MDL Chime es un complemento gratuito utilizado por los navegadores web para mostrar las estructuras tridimensionales de las moléculas . [2] Es parte de la línea de productos ISIS adquirida por Symyx Technologies de la editorial científica Elsevier en octubre de 2007. Se basa en el código RasMol . [3]
Autor (es) original (es) | Elsevier |
---|---|
Desarrollador (es) | Tecnologías Symyx |
Versión inicial | 1996 (0.9 Beta) 1997 (1.0 Versión completa) [1] |
Lanzamiento estable | 2.6 SP7 / 31 de julio de 2007 |
Sistema operativo | Mac OS clásico , Microsoft Windows |
Plataforma | Internet Explorer , Mozilla Firefox |
Sitio web | http://accelrys.com/products/collaborative-science/biovia-discovery-studio/ |
Chime es utilizado por una amplia gama de sitios web de bioquímica para la visualización de macromoléculas . Muchos de estos sitios están vinculados al Índice mundial de recursos de visualización molecular MolVisIndex.Org . Chime también se utilizó hasta 2006 en el Protein Data Bank para examinar las estructuras almacenadas allí.
Aunque disponible en 1996 tanto en Windows 95 como en las versiones clásicas de Mac OS para los navegadores Netscape e Internet Explorer , el desarrollo de Chime no siguió el paso a Mac OS X para Mac y la compatibilidad con los navegadores basados en Windows distintos de Internet Explorer fue limitada ( aunque funciona bien en Mozilla Firefox ). Una característica importante añadida en 1997 fue la capacidad de mostrar datos espectroscópicos en forma de protocolos IUPAC JCAMP-DX. Aparte de esto, la mayoría de las actualizaciones desde entonces fueron para que el paquete de instalación siguiera el desarrollo de Windows e Internet Explorer.
Chime ha sido reemplazado en gran medida por Jmol , una aplicación / subprograma de visualización molecular Java de código abierto no patentado que ha mantenido la mayor parte de la compatibilidad de comandos de Chime al agregar funciones.
Una característica de Chime que aún no se ha reproducido con Jmol es el cálculo del potencial electrostático o hidrófobo para su uso en la coloración de superficies moleculares. En cambio, Jmol confía en que estos datos los proporcionen otros paquetes de cálculo. Chime implica cierto nivel de cálculo de estas propiedades.
Ahora Chime es propiedad de Accelrys y se ha fusionado con Discovery Studio .
Ver también
Referencias
- ^ https://www.umass.edu/microbio/chime/chimvers.htm
- ^ Dorland, Liz (2002). "Noticias en línea: ¿Qué hay de nuevo con Chime?". J. Chem. Educ. 79 (7): 778. Código bibliográfico : 2002JChEd..79..778D . doi : 10.1021 / ed079p778 .
- ^ Hodgson, John (1996). "GlaxoWellcome y MDL se enredan en la Web" . Biotecnología de la naturaleza . 14 (6): 690. doi : 10.1038 / nbt0696-690 . S2CID 32321207 .
enlaces externos
- Captura de pantalla de Chime en acción .
- Accelrys Chime
- Descarga de timbre [ enlace muerto permanente ]
- Banco de datos de proteínas RCSB
- MolviZ.Org: Recursos de visualización molecular con una rica colección de moléculas
- Páginas de CHIME y Jmol de Dublin City University