Nextstrain es una colaboración entre investigadores de Seattle , EE. UU. [1] y Basilea , Suiza [2], que proporciona una colección de herramientas de código abierto para visualizar la genética detrás de la propagación de brotes virales . [3]
Su objetivo es apoyar las medidas de salud pública y la vigilancia facilitando la comprensión de la propagación y evolución de patógenos . La plataforma Nextstrain se inició en 2015. [2] El código desarrollado por Nextstrain se pone a disposición del público, por ejemplo, a través de github.com y sus datos están disponibles y se pueden ver en forma accesible a través de las páginas del sitio web. [4]
Aplicaciones
Según su sitio web, el equipo de Nextstrain mantiene un análisis genómico actualizado de cada uno de los siguientes patógenos: [5]
- Influenza aviar
- Dengue
- Enterovirus D68
- Sarampión
- Paperas
- SARS-CoV-2
- Influenza estacional
- Tuberculosis
- virus del Nilo Occidental
- Ébola en África Occidental 2013-16
- Zika
Pandemia de COVID-19
Nextstrain y sus resultados han sido ampliamente citados durante la pandemia de COVID-19 . [6] [7] [ cita requerida ]
Otorgar
En mayo de 2020, Nextstrain y Trevor Bedford (profesor asociado, Fred Hutchinson Cancer Research Center ) [8] recibieron un premio Webby Special Achievement Award por la herramienta web. [9]
Ver también
Referencias
- ^ Richards, Sarah Elizabeth (26 de marzo de 2020). "Cómo las mutaciones del coronavirus pueden rastrear su propagación y refutar conspiraciones" . www.nationalgeographic.com . Consultado el 25 de diciembre de 2020 .
- ^ a b "Propagación de una nueva variante del SARS-CoV-2 en Europa en el verano de 2020" . www.unibas.ch . 29 de octubre de 2020 . Consultado el 25 de diciembre de 2020 .
- ^ Reza, Nosheen (6 de abril de 2020). "nextstrain RNA, DNA y COVID-19]" . earlycareervoice.professional.heart.org . Consultado el 25 de diciembre de 2020 .
- ^ Hadfield, James; Megill, Colin; Bell, Sidney; Huddleston, John; Potter, Barney; Callender, Charlton; et al. (22 de mayo de 2018). Kelso, Janet (ed.). "Nextstrain: seguimiento en tiempo real de la evolución de patógenos" . Bioinformática . 34 (23): 4121–4123. doi : 10.1093 / bioinformatics / bty407 . ISSN 1367-4803 . PMC 6247931 . PMID 29790939 . Archivado desde el original el 22 de noviembre de 2017.
- ^ "Seguimiento en tiempo real de Nextstrain de la sección de evolución de patógenos 'Explorar patógenos" . nextstrain.org . Consultado el 26 de diciembre de 2020 .
- ^ Drake, John (19 de diciembre de 2020). "La ciencia detrás del bloqueo del coronavirus navideño de Londres" . www.forbes.com . Consultado el 25 de diciembre de 2020 .
- ^ Hodcroft , Emma B .; Zuber, Moira; Nadeau, Sarah; Comas, Iñaki; González Candelas, Fernando; Stadler, Tanja; Neher, Richard A. (28 de octubre de 2020). "Aparición y propagación de una variante del SARS-CoV-2 por Europa en el verano de 2020" . www.medrxiv.org . doi : 10.1101 / 2020.10.25.20219063 . Consultado el 10 de marzo de 2021 .
- ^ "40 Under 40 Healthcare" . fortune.com . Consultado el 29 de diciembre de 2020 .
- ^ "Logro especial de Webby" . winners.webbyawards.com . Consultado el 29 de diciembre de 2020 .
enlaces externos
- Página de inicio oficial