HLA-DQ8 ( DQ8 ) es un serotipo de antígeno leucocitario humano dentro del grupo de serotipos HLA-DQ (DQ). DQ8 es una fracción de antígeno de la DQ3 antígeno amplio . DQ8 se determina por el reconocimiento de anticuerpos de β 8 y esto generalmente detecta el producto génico del DQB1 * 0302 .
HLA-DQ8 ( MHC Clase II , antígeno de superficie celular DQ ) | |||
Representación de HLA-DQ8 con péptido de insulina inmundominante en el bolsillo de unión. | |||
Cis-haplotipo | Haplotipo | ||
isoforma | subtipo | DQA1 | DQB1 |
DQ α 3 β 8 | DQ8.1 | * 0301 | * 0302 |
DQ α 3 β 8 | DQ8.1v | * 0302 | * 0302 |
haplotipos raros | |||
DQ α 4 β 8 | DQ8.4 | * 0401 | * 0302 |
DQ α 5 β 8 | DQ8.5 | * 0503 | * 0302 |
DQ8 está comúnmente relacionado con enfermedades autoinmunes en la población humana. DQ8 es la segunda isoforma más predominante relacionada con la enfermedad celíaca y la DQ más relacionada con la diabetes tipo 1 . DQ8 aumenta el riesgo de artritis reumatoide y está relacionado con el principal locus de riesgo de AR, HLA-DR4 . DR4 también juega un papel importante en la diabetes tipo 1. Si bien el haplotipo DQ8.1 está asociado con la enfermedad, no existe una asociación conocida con los haplotipos DQB1 * 0305, DQ8.4 o DQ8.5 (ver cuadro de información) con enfermedad autoinmune; sin embargo, esto puede ser el resultado de la falta de estudios en las poblaciones que los portan y la muy baja frecuencia.
DQ8.1 también difiere de otros HLA en frecuencias poblacionales. Normalmente, para los antígenos del MHC de clase II en humanos, las frecuencias de haplotipos no superan el 40%. Por ejemplo, en los EE. UU. La frecuencia de haplotipos más alta, el haplotipo que codificó DQ6.2, es de alrededor del 15%, esto se traduce en frecuencias de fenotipo de menos del 30%. Atípicamente, las frecuencias de los haplotipos superan el 40%.
Para DQ8, las frecuencias de haplotipos más altas se acercan al 80% en partes de América Central y del Sur y las frecuencias de fenotipos se acercan al 90%. Esta es la frecuencia de fenotipo más alta observada para cualquier fenotipo DR o DQ en la población humana por un amplio margen.
Serología
DQB1 * | DQ8 | DQ3 | DQ7 | Muestra |
alelo | % | % | % | tamaño (N) |
* 0302 | 66 | 23 | 4 | 6687 |
* 0304 | 8 | 35 | 40 | 111 |
* 0305 | 34 | 30 | 70 | |
El rojo indica el nivel de reacción 'falsa' en los serotipos que no son DQ8 | ||||
Enlace de alelos a IMGT / HLA Databease en EBI |
frecuencia | ||
árbitro. | Población | (%) |
[2] | Mayas de Guatemala | 48,1 |
México N.Leon Mestizos | 22,5 | |
Estados Unidos Hispanos del Sur de Texas | 20,6 | |
Suecia | 18,7 | |
Rusia Siberia Negidal | 18,6 | |
Rusia Murmansk Saomi | 18,5 | |
Jordania Amman | 17,8 | |
Samoa | 17.2 | |
Inglaterra Caucasoide | 16,4 | |
Finlandia | 15,7 | |
Francia | 14,5 | |
Japón Central | 10,8 | |
Grecia Creta | 9.2 | |
España Vasco Valle de Arratia | 6,7 | |
Argelia Orán | 6.6 | |
China Beijing y Xian | 6.1 | |
Etiopía Amhara | 5,6 | |
EE. UU. SE Afroamericano | 4.9 | |
Estados Unidos Alaska Nativos Yupik | 3.8 | |
Hindúes del norte de la India | 3,0 | |
Zimbabue Harare Shona | 2.2 | |
Rusia Siberia Esquimales | 0,9 | |
Rwanda Kigali Hutu y Tutsi | 0,5 | |
Goroka De Las Tierras Altas Orientales PNG | 0.0 | |
Túnez Jerba Berber | 0.0 |
Aunque la falsa reacción con DQB1 * 0302 es baja, la eficacia de la reacción positiva no es buena y existe el riesgo de una falsa detección de DQB1 * 0305 que podría crear incompatibilidad. Para el diagnóstico y la confirmación de la enfermedad, no existe una asociación conocida de DQB1 * 0305 con diabetes celíaca o autoinmune. Por lo tanto, es prudente utilizar la escritura DQB1 de alta resolución para DQ8.
Alelos
DQ | DQ | DQ | Frec | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Serotipo | isoforma cis | Subtipo | A1 | B1 | % [3] | rango | ||
DQ8 | α 3 - β 8 | 8.1 | 0301 | 0302 | 9. | 62 | Sexto | |
0302 ♠ | 0302 | 0. | 93 | |||||
♠ DQA1 * 0302 y * 0303 no resueltos |
DQ8 está determinada por el reconocimiento de anticuerpos de β 8 y se complica por el hecho de que DQ8 reconoce bien, parcialmente o nada bien algunas isoformas codificadas por HLA-DQB1 * 03 (Ver serología ) DQ β 3.2 y β 3.5 se reconocen mejor como DQ8 . Estos antígenos divididos son los productos alélicos de DQB1 * 0302 y DQB1 * 0305 , respectivamente.
DQB1 * 0302
frecuencia | ||
árbitro. | Población | (%) |
[2] | Líbano Kafar Zubian | 5.9 |
Líbano Niha el Shouff | 2.5 | |
Lakota Sioux | 2.1 | |
Túnez | 2.0 | |
Líbano Yuhmur | 1.8 | |
Mayas de Guatemala | 1,5 | |
Marruecos | 1.0 | |
Pakistán | 1.0 | |
Arabia Saudita Guraiat y granizo | 0,8 | |
China Lijiang Naxi | 0,7 | |
Rusia Chuvash | 0,6 | |
Túnez Matmata Bereber | 0,6 | |
República Checa | 0,5 | |
India Delhi | 0,5 |
DQB1 * 0302 y se encuentra con mayor frecuencia en el haplotipo DQA1 * 0301 : DQB1 * 0302 , aproximadamente el 10% de las veces se encuentra en el haplotipo DQA1 * 0302 : DQB1 * 0302 . DQB1 * 0302 casi siempre están vinculados a DR4, DRB1 * 0401 , * 0402 y * 0404 en caucásicos. El primer y tercer DRB1 están más fuertemente asociados con la artritis reumatoide.
DQB1 * 0305
El producto del gen DQB1 * 0305 reacciona un poco más intensamente con DQ8 que con DQ7, es generalmente raro en Europa y América del Norte, excepto en unas pocas poblaciones indígenas. Los niveles de DQB1 * 0305 son probablemente más altos dado que las pruebas anteriores no discriminaban bien entre diferentes * 03.
Haplotipos
DQ8 β-cadenas se combinan con alfa-cadenas, codificadas por enlaces genéticamente HLA-DQA1 alelos, para formar los cis - haplotipo isoformas. Solo hay una isoforma cis común de DQ8 porque los alelos DQA1 * 03 ligados (2) ocurren en la mayoría de la población, DQ8.1 es la isoforma cis abrumadoramente mayoritaria de DQ8. Un haplotipo raro DQA1 * 0503 : DQB1 * 0302 se detecta por debajo del 1% de todos los haplotipos DQ8 en Asia y Mesoamérica. Otro haplotipo más raro, DQA1 * 0401 : DQB1 * 0302
DQ8.1
Referencia | DQA1 | DQB1 | Estimado | |
---|---|---|---|---|
Población | * 03 | * 0302 | DQ8.1 | |
[4] | Maya Lacandona (México) | 79,0 | 77,9 | 77,9 |
[5] | Perija-Yucpa (Venezuela) | 74,0 | 75,0 | 74,9 |
[6] | Maya (Guatemala) | 48,1 | 47,6 | |
[7] | Mazatecos (México) | 48,5 | 48,5 | 47,5 |
[8] | Lamas (Perú) | 45,2 | 44,7 | |
[9] | Dakota Sioux (Dakota del Sur) | 52,1 | 45,0 | 44,5 |
[10] | Mixteco (Oaxaca, México) | 40,0 | 35,9 | 35,4 |
[11] | Lakota Sioux (Dakota del Sur) | 25,7 | 25,5 | |
[12] | Terena (Brasil) | 17,5 | 17.0 | |
[13] | Cauc., San Antonio (Estados Unidos) | 11,7 | 11,7 | |
[14] | Caucásico (EE. UU.) | 18,5 | 10,5 | 10,5 |
[15] | Afroamericano (SE. EE. UU.) | 4.9 | 4.5 | |
[dieciséis] | Tlinglet (Alaska, Estados Unidos) | 14.0 | 8.5 | 8.5 |
[17] | Esquimal (Alaska, EE. UU.) | 3.8 | 3.8 | |
[18] | Canoncito Navajo (Nuevo México, EE. UU.) | 6.3 | 3,5 | 3,5 |
[19] | Esquimal (E. Groenlandia) | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
DQA1 * 0301 : DQB1 * 0302 (DQ8.1) es el subtipo DQ8 más común y representa más del 98% de la población de rodamientos DQ8. Con poca frecuencia, DQA1 * 0302 : DQB1 * 0302 , pero esta sustitución de la cadena alfa, DQA1 * * 0301 versus * 0302 , está fuera de la hendidura de unión y parece no alterar la función de DQ8. DQ8.1 se encuentra casi en todas partes en todas las poblaciones regionales humanas, pero debido a su distribución única se convierte en un objeto de antropología molecular. Hay 3 lugares donde la frecuencia de haplotipos es elevada, Centroamérica y Sudamérica, NE del Pacífico y Norte de Europa.
Altas frecuencias en las Américas
El nodo global para DQ8 se encuentra en América Central y el norte de América del Sur, donde alcanza la frecuencia más alta para cualquier serotipo DQ, cerca del 90% de la frecuencia del fenotipo (77% de la frecuencia del haplotipo), y tiene una frecuencia relativamente alta en la población indígena de América del Norte. y las regiones costeras del Golfo de México y hasta el Valle de Mississippi. La alta frecuencia de DQ8 en las regiones del noreste de América del Sur [5] y la baja frecuencia en los indígenas americanos de ascendencia asiática más reciente [16] [19] o de origen siberiano [20] sugieren que DQ8 fue de alta frecuencia en los primeros amerindios. El patrón de distribución es consistente con resultados recientes de ADNmt que sugieren que los primeros migrantes al Nuevo Mundo se establecieron en las regiones costeras de las tierras bajas, los valles de los ríos y se movieron lentamente hacia el interior, los colonos posteriores se mudaron a las regiones de las tierras altas. DQ8 y DQ2.5 tienen muchas similitudes funcionales análogas, y este primer sesgo de colono puede ser una razón para la similitud. Los estudios sobre el virus de Epstein Barr [21] y otras proteínas sugieren que ambas proteínas son presentadoras de péptidos ácidos (es decir, péptidos con carga negativa aumentada) (ver DQ8 para una ilustración del proceso de presentación) y pueden haber sido adaptables para ciertos estilos de vida de caza y recolección, posiblemente recolectores costeros.
Referencia | DQA1 | DQB1 | Estimado | |
---|---|---|---|---|
Población | * 03 | * 0302 | DQ8.1 | |
[20] | Nivkhi (NNE. Sakalin I.) | 0.0 | 0 | |
[22] | Zorastra, Yadz (Irán) | 20,8 | 0,8 | 0,8 |
[23] | Khoton (Mongolia) | 24,4 | 1.2 | 1.2 |
[24] | Madang (Papua Nueva Guinea) | 1,5 | 1,5 | 1,5 |
[25] | Yao (China) | 2.6 | 2.6 | |
[26] | Naxi (Lijiang, China) | 2,7 | 2,7 | |
[27] | Ainu (Japón) | 3,0 | 3,0 | |
[28] | Shandong Han (China) | 3.1 | 3.1 | |
[29] | Khalkha (Mongolia) | 22,3 | 6.1 | 6.1 |
[30] | Tailandeses | 21,5 | 7.4 | 7.4 |
[31] | Ket, Yenisey (Siberia) | 14,7 | 8.4 | 8.4 |
[32] | Corea del Sur | 10,3 | 10,3 | |
[33] | japonés | 10,8 | 10,8 | |
[34] | Nganasan (Siberia) | 39,6 | 11,4 | 11,4 |
[35] | Uygars, Ürümqi (China) | 21,9 | 11,4 | 11,4 |
[36] | Kazajo | 11,4 | 11,4 | |
[37] | Negidal (Siberia) | 50,0 | 18,6 | 18,6 |
[38] | Cook Isl. (Pacífico) | 25,0 | 25,0 |
Abundancia en Asia
Hiato de DQ8 en el noreste del Ártico siberiano, niveles elevados en la región de Amur y los turcos orientales
Los niveles de DQ8 en SW a West Pacific Rim están en frecuencias de haplotipos variables, de 2 a 30%, y se estabilizan alrededor del 10% para Ryūkyūan, japoneses, coreanos, Regiones de Amur y en el NW Pacific Rim caen a menos del 1% en el Nivkhi. Hay una pausa moderna de DQ8 en la región de Alaska-Siberia Oriental y no está claro si esto se debe al reemplazo, la selección o el modo en que llegaron los primeros estadounidenses (es decir, ruta estrictamente marítima). Los tipos de DR asociados con DQ8 son DRB1 * 0403, * 0404, * 0406, * 0407, * 0408 y * 0401 se divide entre muchos haplotipos DQA1: B1. DQB1 * 0405 se asocia comúnmente con DQA1 * 0303: DQB1 * 04 y, por lo tanto, no se incluye en DRB1 * 0401 en evaluaciones de alta resolución. El DQ8 de las Islas Cook tenía solo un haplotipo DR asociado, lo que sugiere que la diversidad limita la introducción en la región, ya sea a través de la ruta TW- (Japón / Corea / China) o por el oeste, por ejemplo, los Bunun tienen un DRB1 * 0403 alto. La mayoría de DRB1 * 04 parece haberse redistribuido desde el este de Asia de una fuente desconocida, posiblemente en Asia central o India. La distribución se puede comparar con grupos nativos como los sudamericanos. Tres grupos con niveles altos, Kogui, Sikuni y Yucpa, tienen aproximadamente un 75% de DQ8, el alelo DRB1 * dominante en 2 de 3 es el * 0411 (N. China = 0), pero * 0407 (Ryūkyū, japonés, Mansi -Ural Oriental, Chino Naxi) y * 0403 (Nganasan, Buryat, Negidal, Tunisians, Ryūkyū, Korea, Ainu) también se encuentran. En Norteamérica, DRB1 * 0404 y * 0407 son más comunes que * 0403 y, en Lakota Sioux, B1 * 0411 es raro. El haplotipo DRB1 * 0404-DQ8 es más común en el noroeste de Asia y el norte de Europa.
Referencia | DQA1 | DQB1 | Estimado | |
---|---|---|---|---|
Población | * 03 | * 0302 | DQ8.1 | |
[39] | Nenets (norte de Rusia) | 40,9 | 20,9 | 20,0 |
[40] | Murmansk Saomi (Rusia) | 38,3 | 18,5 | 17.2 |
[41] | Arkhange Pomors (Rusia) | 22,6 | 17.1 | 16,4 |
[42] | sueco | 24,2 | 18,7 | 16,1 |
[43] | Caucásico (Inglaterra) | 23,7 | 16,4 | 15,9 |
[44] | Finlandia | 15,7 | 15,2 | |
[45] | CEPH de Francia | 21,3 | 14,5 | 13,5 |
[46] | danés | 20,9 | 13,2 | 13,2 |
[47] | holandés | 11,2 | 11,0 | |
irlandesa | 10,6 | |||
[48] | Noroeste eslavo (Rusia) | 16,0 | 11,0 | 10,5 |
[49] | alemán | 10,5 | 9,9 | |
[50] | ruso | 8,9 | 7.2 | |
[51] | Cantabarian (España) | 19,3 | 8.4 | 7.0 |
[49] | Español | 8,9 | 6.5 | |
[49] | sardo | 4.9 | 4.9 | |
[49] | italiano | 4.6 | 4.5 | |
[52] | Emiratos Árabes Unidos | 0,83 | 0,8 | |
[53] | Jordán | 24,1 | 17,9 | 17,9 |
África | ||||
[49] | ! Kung | 36,7 | 36,7 | |
[49] | Khoi | 14,9 | 13,9 | |
[54] | Oromo | 17,5 | 9.0 | 9.0 |
[55] | Marruecos | 17.2 | 8,9 | 8,6 |
[56] | Túnez | 10.31 | 10.0 | 8.0 |
[54] | Amhara | 11,2 | 5,6 | 5,6 |
[57] | Aka pigmeos | 3.2 | 3,0 | |
[49] | Negroide (África del Norte) | 3.1 | 2,7 | |
[58] | Cameron | 11,5 | 1,5 | 1.2 |
[57] | Congo bantú | 0,6 | 0,5 | |
[59] | Gabonés | 7.5 | 0,5 | |
[60] | Bubi | 17,5 | 0.0 | 0.0 |
Altos niveles de DQ8 en el norte de Europa
DQ8 también es abundante en el norte de Europa y se encuentra con alta frecuencia en la población germano-escandinava-urálica al norte de Suiza. Los haplotipos HLA AB sugieren que una migración de personas al este de los Urales es responsable de DQ8, posiblemente desde el este hasta el borde del Pacífico occidental. El alto nivel de DQ8 y DQ2.5 es algo de gran interés para las enfermedades mediadas por DQ de Escandinavia y el norte de Europa. DQ8 también se encuentra en Iberia y los lugares donde el flujo de genes de este a oeste por otros marcadores genéticos no se puede corroborar, y los niveles dentro de la población africana o del Medio Oriente son posibles fuentes, Iberia tiene un considerable equilibrio A1 / B1 que sugiere fuentes independientes de África.
Difusión global de DQ8
DQ8 junto con algunos otros haplotipos parece estar dividido NW / SE en Eurasia y con la evidencia de DQ2.5 y otros haplotipos sugieren que una antigua población de Asia Central fue desplazada por una migración africana más reciente. Hay muchos marcadores comunes que se encuentran en Francia, alemanes, daneses, suecos, tibetanos, el río Amur, japoneses y coreanos que son indicadores potenciales de esta propagación bilateral. Los haplotipos DQ8 se encuentran en altas frecuencias en el ! Kung , aunque uno espera más DQ8 en Austronesia, se extiende de manera ubicua si en algunos momentos son bajas, otras veces con frecuencias más altas (tailandés). El camino de la propagación del DQ8 al Nuevo Mundo es enigmático, ciertamente Japón y el río Amur son fuentes potentes, pero no se pueden descartar otras poblaciones desplazadas. Si el modo de viaje fue a través del corredor de Beringia como lo propuso el arqueólogo, la muy baja frecuencia de DQ8 en la actualidad es un hallazgo muy inusual con respecto a la evidencia de un desplazamiento completo en otras partes del mundo. Los marcadores que se comparten entre los japoneses, los aborígenes TW tienden a disminuir en frecuencia a medida que uno se acerca a Siberia, los marcadores de ADNmt disminuyen en la cadena Kuril. Durante el período Jōmon de Japón, parece que habría habido un desplazamiento de los antepasados Ninhvet / Ainu y la depresión de DQ8 en todo el norte de Japón, pero el declive en toda la región es algo inexplicable fuera de un evento climático catastrófico entre el asentamiento del Nuevo Mundo y el tiempo actual.
Un modelo alternativo es que había múltiples fuentes de DQ8 en la población del NE de Asia, algunas fuentes eran de Asia central y otras de la región indochina, algunas de las DQ8 encontradas en el noroeste de Eurasia podrían ser de una mezcla de la Cuenca del Pacífico Occidental y Central De origen asiático, y fueron desplazados de las regiones más centrales pero no de las regiones más orientales.
DQ8 y selección
Al igual que DQ2.5, DQ8 podría haber sido seleccionado para pueblos de forrajeo marítimo, costero y en particular para pueblos adaptados a la situación del clima / hábitat en el extremo norte del borde habitable del Pacífico occidental en el Último Máximo Glacial. El cultivo de Triticeae puede aplicar una selección negativa en DQ8. Si bien había numerosos miembros de especies de Triticeae similares a las Triticeae silvestres del Medio Oriente en las Américas, y un gran número de plantas domesticadas en el nuevo mundo, ninguna especie de Triticeae parece haber sido domesticada en el Nuevo Mundo, y no hay ejemplos claros. en tribus de gramíneas estrechamente relacionadas. Entre las especies de gramíneas del nuevo mundo en la época poscolombina, una especie de Elymus ha sido domesticada para el consumo humano y otra como cultivo pastoral. Esto podría interpretarse de dos formas. Primero, que los niveles de DQ8 inhibieron negativamente la domesticación de las cepas de Triticeae . En segundo lugar, que la ausencia de tales cultivares más adecuados que los cultivares ya desarrollados permitió que DQ8 aumentara o se mantuviera alto, mientras que los niveles de DQ2.5 en NW bajo una selección a mucho más largo plazo han disminuido, o un poco de ambos. La mayoría de los cultivares estadounidenses fueron domesticados al sur del Río Grande (las excepciones son el arroz Caddo y la calabaza varigada de Texas, etc.). El trigo, en particular la cebada y el centeno, son cultivares preferenciales en climas más fríos, mientras que Zea es más adaptable en climas tropicales y algunos cultivares son relativamente tolerantes a la sequía; sin embargo , Zea carece de ciertos aminoácidos que deben complementarse con otros alimentos para prevenir la desnutrición. La proximidad de la neolitización al Ecuador en el Nuevo Mundo puede tener mucho que ver con la selección negativa no aparente de DQ8 en relación con la neolitización de Eurasia Occidental.
DQ8 y enfermedad
En Europa , DQ8 está asociado con la diabetes tipo 1 y la enfermedad celíaca (también conocida como enfermedad celíaca). El factor de riesgo más alto para la diabetes tipo 1 es el fenotipo HLA DQ8 / DQ2.5. En partes del este de Escandinavia, tanto el DQ2.5 como el DQ8 tienen altas frecuencias de diabetes Tipo I de aparición tardía y diabetes Tipo I / II ambigua. DQ8 también se encuentra en muchos pueblos indígenas de Asia , se detectó temprano en la población de Bedoin de Arabia, donde DQ2.5 está ausente con frecuencia, y en estos casos, DQ8 es el único HLA asociado en la enfermedad celíaca.
En los Estados Unidos , sin embargo, parece haber un cambio en el riesgo de enfermedad autoinmune para los inmigrantes de México. El aumento de la inmunorreactividad de los hispanos en Houston parece estar asociado con DR4-DQ8. El haplotipo puede incurrir en el mayor riesgo de artritis reumatoide.
En Japón, DQ3 (DQ7, DQ8, DQ9) se asocia con miastenia gravis en la población femenina de inicio temprano, aunque no parece que DQ8 tenga el papel más importante, existen similitudes entre la miastenia gravis en Japón y la detectada en la población hispana de Houston. con DQ8 asociado con mujeres más jóvenes en relación con las asociaciones de todos los demás tipos de HLA DQ. La enfermedad celíaca está aumentando en Japón, y está claro que los cambios en la dieta son la razón, pero tampoco hay DQ2.5 en Japón, mientras que los niveles de DQ8 son moderados.
El enlace DR4
Muchas enfermedades asociadas con DQ8 tienen un enlace dual con DR4, y ciertas DR4 (* 0405) tienen una asociación de riesgo independiente y dependiente con DQ8, por ejemplo, con diabetes tipo 1. [61] [62]
Referencias
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enlaces externos
Enfermedad celíaca
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- La Fundación de la Enfermedad Celíaca (EE. UU.)
- The Celiac Sprue Association (EE. UU.)
- Centro Nacional de Información sobre Enfermedades Digestivas - página sobre la enfermedad celíaca
- Fundación Nacional para la Conciencia Celíaca (EE. UU.)
- Centro de Investigación Celíaca de la Universidad de Maryland
Diabetes tipo 1
- Niños con diabetes
- Diabetes tipo 1 en la Asociación Americana de Diabetes