Hafniaceae
| Hafniaceae | |
|---|---|
clasificación cientifica  | |
| Dominio: | Bacterias |
| Filo: | Proteobacterias |
| Clase: | Gammaproteobacteria |
| Pedido: | Enterobacterales |
| Familia: | Hafniaceae Adeolu et al., 2016 |
| Genera | |
Las Hafniaceae son una familia de bacterias Gram negativas . Esta familia es miembro del orden Enterobacterales en la clase Gammaproteobacteria del filo Proteobacteria . Los géneros de esta familia incluyen el género tipo Hafnia , junto con Edwardsiella y Obesumbacterium . [1]
El nombre Hafniaceae se deriva del término latino Hafnia , refiriéndose al género tipo de la familia y al sufijo "-aceae", una terminación utilizada para denotar una familia. En conjunto, Hafniaceae se refiere a una familia cuyo tipo nomenclatural es el género Hafnia . [1]
Características bioquímicas y firmas moleculares [1]
Los miembros son catalasa positivos, oxidasa negativos y negativos para lisina descarboxilasa. Estas bacterias también pueden crecer en medios MacConkey y son capaces de reducir el nitrato.
Se identificaron cuatro indeles de firma conservados (CSI) para esta familia en las proteínas regulador de respuesta del sistema de dos componentes GIrR, glucosa-1-fosfato adenililtransferasa , activador transcripcional NhaR y el sensor híbrido histidina quinasa / regulador de respuesta. [1] Estas firmas moleculares se identificaron mediante análisis genómicos y sirven como un medio molecular confiable para distinguir a los miembros de esta familia de otras familias dentro del orden Enterobacterales y todas las demás bacterias.
Sistemática histórica y taxonomía actual
Hafniaceae , a partir de 2021, contiene tres géneros válidamente publicados. [2] Los miembros de esta familia eran originalmente miembros de la familia Enterobacteriaceae , un gran grupo de especies no relacionadas filogenéticamente con distintas características bioquímicas y diferentes nichos ecológicos. La asignación original de especies a la familia Enterobacteriaceae se basó en gran medida en los análisis de la secuencia del genoma del ARNr 16S, que se sabe que tiene un bajo poder discriminatorio y cuyos resultados dependen del algoritmo y la información del organismo utilizado. A pesar de esto, los análisis todavía mostraron ramificaciones polifiléticas, lo que indica la presencia de distintos subgrupos dentro de la familia. [3]
En 2016, Adeolu et al. propuso la división de Enterobacteriaceae en 7 nuevas familias basadas en análisis genómicos comparativos y el patrón de ramificación de varios árboles filogenéticos construidos a partir de secuencias de genoma conservadas, secuencias de rRNA 16S y análisis de secuencias multilocus. Los marcadores moleculares, indeles de firma específicamente conservados , específicos de esta familia también se identificaron como evidencia que apoya la división independiente de los árboles filogenéticos. [1]
Referencias
- ↑ a b c d e Adeolu, M .; et al. (2016). "Filogenia y taxonomía basadas en el genoma de las 'Enterobacteriales': propuesta para Enterobacterales ord. Nov. Dividida en las familias Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. Nov., Pectobacteriaceae fam. Nov., Yersiniaceae fam. Nov., Hafniaceae fam. Nov., Morganellaceae fam. nov. y Budviciaceae fam. nov ". En t. J. Syst. Evol. Microbiol .
- ^ "Familia: Hafniaceae" . lpsn.dsmz.de . Consultado el 5 de junio de 2021 .
- ^ Francino, M. Pilar; Santos, Scott R .; Ochman, Howard (2006), "Relaciones filogenéticas de bacterias con especial referencia a endosimbiontes y especies entéricas" , The Prokaryotes , Nueva York, NY: Springer New York, págs. 41–59, ISBN 978-0-387-25496-8, consultado el 2 de junio de 2021
Hafniaceae
- Enterobacterales
- Bacterias Gram-negativo
- Talones de enterobacterales
