Journal of Cell Biology es una revista internacional revisada por pares propiedad de The Rockefeller University y publicada por Rockefeller University Press .
Disciplina | Biología Celular |
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Idioma | inglés |
Editado por | Jodi Nunnari |
Detalles de la publicación | |
Historia | The Journal of Biphysical and Biochemical Citology (1955-1961) The Journal of Cell Biology (1962-presente) |
Editor | Prensa de la Universidad Rockefeller (Estados Unidos) |
Acceso abierto | después de 6 meses |
Factor de impacto | 8.811 (2019) |
Abreviaturas estándarISO 4 ( alt ) · Bluebook ( alt1 · alt2 ) NLM ( alt ) · MathSciNet ( alt ) | |
ISO 4 | J. Cell Biol. |
IndexaciónCODEN · JSTOR ( alt ) · LCCN ( alt ) MIAR · NLM ( alt ) · Scopus | |
ISSN | 0021-9525 |
LCCN | 2001-227177 |
JSTOR | 00219525 |
OCLC no. | 1390147 |
Enlaces | |
Historia
A principios de la década de 1950, un pequeño grupo de biólogos comenzó a explorar la anatomía intracelular utilizando la tecnología emergente de la microscopía electrónica . Muchos de estos investigadores estaban en el Instituto de Medicina Rockefeller, el predecesor de la Universidad Rockefeller . A medida que su trabajo avanzaba hacia la publicación, se sintieron decepcionados con la calidad limitada de la reproducción de imágenes de medios tonos en las revistas impresas de la época, y se sintieron frustrados por las estrictas políticas editoriales de las revistas existentes con respecto a sus resultados basados en imágenes. En 1954, el Director del Instituto Rockefeller, Detlev Bronk , convocó un almuerzo para discutir la creación de una nueva revista como lugar para la publicación de este tipo de trabajos. [1]
El primer número de The Journal of Biophysical and Biochemical Citology se publicó menos de un año después, el 25 de enero de 1955. Una suscripción cuesta $ 15 por año. La lista de editores estaba compuesta por Richard S. Bear, H. Stanley Bennett, Albert L. Lehninger , George E. Palade , Keith R. Porter , Francis O. Schmitt , Franz Schrader y Arnold M. Seligman. Las instrucciones a los autores describen el alcance de la revista, " La Revista de Citología Biofísica y Bioquímica está diseñada para proporcionar un medio común para la publicación de investigaciones morfológicas , biofísicas y bioquímicas sobre las células, sus componentes y sus productos. especial atención a los informes sobre la organización celular a nivel coloidal y molecular y a los estudios que integran información citológica derivada de diversos enfoques técnicos ". Reconociendo que necesitaban un título más atractivo, los editores cambiaron el nombre a The Journal of Cell Biology ("JCB") en 1962.
Se han publicado muchos descubrimientos seminales en la revista, incluidas las primeras descripciones de numerosas funciones y estructuras celulares, como la vía secretora , [2] [3] [4] [5] [6] [7] mitocondrial [8] [ 9] y cloroplasto [10] ADN , microtúbulos , [11] [12] filamentos intermedios , [13] uniones estrechas [14] (incluyendo ocludinas [15] y claudins [16] ), las uniones adherentes , [14] y cadherinas . [17]
Fechas clave
- 25 de enero de 1955: publicación del primer número de The Journal of Biophysical and Biochemical Citology.
- Enero de 1961 - diciembre de 1983: Raymond Griffiths es el editor ejecutivo.
- Enero de 1962: el nombre de la revista cambió a The Journal of Cell Biology .
- Enero de 1984 - diciembre de 1998 : Bernie Gilula es redactor jefe.
- 13 de enero de 1997: Se publica en línea el primer número de JCB.
- Abril de 1997 - abril de 2007: Mike Rossner es editor en jefe.
- Enero de 1999 - diciembre de 2008: Ira Mellman es Editor en Jefe.
- Julio de 2000: Se permitió a los autores publicar el archivo pdf final publicado de sus artículos en sus propios sitios web.
- Enero de 2001: JCB comienza a hacer que su contenido en línea sea gratuito para el público seis meses después de su publicación.
- Julio de 2002: JCB adopta un flujo de trabajo completamente electrónico.
- Septiembre de 2002: JCB comienza a examinar todas las imágenes digitales en busca de evidencia de manipulación.
- Enero de 2003: JCB es pionera en el flujo de trabajo RGB para imágenes digitales en color.
- Junio de 2003: JCB lanza al público todo su contenido anterior de más de seis meses de forma gratuita al volumen 1, número 1.
- Mayo de 2007 - julio de 2010: Emma Hill es editora ejecutiva.
- Noviembre de 2007: JCB comienza a publicar todo su contenido en PubMed Central , donde está disponible de forma gratuita para el público seis meses después de su publicación.
- 1 de mayo de 2008: la nueva política de derechos de autor permite a los autores conservar los derechos de autor de sus propios trabajos y que terceros reutilicen el contenido de JCB bajo una licencia Creative Commons .
- Diciembre de 2008: JCB lanza Dataviewer
- Enero de 2009 - septiembre de 2014: Tom Misteli es el editor en jefe.
- Septiembre de 2010 - diciembre de 2014: Elizabeth H. Williams es editora ejecutiva.
- Octubre de 2014 - mayo de 2015: Alan Hall es editor en jefe. [18]
- Abril de 2015 - Agosto de 2019: Rebecca Alvania es editora ejecutiva.
- Agosto de 2015 - presente: Jodi Nunnari es Editor en Jefe. [19]
- Noviembre de 2019 - presente : Tim Spencer es editor ejecutivo
Factor de impacto
Según Journal Citation Reports , recibió un factor de impacto de 2013 de 9,786, ubicándose en el puesto 21 de 185 revistas en la categoría "Biología celular". [20] A partir de 2019, la vida media citada de la revista es 14.0. [21]
Acceso en linea
Journal of Cell Biology se publicó por primera vez en línea el 13 de enero de 1997. Todo el contenido fue gratuito para el público durante ese primer año de publicación en línea. En enero de 1998, todo el contenido de la investigación primaria se colocó bajo controles de acceso, pero todas las noticias y el contenido de reseñas permanecieron libres para el público inmediatamente después de su publicación.
En enero de 2001, en respuesta a las llamadas de la comunidad investigadora para proporcionar acceso gratuito a los resultados de la investigación financiada con fondos públicos, JCB fue una de las primeras revistas en publicar su contenido de investigación principal al público 6 meses después de su publicación. [22]
En junio de 2003, todo el contenido anterior de JCB a partir del volumen 1, número 1, se publicó en el sitio web de JCB. El contenido posterior se proporciona de forma gratuita. [23]
En noviembre de 2007, anticipándose al mandato de los Institutos Nacionales de Salud sobre el acceso público a los resultados de la investigación financiada por los NIH, JCB comenzó a depositar todo su contenido en PubMed Central , donde la versión final publicada se lanza al público 6 meses después. publicación. [24]
Todo el contenido de JCB siempre ha sido gratuito en línea en 143 países en desarrollo.
Copyright y uso de terceros
En julio de 2000, JCB comenzó a aprovechar el poder de Internet para promover una mayor distribución de su contenido cuando se convirtió en una de las primeras revistas que permitió a los autores publicar el archivo pdf final publicado de sus artículos en sus propios sitios web. [25] El 1 de mayo de 2008, JCB cambió su política de derechos de autor tradicional para permitir que los autores retengan los derechos de autor de sus propias obras. Los autores pueden hacer lo que quieran con sus artículos publicados, incluso con fines comerciales. Al mismo tiempo, el contenido de JCB se abrió al uso de terceros bajo una licencia Creative Commons. [26] La única restricción a este uso por parte de terceros es que no pueden crear un sitio espejo gratuito de contenido de JCB dentro de los primeros seis meses después de la publicación.
Integridad de los datos
Orígenes de la proyección de imágenes
En 2002, JCB adoptó un flujo de trabajo de producción completamente electrónico. Esto significa que todo el texto se envía como archivos de documentos electrónicos y todas las figuras se envían como archivos de imágenes electrónicos. Mientras formateaba archivos de figuras para un manuscrito aceptado, Mike Rossner , que entonces era el editor gerente de JCB, descubrió una transferencia Western en la que la intensidad de una sola banda se había ajustado selectivamente en relación con las otras bandas.
Los datos originales se obtuvieron de los autores y fue evidente que la manipulación afectó la interpretación de los datos. La aceptación editorial del manuscrito fue revocada, y JCB inmediatamente inició una política para filtrar todas las imágenes en todos los artículos aceptados en busca de evidencia de manipulación de imágenes. [27]
Directrices para el manejo de imágenes digitales
En consulta con científicos en ejercicio del Comité Editorial, JCB desarrolló directrices para el manejo de imágenes digitales, que se publicaron por primera vez en junio de 2003. [28] La versión actual está disponible aquí. [29] Una discusión más profunda de estas pautas y la ética de la manipulación de imágenes se publicó en un artículo en el NIH Catalyst en mayo de 2004, titulado "¿Qué hay en una imagen? La tentación de la manipulación de imágenes". El artículo se reimprimió en JCB en julio de 2004. [30]
Datos sobre manipulación de datos
En el momento en que instituyó el programa de detección de imágenes, JCB fue el único en aplicar un enfoque sistemático para detectar la manipulación de datos en manuscritos aceptados para publicación. Este enfoque proporcionó los primeros datos concretos sobre la frecuencia y la gravedad de la manipulación de datos en las publicaciones de investigación biomédica. Los editores de JCB han revocado la aceptación de aproximadamente el 1% de los artículos que pasaron la revisión por pares porque detectaron una manipulación de imágenes que afectó la interpretación de los datos. La aceptación se revoca si la manipulación pone en duda alguna conclusión de un artículo. El 25% de todos los manuscritos aceptados tienen al menos una figura que debe rehacerse por manipulación "inapropiada", es decir, la manipulación no afecta la interpretación de los datos, pero viola las pautas de la revista para presentar datos de imágenes.
Estos números se hicieron públicos por primera vez en noviembre de 2004, en la Conferencia de Investigación sobre Integridad de la Investigación organizada por la Oficina de Integridad de la Investigación .
Publicidad sobre manipulación de imágenes y proyección de imágenes
El programa de selección de imágenes de JCB se publicó en un artículo de Nature en abril de 2005, titulado "CSI Cell Biology". [31] El día de Navidad de 2005, The New York Times publicó un artículo que mostraba que la manipulación de imágenes era parte del fraude científico perpetrado por Hwang Woo-Suk y sus colegas. [32] Cuando se hizo evidente que el programa de detección de JCB habría detectado la manipulación de la imagen antes de la publicación, el New York Times destacó el proceso de JCB en la portada de su sección Science Times el 24 de enero de 2006. [33] Esto generó conciencia entre el público y, entre otras revistas biomédicas, sobre el valor potencial de la detección de imágenes por parte de los editores de revistas, incluidos:
- Harvard Focus Magazine (10 de febrero de 2006) [34]
- Radio Pública Nacional (13 de marzo de 2006) [35]
- Science (22 de diciembre de 2006) [36]
- The New York Times (2 de octubre de 2007) [37] y
- La crónica de la educación superior . (6 de junio de 2008) [38]
Muchas revistas han adoptado las pautas de JCB sobre manipulación de imágenes en sus instrucciones a los autores, pero solo unas pocas las están aplicando con una selección completa de todas las imágenes para detectar evidencia de manipulación.
Respuesta de la Academia Nacional de Ciencias (NAS)
En febrero de 2006, los editores de JCB expresaron la necesidad de estándares sancionados por la comunidad para mantener la integridad de los datos en una carta al presidente de la Academia Nacional de Ciencias , Ralph Cicerone . [39] La carta, junto con las preocupaciones posteriores sobre los datos digitales planteadas por otras editoriales científicas, impulsó un estudio del Comité de Ciencia, Ingeniería y Políticas Públicas (una unidad conjunta de la NAS, la Academia Nacional de Ingeniería , y el Instituto de Medicina ) para examinar la cuestión de la integridad de los datos. El estudio se encargó en mayo de 2006.
Mike Rossner presentó una charla al Comité en una reunión abierta en abril de 2007, en la que describió la experiencia de JCB y las otras revistas de Rockefeller University Press en el manejo de la manipulación de imágenes. Señaló que debería ser responsabilidad de la comunidad de investigadores desarrollar estándares de integridad de datos, pero JCB había asumido este papel porque no existían tales estándares cuando JCB enfrentó el problema por primera vez en 2002.
El Comité publicó su informe, titulado "Garantizar la integridad, accesibilidad y administración de los datos de investigación en la era digital, en julio de 2009. [40] El anuncio de NAS citó específicamente a JCB por sus pasos proactivos en el establecimiento de directrices específicas para" aceptable e inaceptable formas de alterar las imágenes ". El informe abordó el problema de la integridad de los datos desde la perspectiva tanto de la veracidad como de la precisión en la adquisición y presentación de informes, y desde la perspectiva de la accesibilidad de los datos a lo largo del tiempo. recomendaciones para hacer cumplir esas normas una vez establecidas El informe llegó a la conclusión general de que "los propios investigadores son responsables de garantizar la integridad de sus datos de investigación".
Innovaciones tecnicas
El estándar RGB
JCB fue la primera revista en adoptar el "Estándar RGB" para la reproducción de imágenes en color. Para maximizar la calidad de la reproducción de imágenes en color, JCB declaró en enero de 2004 [41] que la versión en línea de la revista es la "revista de registro", y que las imágenes se reproducirían en línea utilizando archivos de los autores en el mismo esquema de color (rojo, Verde, Azul) en el que son adquiridos por cámaras digitales, y que se utiliza para mostrarlos en un monitor de computadora.
Anteriormente, se pedía a los autores que convirtieran sus archivos RGB al esquema de color CMYK necesario para imprimir en papel, lo que resultaba en una pérdida sustancial de brillo de la imagen. Luego, el editor volvió a convertir esos archivos CMYK a RGB para publicarlos en línea, lo que resultó en una segunda ronda de alteración de los colores originales. La llegada del flujo de trabajo RGB permitió que los colores se mostraran en la publicación en línea exactamente como aparecían en los archivos originales de los autores.
El visor de datos de JCB
El 1 de diciembre de 2008, JCB lanzó JCB DataViewer, la primera aplicación basada en navegador para ver datos de imágenes originales y multidimensionales. [42] Esta aplicación se creó junto con Glencoe Software [43] utilizando un motor de gestión de datos basado en el software OMERO desarrollado por Open Microscopy Environment. [44] Glencoe Software también desarrolló una aplicación "Rollup" para cargar archivos de imágenes originales en DataViewer. DataViewer admite numerosos tipos de archivos patentados de varios microscopios y sistemas de documentación en gel. [45]
Esta revolucionaria aplicación permite a los autores de JCB presentar datos de imágenes multidimensionales a medida que fueron adquiridos, dándoles la oportunidad de compartir datos que antes no era posible compartir. Los lectores de JCB pueden ver los datos originales que respaldan un artículo publicado y pueden interactuar con esos datos desplazándose por una pila az o una pila de imágenes de lapso de tiempo. Los usuarios pueden seleccionar canales individuales para ver o ver todos los canales por separado en la misma pantalla. También pueden producir gráficos de líneas de intensidades de píxeles a lo largo de cualquier eje horizontal o vertical.
Una actualización del software en agosto de 2012 permite al usuario pasar sin problemas de un aumento de 1 milímetro a 1 micrómetro de imágenes ensambladas a partir de microscopios ópticos y electrónicos. Como ejemplo, proporcionan una imagen completa de un embrión de pez cebra. [46] [47]
Referencias
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enlaces externos
- Página web oficial
- Visor de datos JCB
- RU Press
- Base de datos de imágenes para biología celular
- Celdando mi alma
- Los biólogos celulares comparten sus instantáneas
- Maravillas microscópicas