Nacido en Schwaz , en el Tirol , Scherer ingresó en la Compañía de Jesús en 1559. Incluso antes de su ordenación era famoso por sus poderes de predicación. Durante más de cuarenta años trabajó en el Archiducado de Austria . A Scherer, en parte, le debe la retención de la fe. En 1577 fue predicador de la corte del archiduque Matías ; mantuvo el cargo hasta 1600. En 1590 fue nombrado rector del Colegio de los Jesuitas en Viena ; La severidad de su carácter apenas le sirvió para el cargo, y fue trasladado (1594) a Linz.. La historia de su ciego en el púlpito, después de haber exclamado: "Si la Iglesia Católica no es la Iglesia Verdadera, que me quede ciego", es una pura invención.
Scherer era un hombre de una energía ilimitada y una fuerte fuerza de carácter, un enérgico controvertido, un orador y escritor genuinamente popular. Se opuso enérgicamente a los profesores de Tubinga que meditaban una unión con los cismáticos griegos, refutaban a teólogos luteranos como Osiander y Heerbrand y levantaban a sus compatriotas contra los turcos . Creyendo, como sus contemporáneos, que el Estado tenía el derecho de ejecutar a las brujas , sostuvo, sin embargo, que, dado que estaban poseídas, las principales armas utilizadas contra ellas debían ser espirituales, por ejemplo, exorcismos o rezos . La actitud severa de Scherer hacia la brujeríano contó con la aprobación de su general, Acquaviva . Su elocuencia y celo hicieron que muchos conversos, entre ellos el futuro cardenal Khlesl . Sus obras fueron recopiladas y publicadas por los premonstratenses de Bruck, Moravia (1599-1600), y nuevamente publicadas en Munich (1613-1614).
En 1583, Scherer participó en el único caso de quema de brujas en Viena. [1] Elise Plainacher, de 70 años, de Mank , Baja Austria , luterana, había criado a su nieta Anna Schlutterbauer desde que murió la madre de la niña. Cuando Anna tenía 17 años, su padre, el yerno católico de Elise, tomó la custodia y se mudó con Anna a St. Pölten.. Allí, la niña sufrió convulsiones, probablemente epilépticas, que fueron atribuidas a un maleficio colocado por su abuela. Anna y Elise fueron llevadas a Viena, donde Scherer llevó a cabo una rigurosa "investigación" (exorcismos combinados con interrogatorios) en la iglesia de Santa Bárbara en Fleischmarkt. En el transcurso de varios días, Scherer afirmó haber descubierto 12.652 demonios que habitaban el cuerpo y el espíritu de Anna. Por fin, la niña agotada y confundida estuvo de acuerdo en que su abuela la había hechizado. Elise fue llevada a la famosa Casa de los Pícaros ( Malefizhaus ) en el número 10 de Rauhensteingasse para ser interrogada bajo tortura. Su confesión final fue tan poco convincente que el alcalde de Viena apeló al emperador Rodolfo IIpara revocarlo, pero Scherer ejerció presión eclesiástica y el emperador declinó la petición. Elise Plainacher fue quemada en la hoguera y sus cenizas arrojadas al Danubio el 28 de septiembre de 1583.