IFT140


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IFT140 , homólogo del transporte intraflagelar 140 , es una proteína que en humanos está codificada por el gen IFT140 . El producto génico forma un componente central del complejo IFT-A que no es susceptible de transporte intraflagelar retrógrado dentro del cilio primario . [5]

Significación clínica

Las mutaciones en este gen se han asociado a casos de ciliopatía esquelética denominada síndrome de Mainzer Saldino, caracterizada por anomalías del desarrollo esquelético, degeneración de la retina y una enfermedad renal fibroquística conocida como nefronoptisis . [6] [7] [8] También se ha descrito en pacientes con síndrome de Jeune [9] y amaurosis congénita de Lebers aislada en ausencia de otras características sindrómicas. [10]

Organismos modelo

Se han utilizado organismos modelo en el estudio de la función de IFT140. Una línea de ratón knockout condicional llamada Ift140 tm1a (KOMP) Wtsi se generó en el Wellcome Trust Sanger Institute . [11] Los animales machos y hembras se sometieron a un cribado fenotípico estandarizado [12] para determinar los efectos de la deleción. [13] [14] [15] [16] Pruebas adicionales realizadas: - Fenotipado inmunológico en profundidad [17]

Se generó un ratón derivado de ENU ( cauli ) que portaba alelos IFT140 homocigotos (c.2564T> A, p. I855K) en el Murdoch Children's Research Institute en Melbourne, Australia. [9] El ratón cauli presentó letalidad a mitad de la gestación, exencefalia, espina bífida, dismorfismo craneofacial, anomalías digitales, anomalías cardíacas y defectos de patrón de somitas. [9] La señalización del erizo ectópico se demostró mediante la hibridación in situ total en las yemas de las extremidades y la morfología anormal del cilio primario dentro de la yema de las extremidades se demostró mediante microscopía electrónica de barrido. [9]

Un paciente con síndrome de Mainzer Saldino que portaba variantes heterocigotas compuestas en IFT140 había inducido a reprogramar células madre pluripotentes y corregir el gen CRISPR antes de diferenciar ambas líneas de células madre en organoides renales para la comparación transcripcional. [8] Además de validar la morfología en forma de maza de los cilios primarios que se observan en la yema de la extremidad del ratón cauli dentro de los túbulos de nefrona regenerados de los organoides IFT140 c.634G> A / c.2176C> G en comparación con el IFT140 WT / c.2176C > G, la comparación de secuenciación de ARN a granel demostró diferencias significativas en las vías de genes relacionadas con la polaridad apicobasal, las uniones célula-célula y el ensamblaje de dineína axonemal. [8]

Referencias

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000187535 - Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024169 - Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Stepanek, Ludek; Pigino, Gaia (6 de mayo de 2016). "Los dobletes de microtúbulos son vías férreas de doble vía para trenes de transporte intraflagelar". Ciencia . 352 (6286): 721–724. doi : 10.1126 / science.aaf4594 . ISSN 1095-9203 . PMID 27151870 . S2CID 206648246 .   
  6. ^ Schmidts M, Frank V, Eisenberger T, Al Turki S, Bizet AA, Antony D, Rix S, Decker C, Bachmann N, Bald M, Vinke T, Toenshoff B, Di Donato N, Neuhann T, Hartley JL, Maher ER , Bogdanović R, Peco-Antić A, Mache C, Hurles ME, Joksić I, Guć-Šćekić M, Dobricic J, Brankovic-Magic M, Bolz HJ, Pazour GJ, Beales PL, Scambler PJ, Saunier S, Mitchison HM, Bergmann C (mayo de 2013). "Los enfoques combinados de NGS identifican mutaciones en el gen de transporte intraflagelar IFT140 en ciliopatías esqueléticas con enfermedad renal progresiva temprana" . Mutación humana . 34 (5): 714–24. doi : 10.1002 / humu.22294 . PMC 4226634 . PMID 23418020 .  
  7. ^ Perrault, Isabelle; Saunier, Sophie; Hanein, Sylvain; Filhol, Emilie; Bizet, Albane A .; Collins, Felicity; Salih, Mustafa AM; Gerber, Sylvie; Delphin, Nathalie (4 de mayo de 2012). "El síndrome de Mainzer-Saldino es una ciliopatía causada por mutaciones IFT140" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 90 (5): 864–870. doi : 10.1016 / j.ajhg.2012.03.006 . ISSN 1537-6605 . PMC 3376548 . PMID 22503633 .   
  8. ^ a b c Forbes, Thomas A .; Howden, Sara E .; Lawlor, Kynan; Phipson, Belinda; Maksimovic, Jovana; Hale, Lorna; Wilson, Sean; Quinlan, Catherine; Ho, Gladys (3 de mayo de 2018). "Los organoides de riñón derivados de iPSC del paciente muestran la validación funcional de un fenotipo renal ciliopático y revelan los mecanismos patogénicos subyacentes" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 102 (5): 816–831. doi : 10.1016 / j.ajhg.2018.03.014 . ISSN 0002-9297 . PMC 5986969 . PMID 29706353 .   
  9. ^ a b c d Miller, Kerry A .; Ah-Cann, Casey J .; Bienestar, Megan F .; Tan, Tiong Y .; Papa, Kate; Caruana, Georgina; Freckmann, Mary-Louise; Savarirayan, Ravi; Bertram, John F. (agosto de 2013). "Cauli: una cepa de ratón con una mutación Ift140 que da como resultado un síndrome de Jeune de modelado de ciliopatía esquelética" . PLOS Genetics . 9 (8): e1003746. doi : 10.1371 / journal.pgen.1003746 . ISSN 1553-7404 . PMC 3757063 . PMID 24009529 .   
  10. ^ Beals, Rodney K .; Weleber, Richard G. (2007). "Displasia conorrenal: síndrome de epífisis en forma de cono, enfermedad renal en la infancia, retinitis pigmentosa y anomalía del fémur proximal". American Journal of Medical Genetics Parte A . 143A (20): 2444–2447. doi : 10.1002 / ajmg.a.31948 . ISSN 1552-4833 . PMID 17853467 . S2CID 32559930 .   
  11. ^ Gerdin AK (2010). "El programa de genética del ratón Sanger: caracterización de alto rendimiento de ratones knockout". Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. doi : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 . 
  12. ^ a b "Consorcio internacional de fenotipado de ratones" .
  13. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (junio de 2011). "Un recurso de knockout condicional para el estudio de todo el genoma de la función del gen del ratón" . Naturaleza . 474 (7351): 337–42. doi : 10.1038 / nature10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .  
  14. ^ Dolgin E (junio de 2011). "Biblioteca de mouse configurada para ser eliminada" . Naturaleza . 474 (7351): 262–3. doi : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 . 
  15. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (enero de 2007). "Un ratón por todas las razones" . Celular . 128 (1): 9-13. doi : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .  
  16. ^ Blanco JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (julio de 2013). "La generación de todo el genoma y el fenotipado sistemático de ratones knockout revela nuevos roles para muchos genes" . Celular . 154 (2): 452–64. doi : 10.1016 / j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207 . PMID 23870131 .  
  17. ^ a b "Consorcio de inmunofenotipificación (3i) de infecciones e inmunidad" .


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