Michael Gribskov es profesor de Ciencias Biológicas e Informática en la Universidad de Purdue . En 1979, Gribskov se graduó de la Universidad Estatal de Oregon , con una licenciatura en Ciencias con honores en Bioquímica y Biofísica. Más tarde, en 1985, terminó su doctorado en Biología Molecular de la Universidad de Wisconsin – Madison . [1]
Se ha desempeñado como presidente de la Sociedad Internacional de Biología Computacional , [2] y su página de la facultad indica que es el presidente de la Junta Asesora y Supervisión Científica de Recursos de Información de Proteínas , y en los consejos editoriales de las revistas Bioinformatics , Journal of Computational Biología y Química y Revista de Microbiología y Biotecnología Molecular . [1]
| Año | Posición |
|---|---|
| 1979 | Licenciatura con honores en bioquímica y biofísica de la Universidad Estatal de Oregon |
| 1979-1984 | Beca de formación predoctoral de los NIH University of Wisconsin-Madison |
| 1985 | Doctor. en Biología Molecular Universidad de Wisconsin-Madison |
| 1985-1987 | Beca de posdoctorado de la American Cancer Society University of California - Los Ángeles |
| 1988–1992 | Instituto Nacional del Cáncer Científico Asociado — FCRDC |
| 1992 | Científico del personal San Diego Supercomputer Center |
| 1993–1996 | Científico senior del Centro de Supercomputación de San Diego |
| 1993–1999 | Profesor adjunto adjunto de Biología Universidad de California, San Diego |
| 1994-1997 | Consultas estructurales del investigador principal sobre bases de datos de ácidos nucleicos |
| 1999-2003 | Profesor adjunto adjunto de biología de la Universidad de California, San Diego |
| 2004-presente | Profesor de Ciencias Biológicas y Ciencias de la Computación Purdue University |
Análisis de perfil
Gribskov, junto con David Eisenberg y Andrew McLachlan, introdujeron el método de análisis de perfiles en 1987; este es un método para detectar proteínas relacionadas lejanamente mediante comparación de secuencias. Un perfil es una matriz de puntuación específica de la posición y se crea a partir de un grupo de secuencias previamente alineadas (sonda). La similitud de cualquier otra secuencia (objetivo) (una o más de una) con la sonda se puede probar comparando el objetivo con el archivo mediante programación dinámica.. Este algoritmo consta de dos pasos. El primer paso es la generación del perfil mediante el software PROFWARE, que hace uso de una alineación existente (sonda) basada en la similitud de secuencia o la estructura 3D correspondiente para generar un perfil. El segundo paso es la comparación del perfil con una base de datos de secuencias o una sola secuencia. En este paso, en función del perfil generado, la secuencia objetivo o el grupo de secuencias podría alinearse usando PROFINAL, se usa programación dinámica en la alineación. [3]
Referencias
- ^ a b Perfil de la facultad de la Universidad de Purdue Archivado el 3 de diciembre de 2011 en la Wayback Machine.
- ^ Historia de ISCB
- ↑ Gribskov, M; McLachlan, AD; Eisenberg, D (julio de 1987). "Análisis de perfil: detección de proteínas relacionadas lejanamente" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 84 (13): 4355–8. doi : 10.1073 / pnas.84.13.4355 . PMC 305087 . PMID 3474607 .
| Precedido por Philip Bourne | Presidente de la Sociedad Internacional de Biología Computacional 2003-2007 | Sucedido por Burkhard Rost |
