Katherine Snowden Pollard es profesora en el Instituto Gladstone de ciencia de datos y biotecnología de la Universidad de California en San Francisco (UCSF). [1] [3] [4] Recibió una beca de la Sociedad Internacional de Biología Computacional en 2020 por sus destacadas contribuciones a la biología computacional y la bioinformática . [5] [6]
Katie Pollard | |
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Nació | Katherine Snowden Pollard |
alma mater | Pomona College (BA) Universidad de California, Berkeley (MS, PhD) |
Premios | Becario ISCB (2020) |
Carrera científica | |
Campos | Genómica evolutiva Genómica funcional [1] |
Instituciones | Gladstone Institutes Universidad de California, San Francisco University of California, Davis University of California, Santa Cruz |
Tesis | Métodos estadísticos computacionalmente intensivos para el análisis de datos de expresión génica (2003) |
Asesor de doctorado | Mark van der Laan [2] |
Influencias | Sandrine Dudoit David Haussler |
Sitio web | gladstone |
Educación
Pollard recibió una licenciatura de Pomona College y una maestría de la Universidad de California, Berkeley (UC Berkeley). Se le concedió un doctorado. en 2003 de UC Berkeley para una investigación supervisada por Mark van der Laan . [7] [2]
Carrera e investigación
Pollard es líder en el desarrollo de modelos estadísticos y software de código abierto para big data , especialmente en genómica . [8] [9] Pollard y su equipo fueron pioneros en la identificación de las regiones del genoma humano de más rápida evolución , conocidas como regiones humanas aceleradas (HAR). [10] [11] Pollard también ha diseñado métodos para estudiar el microbioma humano [12] [13] y otras comunidades microbianas, estos estudios preparan el escenario para el uso de la metagenómica en la medicina de precisión .
Antes de trabajar en UCSF, ocupó un puesto de investigación postdoctoral con Sandrine Dudoit en Berkeley y trabajó con David Haussler en Santa Cruz. [10]
Referencias
- ^ a b Publicaciones de Katherine Pollard indexadas por Google Scholar
- ^ a b Katherine Pollard en el Proyecto de genealogía de las matemáticas
- ^ Publicaciones de Katherine Pollard de Europa PubMed Central
- ^ Publicaciones de Katherine Pollard indexadas por labase de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
- ^ "Becarios de ISCB" . www.iscb.org .
- ^ "19 de febrero de 2020: ¡ISCB felicita y presenta a la clase de becarios 2020!" . www.iscb.org .
- ^ Pollard, Katherine Snowden (2003). Métodos estadísticos computacionalmente intensivos para el análisis de datos de expresión génica . berkeley.edu (tesis doctoral). Universidad de California, Berkeley. OCLC 937442296 . ProQuest 305339168 .
- ^ El Consorcio de Análisis y Secuenciación de Chimpancés (2005). "Secuencia inicial del genoma del chimpancé y comparación con el genoma humano" . Naturaleza . 437 (7055): 69–87. doi : 10.1038 / nature04072 . ISSN 0028-0836 . PMID 16136131 .
- ^ Pollard, KS; Hubisz, MJ; Rosenbloom, KR; Siepel, A. (2009). "Detección de tasas de sustitución no neutra en filogenias de mamíferos" . Investigación del genoma . 20 (1): 110-121. doi : 10.1101 / gr.097857.109 . ISSN 1088-9051 . PMC 2798823 . PMID 19858363 .
- ^ a b Pollard KS, Salama SR, King B, Kern AD, Dreszer T, Katzman S, Siepel A, Pedersen JS, Bejerano G, Baertsch R, Rosenbloom KR, Kent J, Haussler D (2006). "Fuerzas que dan forma a las regiones de más rápida evolución en el genoma humano" . PLOS Genetics . 2 (10): e168. doi : 10.1371 / journal.pgen.0020168 . PMC 1599772 . PMID 17040131 .
- ^ Kostka D, Hubisz MJ, Siepel A, Pollard KS (2012). "El papel de la conversión de genes sesgada por GC en la configuración de las regiones de más rápida evolución del genoma humano" . Biología Molecular y Evolución . 29 (3): 1047–57. doi : 10.1093 / molbev / msr279 . PMC 3278478 . PMID 22075116 .
- ^ Consorcio del Proyecto del Microbioma Humano (2012). "Estructura, función y diversidad del microbioma humano sano" . Naturaleza . 486 (7402): 207–214. doi : 10.1038 / nature11234 . ISSN 0028-0836 . PMC 3564958 . PMID 22699609 .
- ^ Consorcio del Proyecto del Microbioma Humano (2012). "Un marco para la investigación del microbioma humano" . Naturaleza . 486 (7402): 215–221. doi : 10.1038 / nature11209 . ISSN 0028-0836 . PMC 3377744 . PMID 22699610 .