Molden es un programa general de procesamiento de estructuras moleculares y electrónicas.
Autor (es) original (es) | Gijs Schaftenaar |
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Versión inicial | 10 de noviembre de 1993 [1] |
Lanzamiento estable | 5.9.2 / 20 de diciembre de 2018 [1] |
Sistema operativo | Windows OS X Linux [2] |
Licencia | Propiedad |
Sitio web | www |
Características principales
- Lee la salida de los paquetes ab initio GAMESS (EE. UU.) , Gaussian , MOLPRO , PySCF y de paquetes semi-empíricos como MOPAC , y admite otros formatos.
- Muestra orbitales moleculares o densidad de electrones como diagramas de contorno o diagramas de cuadrícula 3D y la salida a varios formatos gráficos.
- Anima caminos de reacción y vibraciones moleculares.
- Un editor de matriz Z.
El programa Molden ha sido probado en diferentes plataformas, a saber, Linux, Windows NT, Windows95, Windows2000, WindowsXP, MacOSX, Silicon Graphics IRIX, Sun SunOS y Solaris.
Ambfor, el módulo de campo de fuerza principal de Molden, es un programa externo que se puede inicializar desde Molden. Ambfor admite el campo de fuerza de proteínas Amber y GAFF (Campo de fuerza general de ámbar). El uso de Ambfor es automático cuando se estudia una proteína con Molden. El campo de fuerza GAFF se usa solo moléculas pequeñas. Tanto Amber como GAFF se basan en cargas atómicas. Las diferencias se encuentran principalmente en el costo computacional, siendo GAFF muy costoso.
Molden puede leer varios formatos de archivo con información de cristal.
Ver también
Referencias
- ^ a b "HISTORIA" . Consultado el 2 de mayo de 2013 .
- ^ "Plataformas actualmente probadas" . Consultado el 3 de mayo de 2013 .