GTF2F1

GTF2F1
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 1F3U , 1I27 , 1J2X , 1NHA , 1ONV , 2K7L , 5IY9 , 5IYA , 5IYC , 5IYB , 5IY7 , 5IY8 , 5IYD , 5IY6
Identificadores
Alias	GTF2F1 , factor de transcripción general IIF, polipéptido 1, 74 kDa, BTF4, RAP74, TF2F1, TFIIF, subunidad 1 del factor de transcripción general IIF
Identificaciones externas	OMIM : 189968 MGI : 1923848 HomoloGene : 1585 GeneCards : GTF2F1
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 19 (humano) [1] Banda 19p13.3 Comienzo 6.379.572 pb [1] Fin 6.393.981 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 17 (ratón) [2] Banda 17 | 17 D Comienzo 57.003.405 pb [2] Fin 57.011.288 pb [2]
Ontología de genes Función molecular • la unión al ADN • GO: actividad coactivador 0001105 transcripción • factor de transcripción de unión • GO: proteína de unión 0001948 • actividad del activador de fosfatasa • unión de ARN • unión proteína fosfatasa • unión específica de proteínas de dominio • GO: 0000983 ARN polimerasa II actividad del factor de iniciación de la transcripción en general • promotor -Unión de cromatina específica Componente celular • orgánulo delimitado por la membrana intracelular • nucleoplasma • complejo del factor de transcripción TFIIF • unión celular • complejo del factor de transcripción TFIID • núcleo celular • complejo macromolecular Proceso biológico • Corte y empalme de ARNm, a través de espliceosoma • Regulación de la transcripción, plantilla de ADN • Elongación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • Respuesta al virus • Capa de ARNm de 7-metilguanosina • Transcripción del promotor de ARN polimerasa II • Transcripción, plantilla de ADN • Regulación positiva de virus transcripción • inicio de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación positiva del alargamiento de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • Transcripción del snRNA del promotor de la RNA polimerasa II • Vía de señalización del receptor del factor de crecimiento de fibroblastos • GO: 0048554 Regulación positiva de la actividad catalítica • Proceso metabólico del ARN • Regulación negativa de la unión a proteínas Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	2962	98053
Ensembl	ENSG00000125651	ENSMUSG00000002658
UniProt	P35269	Q3THK3
RefSeq (ARNm)	NM_002096	NM_133801
RefSeq (proteína)	NP_002087	NP_598562
Ubicación (UCSC)	Crónicas 19: 6,38 - 6,39 Mb	Crónicas 17: 57 - 57.01 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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La subunidad 1 del factor de transcripción general IIF es una proteína que en humanos está codificada por el gen GTF2F1 . ^{[5] [6]}

Interacciones

Se ha demostrado que GTF2F1 interactúa con:

• CTDP1 , ^[7]
• GTF2H4 , ^[8]
• HNRPU , ^[9]
• MED21 , ^{[8] [10]}
• POLR2A , ^{[8] [11]}
• Factor de respuesta sérica ^{[12] [13]}
• TAF11 , ^[8]
• TAF1 , ^{[14] [15] [16] [17]}
• Proteína de unión a TATA , ^{[8] [15] [17]} y
• La transcripción del factor II B . ^{[8] [18]}

Ver también

• Factor de transcripción II F

Referencias

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000125651 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000002658 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Finkelstein A, Kostrub CF, Li J, Chavez DP, Wang BQ, Fang SM, Greenblatt J, Burton ZF (marzo de 1992). "Un ADNc que codifica RAP74, un factor de iniciación general para la transcripción por la ARN polimerasa II". Naturaleza . 355 (6359): 464–7. Código Bibliográfico : 1992Natur.355..464F . doi : 10.1038 / 355464a0 . PMID 1734284 . S2CID 1241044 .  
6. "Gen Entrez: factor de transcripción general de GTF2F1 IIF, polipéptido 1, 74kDa" .
7. Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (octubre de 1998). "FCP1, la subunidad que interactúa con RAP74 de una proteína fosfatasa humana que desfosforila el dominio carboxilo-terminal de la ARN polimerasa IIO" . J. Biol. Chem . 273 (42): 27593–601. doi : 10.1074 / jbc.273.42.27593 . PMID 9765293 . 
8. Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (mayo de 1997). "BRCA1 es un componente de la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605–10. Código Bibliográfico : 1997PNAS ... 94.5605S . doi : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119 .  
9. Kim MK, Nikodem VM (octubre de 1999). "hnRNP U inhibe la fosforilación del dominio carboxi-terminal por TFIIH y reprime el alargamiento de la ARN polimerasa II" . Mol. Celda. Biol . 19 (10): 6833–44. doi : 10.1128 / MCB.19.10.6833 . PMC 84680 . PMID 10490622 .  
10. Suñé C, Hayashi T, Liu Y, Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA (octubre de 1997). "CA150, una proteína nuclear asociada con la holoenzima ARN polimerasa II, está involucrada en la transcripción del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 activado por Tat" . Mol. Celda. Biol . 17 (10): 6029–39. doi : 10.1128 / MCB.17.10.6029 . PMC 232452 . PMID 9315662 .  
11. Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (septiembre de 1998). "Un complejo de ARN polimerasa II humana que contiene factores que modifican la estructura de la cromatina" . Mol. Celda. Biol . 18 (9): 5355–63. doi : 10.1128 / MCB.18.9.5355 . PMC 109120 . PMID 9710619 .  
12. Joliot V, Demma M, Prywes R (febrero de 1995). "La interacción con la subunidad RAP74 de TFIIF es necesaria para la activación transcripcional por el factor de respuesta del suero". Naturaleza . 373 (6515): 632–5. Código Bibliográfico : 1995Natur.373..632J . doi : 10.1038 / 373632a0 . PMID 7854423 . S2CID 47196160 .  
13. Zhu H, Joliot V, Prywes R (febrero de 1994). "Papel del factor de transcripción TFIIF en la transcripción activada por factor de respuesta en suero". J. Biol. Chem . 269 (5): 3489–97. PMID 8106390 . 
14. Dikstein R, Ruppert S, Tjian R (marzo de 1996). "TAFII250 es una proteína quinasa bipartita que fosforila el factor de transcripción básico RAP74". Celular . 84 (5): 781–90. doi : 10.1016 / s0092-8674 (00) 81055-7 . PMID 8625415 . S2CID 18490534 .  
15. Ruppert S, Tjian R (noviembre de 1995). "Humano TAFII250 interactúa con RAP74: implicaciones para la iniciación de la ARN polimerasa II" . Genes Dev . 9 (22): 2747–55. doi : 10.1101 / gad.9.22.2747 . PMID 7590250 . 
16. Siegert JL, Robbins PD (enero de 1999). "Rb inhibe la actividad quinasa intrínseca del factor asociado a la proteína de unión a TATA TAFII250" . Mol. Celda. Biol . 19 (1): 846–54. doi : 10.1128 / MCB.19.1.846 . PMC 83941 . PMID 9858607 .  
17. Malik S, Guermah M, Roeder RG (marzo de 1998). "Un modelo dinámico para la función del coactivador de PC4 en la transcripción de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (5): 2192–7. Código bibliográfico : 1998PNAS ... 95.2192M . doi : 10.1073 / pnas.95.5.2192 . PMC 19292 . PMID 9482861 .  
18. Fang SM, Burton ZF (mayo de 1996). "La proteína asociada a la ARN polimerasa II (RAP) 74 se une al factor de transcripción (TF) IIB y bloquea la unión de TFIIB-RAP30" . J. Biol. Chem . 271 (20): 11703–9. doi : 10.1074 / jbc.271.20.11703 . PMID 8662660 . 

Lectura adicional

• Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, Chen CH, Rosen CA, Roeder RG (1992). "Tat del VIH-1 actúa como un factor de procesividad in vitro junto con factores de elongación celular" . Genes Dev . 6 (4): 655–66. doi : 10.1101 / gad.6.4.655 . PMID  1559613 .
• Aso T, Vasavada HA, Kawaguchi T, Germino FJ, Ganguly S, Kitajima S, Weissman SM, Yasukochi Y (1992). "Caracterización del cDNA para la gran subunidad del factor de iniciación de la transcripción TFIIF". Naturaleza . 355 (6359): 461–4. Código Bibliográfico : 1992Natur.355..461A . doi : 10.1038 / 355461a0 . PMID  1734283 . S2CID  4312708 .
• Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (1995). "Evaluación inicial de patrones de expresión y diversidad genética humana basada en 83 millones de nucleótidos de secuencia de ADNc". Naturaleza . 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID  7566098 .
• Ruppert S, Tjian R (1995). "Humano TAFII250 interactúa con RAP74: implicaciones para la iniciación de la ARN polimerasa II" . Genes Dev . 9 (22): 2747–55. doi : 10.1101 / gad.9.22.2747 . PMID  7590250 .
• Hisatake K, Ohta T, Takada R, Guermah M, Horikoshi M, Nakatani Y, Roeder RG (1995). "Conservación evolutiva de los factores asociados al polipéptido de unión a TATA humanos TAFII31 y TAFII80 e interacciones de TAFII80 con otros TAF y con factores de transcripción generales" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (18): 8195–9. Código Bibliográfico : 1995PNAS ... 92.8195H . doi : 10.1073 / pnas.92.18.8195 . PMC  41123 . PMID  7667268 .
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• Yonaha M, Aso T, Kobayashi Y, Vasavada H, Yasukochi Y, Weissman SM, Kitajima S (1993). "Estructura de dominio de un factor de iniciación de la transcripción general humana, TFIIF" . Ácidos nucleicos Res . 21 (2): 273–9. doi : 10.1093 / nar / 21.2.273 . PMC  309103 . PMID  8441635 .
• Aso T, Tsai P, Kawaguchi T, Menninger JC, Kitajima S, Yasukochi Y, Ward DC, Weissman SM (1993). "Asignación del gen GTF2F1 humano al cromosoma 19p13.3". Genómica . 16 (1): 252–3. doi : 10.1006 / geno.1993.1168 . PMID  8486367 .
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• Fang SM, Burton ZF (1996). "La proteína asociada a la ARN polimerasa II (RAP) 74 se une al factor de transcripción (TF) IIB y bloquea la unión de TFIIB-RAP30" . J. Biol. Chem . 271 (20): 11703–9. doi : 10.1074 / jbc.271.20.11703 . PMID  8662660 .
• McEwan IJ, Dahlman-Wright K, Ford J, Wright AP (1996). "Interacción funcional del dominio de transactivación c-Myc con la proteína de unión TATA: evidencia de un modelo de ajuste inducido de plegamiento del dominio de transactivación". Bioquímica . 35 (29): 9584–93. doi : 10.1021 / bi960793v . PMID  8755740 .
• Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: cofactor para la estimulación del alargamiento transcripcional por Tat del VIH-1". Ciencia . 274 (5287): 605–10. Código Bibliográfico : 1996Sci ... 274..605Z . doi : 10.1126 / science.274.5287.605 . PMID  8849451 . S2CID  13266489 .
• Parada CA, Roeder RG (1996). "Procesividad mejorada de la ARN polimerasa II desencadenada por la fosforilación inducida por Tat de su dominio carboxi-terminal". Naturaleza . 384 (6607): 375–8. Código Bibliográfico : 1996Natur.384..375P . doi : 10.1038 / 384375a0 . PMID  8934526 . S2CID  4278432 .
• Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). "El transactivador Tat del virus de la inmunodeficiencia humana interactúa con la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Mol. Celda. Biol . 17 (4): 1817–23. doi : 10.1128 / mcb.17.4.1817 . PMC  232028 . PMID  9121429 .
• Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (1997). "BRCA1 es un componente de la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605–10. Código Bibliográfico : 1997PNAS ... 94.5605S . doi : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC  20825 . PMID  9159119 .
• McEwan IJ, Gustafsson J (1997). "Interacción de la función de transactivación del receptor de andrógenos humanos con el factor de transcripción general TFIIF" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (16): 8485–90. Código Bibliográfico : 1997PNAS ... 94.8485M . doi : 10.1073 / pnas.94.16.8485 . PMC  22967 . PMID  9238003 .
• Newberry EP, Latifi T, Battaile JT, Towler DA (1997). "Análisis de estructura-función de la supresión transcripcional mediada por Msx2". Bioquímica . 36 (34): 10451–62. doi : 10.1021 / bi971008x . PMID  9265625 .
• O'Brien T, Tjian R (1998). "Análisis funcional del dominio quinasa N-terminal TAFII250 humano". Mol. Celular . 1 (6): 905-11. doi : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80089-1 . PMID  9660973 .

Enlaces externos

• GTF2F1 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
• FactorBook GTF2F1

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .