Los termómetros FourU son una clase de termómetros de ARN no codificante que se encuentran en Salmonella . [1] Se denominan 'CuatroU' debido a los cuatro nucleótidos de uridina altamente conservados que se encuentran directamente opuestos a la secuencia Shine-Dalgarno en la horquilla II ( en la foto ).Los termómetros de ARN como FourU controlan la regulación de la temperatura a través de proteínas de choque térmico en muchos procariotas . [2] [3] [4] Los termómetros FourU son moléculas de ARN relativamente pequeñas, de solo 57 nucleótidos de longitud, y tienen una horquilla simple de dosestructura. [1]
FourU se encuentran en la región 5' no traducida del gen de la proteína de choque térmico Salmonella agsA , [1] [5] [6] reprimen la traducción de esta proteína emparejando la secuencia Shine-Dalgarno del ARNm del gen . [2] Esto evita que los ribosomas se unan al codón de inicio del gen. [7]
También se encuentran en la 5'UTR de los genes htrA (requisito de alta temperatura) en Salmonella y E.coli. [8]
En V. cholerae , el termómetro de cuatro U en el 5' de toxT controla su traducción dependiente de la temperatura. A la temperatura del cuerpo humano, la estructura del termómetro se abre y permite la traducción de la proteína activadora transcripcional ToxT, lo que facilita la virulencia de V. cholerae . [9]
Hairpin II parece ser una característica dinámica de la estructura secundaria de FourU . [1] [2] Sufre un cambio conformacional cuando se expone a temperaturas superiores a 45 °C, y se vuelve cada vez más desemparejado a medida que aumenta la temperatura. [1] La horquilla I, por el contrario, permanece estable en pares de bases a temperaturas de hasta 50 °C, lo que implica que el cambio estructural de la horquilla II de cerrado a abierto puede tener un papel importante en la respuesta al choque térmico . [1] Un estudio posterior utilizó análisis de mutantes y cálculos de entalpía y entropía .para soportar un mecanismo cooperativo de despliegue tipo cremallera de FourU hairpin II en respuesta al aumento de temperatura. [2]
Al igual que otros termómetros de ARN, FourU no es el único responsable de la expresión dependiente de la temperatura de su gen adyacente. [13] En su lugar, opera junto con un factor sigma (σ 32 ) [14] que se sabe que también regula muchos otros genes. [15] Se ha encontrado que las combinaciones de factor sigma-termómetro de ARN regulan otros genes de choque térmico (como ibpA en E. coli ) [4] lo que ha llevado a la especulación [ ¿por quién? ] de termómetros de ARN no descubiertos que funcionan junto con módulos de factor sigma para regularotros genes relacionados como un nivel adicional de control. La especulación adicional sugiere que el método más simple de termómetro de ARN de regulación génica puede haber evolucionado antes del control de transcripción del factor sigma más complejo. [1]