GvpA es una proteína estructural de vesículas de gas que se encuentra en diferentes filas de bacterias y arqueas , por ejemplo, en Halobacterium salinarum o Haloferax mediterranei . Las vesículas de gas son estructuras proteicas pequeñas, huecas y llenas de gas que se encuentran en varios microorganismos cianobacterianos y arqueobacterianos. [1] Permiten el posicionamiento de las bacterias a una profundidad favorable para su crecimiento .
GvpA se asocia con GvpC para formar vesículas de gas, estructuras proteicas huecas que utilizan los organismos planctónicos para realizar la migración vertical. GvpA constituye la mayor parte de la estructura, como las llamadas "costillas", láminas β rígidas , mientras que GvpC estabiliza la vesícula contra el colapso mediante la reticulación como hélices α . [2] [3] [4]
La secuencia de GVPa está extremadamente bien conservada . Se ha encontrado que GvpJ y gvpM, dos proteínas codificadas en el grupo de genes necesarios para la síntesis de vesículas de gas en las arqueobacterias Halobacterium salinarium y Halobacterium mediterranei (Haloferax mediterranei), están relacionadas evolutivamente con GVPa . La función exacta de estas dos proteínas no se conoce, aunque podrían ser importantes para determinar las vesículas de gas de determinación de forma . El dominio N-terminal de Aphanizomenon flos-aquae la proteína gvpA/J también está relacionada con GVPa.
Las vesículas de gas son tubos cilíndricos huecos, cerrados por una tapa cónica hueca en cada extremo. Tanto las tapas cónicas de los extremos como el cilindro central están formados por nervaduras de 4-5 nm de ancho que se extienden en ángulo recto con el eje longitudinal de la estructura. Las vesículas de gas parecen estar constituidas por dos componentes proteicos diferentes, GVPa y GVPc. GVPa, una pequeña proteína de alrededor de 70 residuos de aminoácidos, es el componente principal de las vesículas de gas y forma el núcleo esencial de la estructura .