En la historia de la iglesia galesa e inglesa, los independientes defendieron el control congregacional local de los asuntos religiosos y eclesiásticos, sin ninguna jerarquía geográfica más amplia, ya sea eclesiástica o política. Los independientes alcanzaron una prominencia particular entre 1642 y 1660, en el período de la Guerra Civil Inglesa y de la Commonwealth y el Protectorado , en el que el Ejército Parlamentario se convirtió en el campeón de los puntos de vista religiosos independientes contra el anglicanismo o el laudianismo de los monárquicos y el presbiterianismo favorecido por el Parlamento .sí mismo. Los independientes defendieron la libertad de religión para los no católicos.
Durante la Primera Guerra Civil , la causa parlamentaria fue apoyada por una alianza de anglicanos que apoyaban las tradiciones parlamentarias, presbiterianos e independientes. Durante el período previo a la guerra y durante sus primeros años, el partido presbiteriano bajo el liderazgo de John Pym estaba en ascenso. Sin embargo, como se demostró en el resultado de las negociaciones para una alianza con los presbiterianos escoceses sobre la Liga Solemne y el Pacto en 1643, el partido Independiente fue lo suficientemente fuerte como para evitar que se les impusiera el presbiterianismo.
Después de la formación del New Model Army, la fuerza de los Independientes creció junto con la fortuna del Ejército porque los Independientes ocuparon muchos de los puestos principales dentro del Ejército ( Oliver Cromwell es el más famoso de ellos). En 1648, al final de la Segunda Guerra Civil, los Independientes en el Ejército fueron lo suficientemente fuertes como para sacar del Parlamento a todos aquellos que se oponían a ellos en lo que se conoce como la Purga del Orgullo .
Después de Pride's Purge , el llamado Parlamento Rump de alrededor de cincuenta diputados independientes sancionó el juicio y la ejecución del rey Carlos I en enero de 1649 y la creación de la Commonwealth inglesa republicana.
Los independientes dominaron la política inglesa durante la década siguiente, hasta poco antes de la Restauración .
Después de la Restauración, el Parlamento inglés estuvo dominado por los anglicanos, partidarios tanto de la causa parlamentaria como de la realista, que impusieron el Código Clarendon . Combinado con la Ley de prueba , esto excluyó a todos los inconformistas de ocupar cargos civiles o militares, y les impidió obtener títulos de las universidades de Cambridge y Oxford .