dNaM es una nucleobase artificial que contiene un grupo 3-metoxi-2-naftilo en lugar de una base natural.
Nombres | |
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Nombre IUPAC preferido (2 R , 3 S , 5 R ) -2- (hidroximetil) -5- (3-metoxinaftalen-2-il) oxolan-3-ol | |
Identificadores | |
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Modelo 3D ( JSmol ) | |
ChemSpider | |
PubChem CID | |
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Salvo que se indique lo contrario, los datos se proporcionan para materiales en su estado estándar (a 25 ° C [77 ° F], 100 kPa). | |
Referencias de Infobox | |
Cuando fue originalmente introducido con éxito en el ADN para la replicación en una E. coli organismo semi-sintético, se emparejaron con d5SICS . Para abreviar, se llama X, mientras que d5SICS se llama Y. [1] d5SICS fue reemplazado por dTPT3 en versiones revisadas debido a su capacidad mejorada para replicarse en una gama más amplia de contextos de secuencia. [2] X se empareja con Y usando interacciones hidrofóbicas y de empaquetamiento en lugar de enlaces de hidrógeno, lo que ocurre en pares de bases naturales. Dentro del organismo semisintético, la vía de reparación de parches erróneos dirigida por metilo ( MMR ) en realidad corrige los parches erróneos naturales-antinaturales, mientras que la reparación recombinacional en realidad elimina lo antinatural. [3] El organismo semisintético de E. coli logró aferrarse a la nueva base durante un tiempo prolongado, tanto mientras estaba en un plásmido como cuando estaba almacenado en el cromosoma. [4] [5] En el ADN libre, los anillos de d5SICS y dNaM se colocan en planos paralelos en lugar del mismo plano, pero cuando están dentro de una ADN polimerasa, se emparejan usando una conformación de borde a borde. [6] dNaM y dTPT3 también pueden moldear la transcripción de ARNm y ARNt por la ARN polimerasa de T7 que tiene la capacidad de producir decodificación en el ribosoma de E. coli para producir proteínas con aminoácidos no naturales, expandiendo el código genético . [7]
Referencias
- ^ Sarah Caplan (29 de noviembre de 2017). "Las células con ADN fabricado en laboratorio conducen al 'Santo Grial' de la biología sintética" . The Washington Post .
- ^ Zhang, Yorke; Lamb, Brian M .; Feldman, Aaron W .; Zhou, Anne Xiaozhou; Lavergne, Thomas; Li, Lingjun; Romesberg, Floyd E. (23 de enero de 2017). "Un organismo semisintético diseñado para la expansión estable del alfabeto genético" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 114 (6): 1317-1322. doi : 10.1073 / pnas.1616443114 . ISSN 0027-8424 .
- ^ Ledbetter, Michael P .; Karadeema, Rebekah J .; Romesberg, Floyd E. (17 de enero de 2018). "Reprogramación del replisoma de un organismo semisintético para la expansión del alfabeto genético" . Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 140 (2): 758–765. doi : 10.1021 / jacs.7b11488 . ISSN 0002-7863 . PMC 5793209 . PMID 29309130 .
- ^ "La bacteria sobrevive al trasplante de ADN no natural" . Rsc.org . Consultado el 29 de julio de 2015 .
- ^ Malyshev, Denis A .; Dhami, Kirandeep; Quach, Henry T .; Lavergne, Thomas; Ordoukhanian, Phillip; Torkamani, Ali; Romesberg, Floyd E. (2012). "La replicación eficiente e independiente de la secuencia del ADN que contiene un tercer par de bases establece un alfabeto genético funcional de seis letras" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 109 (30): 12005. Código Bibliográfico : 2012PNAS..10912005M . doi : 10.1073 / pnas.1205176109 . S2CID 26653524 . Consultado el 29 de julio de 2015 .
- ^ Betz, Karin; et al. (2013). "Conocimientos estructurales sobre la replicación del ADN sin enlaces de hidrógeno" . J Am Chem Soc . 135 (49): 18637–43. doi : 10.1021 / ja409609j . PMC 3982147 . PMID 24283923 .
- ^ Zhang, Yorke; Ptacin, Jerod L .; Fischer, Emil C .; Aerni, Hans R .; Caffaro, Carolina E .; San José, Kristine; Feldman, Aaron W .; Turner, Court R .; Romesberg, Floyd E. (noviembre de 2017). "Un organismo semisintético que almacena y recupera mayor información genética" . Naturaleza . 551 (7682): 644–647. doi : 10.1038 / nature24659 . ISSN 1476-4687 . PMC 5796663 .