OpenEye Scientific Software es una empresa de software estadounidense que desarrolla aplicaciones y juegos de herramientas de modelado molecular a gran escala .
Tipo | De propiedad privada , propiedad de los empleados, C Corporation |
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Industria | Software informático Investigación y desarrollo Biotecnología Quiminformática |
Fundado | 1997 |
Sede | , Estados Unidos |
Número de empleados | 100-200 |
Sitio web | www |
Alcance
Principalmente orientado al descubrimiento y diseño de fármacos , las áreas de aplicación incluyen generación de conformación, acoplamiento , comparación de formas, carga / electrostática , quimioinformática y visualización. El software está diseñado para el rigor científico, así como para la velocidad, escalabilidad e independencia de la plataforma .
OpenEye hace que gran parte de su tecnología esté disponible como kits de herramientas adecuados para el desarrollo personalizado. Los kits de herramientas están disponibles en varios lenguajes: C ++ , Python , Java y C # . [ cita requerida ]
Software de la aplicacion
- AFITT - Refinamiento y análisis cristalográfico .
- SANGRE - Identificación de bioisósteros usando forma, química y similitud electrostática .
- EON: análisis de similitud química mediante comparación de superposición electrostática .
- FastROCS: búsquedas de formas moleculares 3D en tiempo real, utilizando tecnología GPU.
- FILTRO - Cribado y selección molecular basados en propiedad física o grupo funcional.
- OEDocking: herramientas de acoplamiento molecular que incluyen FRED (acoplamiento rápido), HYBRID (acoplamiento guiado por ligando) y POSIT (predicción de pose guiada por ligando).
- OMEGA: generación de conformadores rápida y precisa , para moléculas lineales y macrocíclicas.
- pKa Prospector: una base de datos de mediciones de pKa de alta calidad.
- QUACPAC - Tautómeros, estados de protonación y cargas de pequeñas moléculas y proteínas .
- ROCS: análisis de similitud química mediante búsquedas rápidas de formas moleculares en 3D.
- SZMAP: identifica los sitios de agua en un sitio de unión a proteínas para mejorar la potencia del ligando.
- SZYBKI: optimización rápida del campo de fuerza de ligandos en fase gaseosa , solución o dentro de un sitio activo de proteína .
- VIDA: interfaz gráfica de usuario que visualiza, analiza y gestiona colecciones corporativas de estructuras moleculares e información.
Kits de herramientas
Bibliotecas de programación que brindan a otras aplicaciones accesibilidad orientada a objetos a un conjunto dado de capacidades.
- OEChem TK - Quiminformática y manejo de datos moleculares 3D.
- OEDepict TK - Representación elegante de estructuras 2D de compuestos.
- OEDocking TK - Acoplamiento y puntuación.
- Grapheme TK - Representación avanzada de estructuras de compuestos.
- GraphSim TK: huellas digitales moleculares 2D y cálculos de similitud.
- Lexichem TK - Interconversión de estructura y nombre de compuestos de última generación con soporte para múltiples idiomas.
- MolProp TK - Cálculo y filtrado de propiedades moleculares 2D.
- QuacPac TK: generación de tautómeros.
- Omega TK - Generación de conformadores.
- Shape TK: comparaciones de formas moleculares basadas en superposiciones 3D.
- Spicoli TK - Generación y manipulación rápida de superficies moleculares.
- Szmap TK: interacciones del agua en el sitio de unión.
- Szykbi TK: optimización de funciones generalizadas, por ejemplo, optimización de estructuras moleculares.
- Zap TK: un solucionador electrostático eficiente de Poisson-Boltzmann .
Ver también
Referencias
- "Descargas y actualizaciones: AFITT 2.3, GenBank 197.0 y Protein Databank" . BioInform . Genomeweb LLC. 16 de agosto de 2013 . Consultado el 28 de agosto de 2013 .
- "Descripción de la empresa de OpenEye Scientific Software, Inc" . Bloomberg Businessweek . Bloomberg LP . Consultado el 28 de agosto de 2013 .
- Yang, Jeremy J. (otoño de 2011). "Desarrollo de software de quimioterapia: estudios de caso" (PDF) . Escuela de Informática y Computación de la Universidad de Indiana . Consultado el 28 de agosto de 2013 .
enlaces externos
- Página web oficial