente de ciclina

CDK9
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 3BLH , 3BLQ , 3BLR , 3LQ5 , 3MI9 , 3MIA , 3MY1 , 3TN8 , 3TNH , 3TNI , 4BCF , 4BCG , 4BCH , 4BCI , 4BCJ , 4EC8 , 4EC9 , 4IMY , 4OGR , 4OR5
Identificadores
Alias	CDK9 , C-2k, CDC2L4, CTK1, PITALRE, TAK, quinasa dependiente de ciclina 9, quinasa dependiente de ciclina 9
Identificaciones externas	OMIM : 603251 MGI : 1328368 HomoloGene : 55566 GeneCards : CDK9
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 9 (humano) [1] Banda 9q34.11 Comienzo 127,785,679 pb [1] Final 127,790,792 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 2 (ratón) [2] Banda 2 | 2 B Comienzo 32.705.784 pb [2] Final 32,713,076 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • de nucleótidos de unión • actividad de transferasa • actividad de la proteína quinasa • 7SK snRNA unión • transcripción coactivador de unión • unión snRNA • de unión de ATP • unión de ARN polimerasa II de ADN específica de secuencia promotor central • la unión al ADN • factor de transcripción de unión • GO: proteína de unión 0001948 • proteína actividad serina / treonina quinasa • unión a cromatina • actividad quinasa • proteína dependiente de ciclina actividad serina / treonina quinasa • ARN polimerasa II CTD heptapéptido repetición quinasa actividad • unión a proteína quinasa • unión a ciclina • GO: 0000980 ARN polimerasa II región reguladora cis unión de ADN específica de secuencia Componente celular • citoplasma • núcleo • membrana • nucleoplasma • complejo de factor de elongación de la transcripción • complejo de factor de elongación de transcripción positivo para ciclina / CDK • cuerpo de LMP • cromosoma • gránulo de ribonucleoproteína citoplasmática • complejo de holoenzima de proteína quinasa dependiente de ciclina Proceso biológico • regulación positiva de la hipertrofia del músculo cardíaco • regulación positiva de la unión del ARNm 3'-UTR • regulación de la diferenciación de las células musculares • regulación negativa de la poliadenilación del ARNm • Reparación del ADN • respuesta celular al estímulo de las citocinas • regulación positiva de la transcripción viral • procesamiento de la horquilla de replicación • proteína fosforilación • regulación de la modificación de histonas • regulación del ciclo celular mitótico • respuesta celular al estímulo de daño del ADN • iniciación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación de la reparación del ADN • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • proliferación de la población celular • respuesta al fármaco • transcripción por la ARN polimerasa II • fosforilación • regulación positiva de la fosforilación de histonas • regulación positiva de la ubiquitinación de la histona H2B • regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II • transcripción, plantilla de ADN • transcripción de ARNnn por ARN polimerasa II • elongación de la transcripción del promotor de ARN polimerasa II • fosforilación del dominio C-terminal de ARN polimerasa II • regulación positiva de la elongación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	1025	107951
Ensembl	ENSG00000136807	ENSMUSG00000009555
UniProt	P50750	Q99J95
RefSeq (ARNm)	NM_001261	NM_130860
RefSeq (proteína)	NP_001252 NP_001252.1	NP_570930
Ubicación (UCSC)	Crónicas 9: 127,79 - 127,79 Mb	Crónicas 2: 32,71 - 32,71 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
Ver / editar humano Ver / Editar mouse

La quinasa dependiente de ciclina 9 o CDK9 es una quinasa dependiente de ciclina asociada con P-TEFb .

Función

La proteína codificada por este gen es un miembro de la familia de quinasas dependientes de ciclina (CDK). Los miembros de la familia CDK son muy similares a los productos génicos de S. cerevisiae cdc28 y S. pombe cdc2, y se conocen como importantes reguladores del ciclo celular. Se descubrió que esta quinasa era un componente del complejo multiproteico TAK / P-TEFb, que es un factor de elongación para la transcripción dirigida por la ARN polimerasa II y funciona fosforilando el dominio C-terminal de la subunidad más grande de la ARN polimerasa II . Esta proteína forma un complejo y está regulada por su subunidad reguladora ciclina T o ciclina K. Se encontró que la proteína Tat del VIH-1 interactúa con esta proteína y la ciclina T, lo que sugiere una posible participación de esta proteína en el SIDA. ^[5]

También se sabe que CDK9 se asocia con otras proteínas como TRAF2 y participa en la diferenciación del músculo esquelético. ^[6]

Interacciones

Se ha demostrado que CDK9 interactúa con:

• Receptor de andrógenos , ^[7]
• CDC34 ^[8] y
• CCNK , ^[9]
• CCNT1 , ^{[9] [10] [11] [12] [13] [14] [8] [15] [16]}
• CCNT2 , ^[10]
• MYBL2 , ^[15]
• RELA , ^[17]
• RB1 , ^[18]
• SKP1A , ^[8] y
• SUPT5H . ^[dieciséis]

Referencias

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136807 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009555 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. "Gen Entrez: quinasa dependiente de ciclina CDK9 9 (quinasa relacionada con CDC2)" .
6. MacLachlan TK, Sang N, De Luca A, Puri PL, Levrero M, Giordano A (1998). "Enlace de CDK9 a TRAF2". J. Cell. Biochem . 71 (4): 467–78. doi : 10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19981215) 71: 4 <467 :: AID-JCB2> 3.0.CO; 2-G . PMID 9827693 . 
7. Lee DK, Duan HO, Chang C (marzo de 2001). "El receptor de andrógenos interactúa con el factor de alargamiento positivo P-TEFb y mejora la eficacia del alargamiento transcripcional" . J. Biol. Chem . 276 (13): 9978–84. doi : 10.1074 / jbc.M002285200 . PMID 11266437 . 
8. Kiernan RE, Emiliani S, Nakayama K, Castro A, Labbé JC, Lorca T, Nakayama Ki K, Benkirane M (diciembre de 2001). "La interacción entre ciclina T1 y SCF (SKP2) se dirige a CDK9 para ubiquitinación y degradación por el proteasoma" . Mol. Célula. Biol . 21 (23): 7956–70. doi : 10.1128 / MCB.21.23.7956-7970.2001 . PMC 99964 . PMID 11689688 .  
9. Fu TJ, Peng J, Lee G, Price DH, Flores O (diciembre de 1999). "Cyclin K funciona como una subunidad reguladora de CDK9 y participa en la transcripción de la ARN polimerasa II" . J. Biol. Chem . 274 (49): 34527-30. doi : 10.1074 / jbc.274.49.34527 . PMID 10574912 . 
10. Peng J, Zhu Y, Milton JT, Price DH (marzo de 1998). "Identificación de múltiples subunidades de ciclina de P-TEFb humano" . Genes Dev . 12 (5): 755–62. doi : 10.1101 / gad.12.5.755 . PMC 316581 . PMID 9499409 .  
11. Cabart P, Chew HK, Murphy S (julio de 2004). "BRCA1 coopera con NUFIP y P-TEFb para activar la transcripción por la ARN polimerasa II" . Oncogén . 23 (31): 5316–29. doi : 10.1038 / sj.onc.1207684 . PMID 15107825 . 
12. Young TM, Wang Q, Pe'ery T, Mathews MB (septiembre de 2003). "La proteína que contiene el dominio I-mfa humano, HIC, interactúa con la ciclina T1 y modula la transcripción dependiente de P-TEFb" . Mol. Célula. Biol . 23 (18): 6373–84. doi : 10.1128 / MCB.23.18.6373-6384.2003 . PMC 193714 . PMID 12944466 .  
13. Michels AA, Nguyen VT, Fraldi A, Labas V, Edwards M, Bonnet F, Lania L, Bensaude O (julio de 2003). "El ARN MAQ1 y 7SK interactúan con los complejos CDK9 / ciclina T de una manera dependiente de la transcripción" . Mol. Célula. Biol . 23 (14): 4859–69. doi : 10.1128 / MCB.23.14.4859-4869.2003 . PMC 162212 . PMID 12832472 .  
14. Hoque M, Young TM, Lee CG, Serrero G, Mathews MB, Pe'ery T (marzo de 2003). "El factor de crecimiento granulina interactúa con ciclina T1 y modula la transcripción dependiente de P-TEFb" . Mol. Célula. Biol . 23 (5): 1688–702. doi : 10.1128 / MCB.23.5.1688-1702.2003 . PMC 151712 . PMID 12588988 .  
15. De Falco G, Bagella L, Claudio PP, De Luca A, Fu Y, Calabretta B, Sala A, Giordano A (enero de 2000). "La interacción física entre CDK9 y B-Myb da como resultado la supresión de la autorregulación del gen B-Myb" . Oncogén . 19 (3): 373–9. doi : 10.1038 / sj.onc.1203305 . PMID 10656684 . 
16. Garber ME, Mayall TP, Suess EM, Meisenhelder J, Thompson NE, Jones KA (septiembre de 2000). "La autofosforilación de CDK9 regula la unión de alta afinidad del complejo tat-P-TEFb del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 al ARN de TAR" . Mol. Célula. Biol . 20 (18): 6958–69. doi : 10.1128 / MCB.20.18.6958-6969.2000 . PMC 88771 . PMID 10958691 .  
17. Amini S, Clavo A, Nadraga Y, Giordano A, Khalili K, Sawaya BE (agosto de 2002). "La interacción entre los factores cdk9 y NF-kappaB determina el nivel de transcripción del gen del VIH-1 en las células astrocíticas" . Oncogén . 21 (37): 5797–803. doi : 10.1038 / sj.onc.1205754 . PMID 12173051 . 
18. Simone C, Bagella L, Bellan C, Giordano A (junio de 2002). "Interacción física entre pRb y complejo cdk9 / cyclinT2" . Oncogén . 21 (26): 4158–65. doi : 10.1038 / sj.onc.1205511 . PMID 12037672 . 

Lectura adicional

• Jeang KT (1998). "Tat, quinasa asociada a Tat y transcripción". J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7. doi : 10.1007 / BF02253352 . PMID  9570510 .
• Yankulov K, Bentley D (1998). "Control transcripcional: cofactores Tat y alargamiento transcripcional". Curr. Biol . 8 (13): R447–9. doi : 10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1 . PMID  9651670 . S2CID  15480646 .
• Romano G, Kasten M, De Falco G, et al. (2000). "Funciones reguladoras de Cdk9 y de ciclina T1 en la expresión génica de la vía de transactivación de tat del VIH". J. Cell. Biochem . 75 (3): 357–68. doi : 10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K . PMID  10536359 .
• Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). "Múltiples modos de regulación transcripcional por el transactivador Tat del VIH-1". IUBMB Life . 51 (3): 175–81. doi : 10.1080 / 152165401753544241 . PMID  11547919 . S2CID  10931640 .
• Huigen MC, Kamp W, Nottet HS (2004). "Múltiples efectos de la proteína trans-activadora del VIH-1 sobre la patogénesis de la infección por VIH-1". EUR. J. Clin. Invertir . 34 (1): 57–66. doi : 10.1111 / j.1365-2362.2004.01282.x . PMID  14984439 . S2CID  29713968 .
• Rice AP, Herrmann CH (2004). "Regulación de TAK / P-TEFb en macrófagos y linfocitos T CD4 +". Curr. HIV Res . 1 (4): 395–404. doi : 10.2174 / 1570162033485159 . PMID  15049426 .
• Minghetti L, Visentin S, Patrizio M, et al. (2004). "Múltiples acciones de la proteína Tat del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 sobre las funciones de las células microgliales". Neurochem. Res . 29 (5): 965–78. doi : 10.1023 / B: NERE.0000021241.90133.89 . PMID  15139295 . S2CID  25323034 .
• Liou LY, Herrmann CH, Rice AP (2005). "Infección por VIH-1 y regulación de la función Tat en macrófagos". En t. J. Biochem. Cell Biol . 36 (9): 1767–75. doi : 10.1016 / j.biocel.2004.02.018 . PMID  15183343 .
• Pugliese A, Vidotto V, Beltramo T, et al. (2005). "Una revisión de los efectos biológicos de la proteína Tat del VIH-1". Cell Biochem. Funct . 23 (4): 223–7. doi : 10.1002 / cbf.1147 . PMID  15473004 . S2CID  8408278 .
• Bannwarth S, Gatignol A (2005). "ARN TAR del VIH-1: el objetivo de las interacciones moleculares entre el virus y su anfitrión". Curr. HIV Res . 3 (1): 61–71. doi : 10.2174 / 1570162052772924 . PMID  15638724 .
• Gibellini D, Vitone F, Schiavone P, Re MC (2005). "Proteína tat de VIH-1 y proliferación y supervivencia celular: una breve revisión". New Microbiol . 28 (2): 95–109. PMID  16035254 .
• Peruzzi F (2006). "Las múltiples funciones de Tat del VIH-1: proliferación versus apoptosis". Parte delantera. Biosci . 11 : 708-17. doi : 10.2741 / 1829 . PMID  16146763 .

Enlaces externos

• Dependiente de ciclina + quinasa + 9 en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
• Quinasa dependiente de ciclina 9 de Drosophila - La mosca interactiva
• Ubicación del gen humano CDK9 en UCSC Genome Browser .
• Detalles del gen humano CDK9 en UCSC Genome Browser .

• Portal de biología

Este artículo relacionado con la enzima EC 2.7 es un fragmento . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo .

• v
• t
• mi