El Sistema General de Estructura Electrónica Atómica y Molecular ( GAMESS (EE. UU.) ) Es un software de computadora para un programa de química computacional . [1] [2] [3] [4] [5] El código original comenzó el 1 de octubre de 1977 como un proyecto de Recursos Nacionales para Computaciones en Química. [6] En 1981, la base del código se dividió en variantes GAMESS (EE. UU.) Y GAMESS (Reino Unido) , que ahora difieren significativamente. GAMESS (EE. UU.) Es mantenido por los miembros del Grupo de Investigación Gordon de la Universidad Estatal de Iowa . [7] El código fuente de GAMESS (EE. UU.) Está disponible como software gratuito disponible en fuente , pero nosoftware de código abierto , debido a restricciones de licencia.
Desarrollador (es) | Grupo de Química Cuántica de la Universidad Estatal de Iowa |
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Versión inicial | 1 de octubre de 1977 |
Lanzamiento estable | 20 de abril de 2017/20 de abril de 2017 |
Escrito en | FORTRAN 77 , C |
Sistema operativo | Windows ; Unix , similar a Unix : Linux , FreeBSD , Mac OS X |
Disponible en | inglés |
Tipo | Quimica computacional |
Licencia | Freeware patentado |
Sitio web | www |
Habilidades
SCFTYP = | RHF | ROHF | UHF | GVB | MCSCF |
---|---|---|---|---|---|
Energía | CDpF | CDpF | CDpF | CDp | CDpF |
Gradiente analítico | CDpF | CDpF | CDpF | CDp | CDpF |
Arpillera numérica | CDpF | CDp | CDp | CDp | CDp |
Arpillera analítica | CDpF | CDpF | CDpF | CDp | Dp |
Energía MP2 | CDpF | CDpF | CDp | No | CDp |
Gradiente MP2 | CDpF | Dp | CDp | No | No |
Energía CI | CDpF | CDp | No | CDp | CDp |
Gradiente de CI | CD | No | No | No | No |
Energía CC | CDpF | CDF | No | No | No |
Energía EOM | CD | CD | No | No | No |
Energía DFT | CDpF | CDp | CDpF | No | No |
Gradiente DFT | CDpF | CDp | CDpF | No | No |
Energía TD-DFT | CDpF | No | CDpF | No | No |
Gradiente TDDFT | CDpF | No | No | No | No |
Energía MOPAC | sí | sí | sí | sí | No |
Gradiente MOPAC | sí | sí | sí | No | No |
GAMESS (EE. UU.) Puede realizar varios cálculos de química computacional general , incluido el método Hartree-Fock , la teoría funcional de la densidad (DFT), el enlace de valencia generalizada (GVB) y el campo autoconsistente de múltiples configuraciones (MCSCF). Las correlaciones de correlación después de estos cálculos de SCF se pueden estimar mediante la interacción de configuración (CI), la teoría de perturbación de segundo orden de Møller-Plesset (MP2) y la teoría de conglomerados acoplados (CC). El efecto solvente se puede considerar usando mecánica cuántica y mecánica molecular a través de potenciales de fragmentos efectivos discretos o modelos continuos (como PCM). Se pueden calcular correcciones relativistas, incluidos los términos escalares de Douglas-Kroll de tercer orden.
Si bien el programa no realiza directamente la mecánica molecular , puede realizar cálculos mixtos de mecánica cuántica y mecánica molecular a través de potenciales de fragmentos efectivos o mediante una interfaz con el código Tinker . El método de los orbitales moleculares de fragmentos se puede utilizar para tratar grandes sistemas dividiéndolos en fragmentos.
También se puede conectar con los programas de enlace de valencia VB2000 y XMVB y el programa de análisis de población Natural Bond Orbital (NBO).
Los archivos de entrada utilizan un esquema basado en palabras clave. Por ejemplo, $ CONTRL SCFTYP = ROHF MAXIT = 30 $ END, que especifica que la parte SCF del código debe realizar un cálculo Hartree-Fock (ROHF) de shell abierto restringido y salir si el resultado no converge en 30 iteraciones. La salida está en un archivo de texto en inglés. [8]
Ver también
- GAMESS (Reino Unido)
- JUEGOS PARA PC, Firefly
- Lista de software de química cuántica y física del estado sólido
Referencias
- ^ Joven, David C. (2001). "Apéndice AA2.3 JUEGOS". Química computacional: una guía práctica para aplicar técnicas a problemas del mundo real . Wiley-Interscience. pag. 335. doi : 10.1002 / 0471220655 . ISBN 978-0-471-33368-5.
- ^ Schmidt, Michael W .; Baldridge, Kim K .; Boatz, Jerry A .; Elbert, Steven T .; Gordon, Mark S .; Jensen, Jan H .; Koseki, Shiro; Matsunaga, Nikita; Nguyen, Kiet A .; Su, Shujun; Windus, Theresa L .; Dupuis, Michel; Montgomery, John A. (1993). "Sistema general de estructura electrónica atómica y molecular" . Revista de Química Computacional . 14 (11): 1347-1363. doi : 10.1002 / jcc.540141112 . S2CID 3358041 . Archivado desde el original el 4 de noviembre de 2011 . Consultado el 30 de abril de 2012 .
- ^ Gordon, Mark S .; Schmidt, Michael W. (2005). "Avances en la teoría de la estructura electrónica: GAMESS una década después" (PDF) . En Dykstra, CE; Frenking, G .; Lim, KS; Scusaria, GE (eds.). Teoría y Aplicaciones de la Química Computacional, los primeros 40 años . Amsterdam: Elsevier. págs. 1167-1189. doi : 10.1016 / B978-044451719-7 / 50084-6 . ISBN 978-0-444-51719-7. Archivado desde el original (PDF) el 13 de abril de 2018.
- ^ Schmidt, Michael W .; Baldridge, Kim K .; Boatz, Jerry A .; Jensen, Jan H .; Koseki, Shiro; Gordon, Mark S .; Nguyen, Kiet A .; Windus, Theresa L .; Elbert, Stephen T. (1990). "Sistema General de Estructura Electrónica Atómica y Molecular (GAMESS)". Boletín QCPE . 10 : 52–54. ISSN 0889-7514 . OCLC 7963600 .
- ^ A diciembre de 2014, el código GAMESS enumera a sus colaboradores como: Michael W. Schmidt Archivado 2020-02-03 en Wayback Machine , Kimberly K. Baldridge, Jerry A. Boatz, Stephen T. Elbert, Mark S. Gordon , Jan H. Jensen, Shiro Koseki, Nikita Matsunaga, Kiet A. Nguyen, Shujun J. Su, Theresa L.Windus, Michel Dupuis, John A. Montgomery, Ivana Adamovic, Christine Aikens, Yuri Alexeev , Pooja Arora, Andrey Asadchev, Rob Bell , Pradipta Bandyopadhyay, Jonathan Bentz, Brett Bode , Kurt Brorsen, Caleb Carlin, Galina Chaban, Wei Chen, Cheol Ho Choi, Paul Day, Albert Defusco, Nuwan Desilva, Tim Dudley, Dmitri Fedorov, Graham Fletcher, Mark Freitag , Kurt Glaesemann , Dan Kemp, Grant Merrill, Noriyuki Minezawa, Jonathan Mullin, Takeshi Nagata, Sean Nedd, Heather Netzloff, Bosiljka Njegic, Ryan Olson, Michael Pak , Spencer Pruitt, Luke Roskop, Jim Shoemaker, Lyudmila Slipchenko, Tony Smith, Sarom Sok, Jie Song , Tetsuya Taketsugu, Simon Webb, Peng Xu, Soohaeng Yoo, Federico Zahariev, Joe Ivanic, Aar en el oeste, Laimutis Bytautas, Klaus Ruedenberg, Kimihiko Hirao, Takahito Nakajima, Takao Tsuneda, Muneaki Kamiya, Susumu Yanagisawa, Kiyoshi Yagi, Mahito Chiba, Seiken Tokura, Naoaki Kawakami, Frank Jensen, Visvaldas Kairys, Steve Hunsi, David Li , Benedetta Mennucci, Jacopo Tomasi, Henry Kurtz, Prakashan Korambath, Toby Zeng, Mariusz Klobukowski, Mark Spackman, Hiroaki Umeda, Kazuo Kitaura, Karol Kowalski, Marta Wloch, Jeffrey Gour, Jesse Lutz, Wei Li, Piotr Piecuch , Stanis , Monlaw Musial Kucharski, Olivier Quinet, Benoit Champagne, Bernard Kirtman, Kazuya Ishimura, Michio Katouda, Shigeru Nagase, Anna Pomogaeva, Dan Chipman, Haruyuki Nakano, Feng Long Gu, Jacek Korchowiec, Marcin Makowski, Yuriko Aoki, Hirotoshi Miyoshi Mori, Eisordazhi Mori , Chet Swalina, Jonathan Skone, Sharon Hammes-Schiffer, Masato Kobayashi, Tomoko Akama, Tsuguki Touma, Takeshi Yoshikawam Yasuhiro Ikabata, Hiromi Nakai, Shuhua Li, Peifeng Su, Dejun Si, Nandun Thellamurege, Yali Wang, Hui Li, Roberto Peverati, Kim Baldridge, Maria Barysz, Casper Steinmann, Hiroya Nakata, Yoshio Nishimoto, Stephan Irle.
- ^ Grupo de Investigación Gordon. "Manual GAMESS (Introducción)" (PDF) .
- ^ "Página de inicio de Gordon Group / GAMESS" . www.msg.chem.iastate.edu .
- ^ Grupo de Investigación Gordon. "Manual de GAMESS (entrada)" (PDF) .
enlaces externos
- Página web oficial
- Grupo de Google GAMESS
- Blog de Jan Jensen con algunos tutoriales de GAMESS
- Documentación de GAMESS-US