POLR2A

POLR2A
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 2GHQ , 2GHT , 2LTO , 3D9K , 3D9L , 3D9M , 3D9N , 3D9O , 3D9P , 4JXT , 5IY9 , 5IYA , 5IYC , 5IYB , 5IY7 , 5IY8 , 5IYD , 5IY6
Identificadores
Alias	POLR2A , POLR2, POLRA, RPB1, RPBh1, RPO2, RPOL2, RpIILS, hRPB220, hsRPB1, polimerasa (ARN) II subunidad A, ARN polimerasa II subunidad A, NEDHIB
Identificaciones externas	OMIM : 180660 MGI : 98086 HomoloGene : 721 GeneCards : POLR2A
Número CE	2.7.7.48
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 17 (humano) [1] Banda 17p13.1 Comienzo 7.484.366 pb [1] Fin 7.514.616 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 11 (ratón) [2] Banda 11 B3 | 11 42,86 cm Comienzo 69.733.997 pb [2] Fin 69,758,637 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • actividad de transferasa • unión a ADN • actividad nucleotidyltransferase • ARN polimerasa actividad II • unión de iones metálicos • dirigida por ARN 5'-3' actividad de la polimerasa de ARN • dirigida por ADN 5'-3' actividad de la polimerasa de ARN • GO: proteína de unión 0001948 • ubiquitina proteína ligasa de unión • unión de ARN • proteína C-terminal de unión • unión promotor específico de la cromatina Componente celular • Complejo Prp19 • nucleolo • ARN polimerasa II dirigida por ADN, complejo central • núcleo celular • nucleoplasma • citoplasma Proceso biológico • mRNA de empalme, a través de spliceosome • regulación de la transcripción, de plantilla de ADN • mantenimiento de la población de células madre somáticas • transcripción de plantilla de ADN, terminación • transcripción de elongación de RNA polimerasa promotor II • 7-metilguanosina mRNA taponado • la transcripción de la ARN polimerasa II promotor • transcripción , RNA de plantilla • regulación positiva de empalme de ARN • regulación positiva de la transcripción viral • transcripción de acoplamiento de reparación de nucleótidos escisión • transcripción de iniciación de la ARN polimerasa II promotor • Transcripción del snRNA del promotor de la RNA polimerasa II • Vía de señalización del receptor del factor de crecimiento de fibroblastos • Transcripción, plantilla de ADN • Proceso metabólico del ARN • Regulación del silenciamiento génico por miARN Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	5430	20020
Ensembl	ENSG00000284832 ENSG00000181222	ENSMUSG00000005198
UniProt	P24928	P08775
RefSeq (ARNm)	NM_000937	NM_009089 NM_001291068
RefSeq (proteína)	NP_000928	NP_001277997
Ubicación (UCSC)	Crónicas 17: 7,48 - 7,51 Mb	Crónicas 11: 69,73 - 69,76 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
Ver / editar humano Ver / Editar mouse

La subunidad RPB1 de la ARN polimerasa II dirigida por ADN , también conocida como RPB1 , es una enzima que en los seres humanos está codificada por el gen POLR2A .

Función

Este gen codifica la subunidad más grande de la ARN polimerasa II , la polimerasa responsable de sintetizar el ARN mensajero en eucariotas . El producto de este gen contiene un dominio carboxi terminal compuesto por repeticiones de heptapéptidos que son esenciales para la actividad de la polimerasa . Estas repeticiones contienen residuos de serina y treonina que se fosforilan en la transcripción activa de la ARN polimerasa . Además, esta subunidad, en combinación con varias otras subunidades de la polimerasa, forma el dominio de unión al ADN de la polimerasa, un surco en el que la plantilla de ADN se transcribe en ARN. ^[5]

Interacciones

Se ha demostrado que POLR2A interactúa con:

• BRCA1 , ^{[6] [7] [8] [9]}
• CREBBP , ^[10]
• CTDP1 , ^[7]
• CDK8 , ^[10]
• GTF2B , ^[7]
• GTF2F1 , ^{[7] [10]}
• GTF2H4 , ^[7]
• MED21 , ^{[7] [10] [11]}
• MED26 , ^[12]
• PCAF , ^[10]
• POLR2C , ^[13]
• POLR2E , ^[13]
• POLR2H , ^[13]
• POLR2L , ^[13]
• PQBP1 , ^[14]
• SMARCA2 , ^{[10] [15] [16]}
• SMARCA4 ^{[15] [16] [17]}
• SMARCB1 , ^{[10] [15] [16]}
• SMYD3 , ^[18]
• SND1 , ^[19]
• SUPT5H , ^{[20] [21]}
• TAF11 , ^[7]
• TBP , ^[7]
• TCEA1 , ^{[22] [23] [24]}
• TCERG1 , ^[25] y
• ZNF74 . ^[26]

Referencias

1. ENSG00000181222 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000284832, ENSG00000181222 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000005198 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. "Entrez Gen: POLR2A polimerasa (ARN) II (ADN dirigido) polipéptido A, 220kDa" .
6. Krum SA, Miranda GA, Lin C, Lane TF (diciembre de 2003). "BRCA1 se asocia con la ARN polimerasa II procesiva" . J. Biol. Chem . 278 (52): 52012-20. doi : 10.1074 / jbc.M308418200 . PMID 14506230 . 
7. Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (mayo de 1997). "BRCA1 es un componente de la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605–10. doi : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119 .  
8. Chiba N, Parvin JD (octubre de 2001). "Redistribución de BRCA1 entre cuatro complejos de proteínas diferentes tras el bloqueo de la replicación" . J. Biol. Chem . 276 (42): 38549–54. doi : 10.1074 / jbc.M105227200 . PMID 11504724 . 
9. Krum SA, Womack JE, Lane TF (septiembre de 2003). "El BRCA1 bovino muestra respuestas clásicas al estrés genotóxico pero baja actividad de activación transcripcional in vitro" . Oncogén . 22 (38): 6032–44. doi : 10.1038 / sj.onc.1206515 . PMID 12955082 . 
10. Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (septiembre de 1998). "Un complejo de ARN polimerasa II humana que contiene factores que modifican la estructura de la cromatina" . Mol. Celda. Biol . 18 (9): 5355–63. doi : 10.1128 / MCB.18.9.5355 . PMC 109120 . PMID 9710619 .  
11. Suñé C, Hayashi T, Liu Y, Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA (octubre de 1997). "CA150, una proteína nuclear asociada con la holoenzima ARN polimerasa II, está involucrada en la transcripción del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 activado por Tat" . Mol. Celda. Biol . 17 (10): 6029–39. doi : 10.1128 / MCB.17.10.6029 . PMC 232452 . PMID 9315662 .  
12. Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, Banks CA, Jin J, Cai Y, Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC (junio de 2004). "Un conjunto de subunidades mediadoras de mamíferos de consenso identificadas por tecnología de identificación de proteínas multidimensional" . Mol. Celular . 14 (5): 685–91. doi : 10.1016 / j.molcel.2004.05.006 . PMID 15175163 . 
13. Acker J, de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (julio de 1997). "Interacciones entre las subunidades de la ARN polimerasa II humana" . J. Biol. Chem . 272 (27): 16815–21. doi : 10.1074 / jbc.272.27.16815 . PMID 9201987 . 
14. Humbert S, Saudou F (mayo de 2002). "Hacia la especificidad celular en SCA1". Neurona . 34 (5): 669–70. doi : 10.1016 / s0896-6273 (02) 00715-8 . PMID 12062012 . S2CID 15993809 .  
15. Sif S, Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE (marzo de 2001). "Purificación y caracterización de complejos remodeladores de cromatina Brg1 y hBrm que contienen mSin3A" . Genes Dev . 15 (5): 603-18. doi : 10.1101 / gad.872801 . PMC 312641 . PMID 11238380 .  
16. Wang W, Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C, Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M, Workman JL, Crabtree GR (octubre de 1996). "Purificación y heterogeneidad bioquímica del complejo de mamíferos SWI-SNF" . EMBO J . 15 (19): 5370–82. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00921.x . PMC 452280 . PMID 8895581 .  
17. Zhao K, Wang W, Rando OJ, Xue Y, Swiderek K, Kuo A, Crabtree GR (noviembre de 1998). "Unión rápida y dependiente de fosfoinositol del complejo BAF SWI / SNF-like a la cromatina después de la señalización del receptor de linfocitos T". Celular . 95 (5): 625–36. doi : 10.1016 / s0092-8674 (00) 81633-5 . PMID 9845365 . S2CID 3184211 .  
18. Hamamoto R, Furukawa Y, Morita M, Iimura Y, Silva FP, Li M, Yagyu R, Nakamura Y (agosto de 2004). "SMYD3 codifica una histona metiltransferasa implicada en la proliferación de células cancerosas". Nat. Cell Biol . 6 (8): 731–40. doi : 10.1038 / ncb1151 . PMID 15235609 . S2CID 13456531 .  
19. Yang J, Aittomäki S, Pesu M, Carter K, Saarinen J, Kalkkinen N, Kieff E, Silvennoinen O (septiembre de 2002). "Identificación de p100 como coactivador de STAT6 que une STAT6 con la ARN polimerasa II" . EMBO J . 21 (18): 4950–8. doi : 10.1093 / emboj / cdf463 . PMC 126276 . PMID 12234934 .  
20. Kim JB, Yamaguchi Y, Wada T, Handa H, Sharp PA (septiembre de 1999). "La proteína Tat-SF1 se asocia con las proteínas RAP30 y SPT5 humanas" . Mol. Celda. Biol . 19 (9): 5960–8. doi : 10.1128 / mcb.19.9.5960 . PMC 84462 . PMID 10454543 .  
21. Wada T, Takagi T, Yamaguchi Y, Ferdous A, Imai T, Hirose S, Sugimoto S, Yano K, Hartzog GA, Winston F, Buratowski S, Handa H (febrero de 1998). "DSIF, un nuevo factor de elongación de la transcripción que regula la procesividad de la ARN polimerasa II, está compuesto por homólogos humanos de Spt4 y Spt5" . Genes Dev . 12 (3): 343–56. doi : 10.1101 / gad.12.3.343 . PMC 316480 . PMID 9450929 .  
22. Conaway RC, Kong SE, Conaway JW (agosto de 2003). "TFIIS y GreB: dos factores de elongación de transcripción afines con dedos pegajosos". Celular . 114 (3): 272–4. doi : 10.1016 / S0092-8674 (03) 00607-X . PMID 12914690 . S2CID 14209300 .  
23. Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (octubre de 1998). "FCP1, la subunidad que interactúa con RAP74 de una proteína fosfatasa humana que desfosforila el dominio carboxilo-terminal de la ARN polimerasa IIO" . J. Biol. Chem . 273 (42): 27593–601. doi : 10.1074 / jbc.273.42.27593 . PMID 9765293 . 
24. Pan G, Aso T, Greenblatt J (septiembre de 1997). "Interacción de factores de elongación TFIIS y elongina A con una holoenzima de ARN polimerasa II humana capaz de iniciación específica de promotor y sensible a activadores transcripcionales" . J. Biol. Chem . 272 (39): 24563–71. doi : 10.1074 / jbc.272.39.24563 . PMID 9305922 . 
25. Carty SM, Goldstrohm AC, Suñé C, García-Blanco MA, Greenleaf AL (agosto de 2000). "Módulos de interacción de proteínas que organizan la función nuclear: los dominios FF de CA150 se unen al fosfoCTD de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (16): 9015-20. doi : 10.1073 / pnas.160266597 . PMC 16813 . PMID 10908677 .  
26. Grondin B, Côté F, Bazinet M, Vincent M, Aubry M (octubre de 1997). "Interacción directa de la proteína de dedo de zinc KRAB / Cys2-His2 ZNF74 con una forma hiperfosforilada de la subunidad más grande de la ARN polimerasa II" . J. Biol. Chem . 272 (44): 27877–85. doi : 10.1074 / jbc.272.44.27877 . PMID 9346935 . 

Lectura adicional

• Jeang KT (1998). "Tat, quinasa asociada a Tat y transcripción". J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7. doi : 10.1007 / BF02253352 . PMID  9570510 .
• Yankulov K, Bentley D (1998). "Control transcripcional: cofactores Tat y alargamiento transcripcional". Curr. Biol . 8 (13): R447–9. doi : 10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1 . PMID  9651670 . S2CID  15480646 .
• Romano G, Kasten M, De Falco G, Micheli P, Khalili K, Giordano A (2000). "Funciones reguladoras de Cdk9 y de ciclina T1 en la expresión génica de la vía de transactivación de tat del VIH". J. Cell. Biochem . 75 (3): 357–68. doi : 10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K . PMID  10536359 .
• Szentirmay MN, Sawadogo M (2000). "Organización espacial de la transcripción de la ARN polimerasa II en el núcleo" . Ácidos nucleicos Res . 28 (10): 2019–25. doi : 10.1093 / nar / 28.10.2019 . PMC  105382 . PMID  10773068 .
• Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). "Múltiples modos de regulación transcripcional por el transactivador Tat del VIH-1". IUBMB Life . 51 (3): 175–81. doi : 10.1080 / 152165401753544241 . PMID  11547919 . S2CID  10931640 .