• de unión a ADN • específica de la secuencia de ADN de unión • dominio de la proteína de unión específica • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 actividad del factor de transcripción de unión a ADN • zinc ion de unión • GO: 0001077, GO: 0001212, GO : 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ADN vinculante actividad del activador de la transcripción, la ARN polimerasa II-específico • de unión de iones metálicos • GO: 0000980 ARN polimerasa II reguladora en cis de unión a ADN de la región secuencia-específica • la actividad del receptor de la hormona esteroide • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Actividad represora de la transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 actividad del receptor nuclear • GO: 0001948 unión a proteínas • unión a fármacos • RNA polimerasa II que reprime unión al factor de transcripción • unión a enzima conjugadora de ubiquitina • unión a lípidos • unión al factor de transcripción • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 actividad del factor de transcripción de unión a ADN, ARN polimerasa II-específico • señalización actividad del receptor • GO: 0032403 macromolecular complejo de unión • transcripción coactivador de unión • unión fosfatasa • unión a proteínas NFAT • Proteína de la familia MDM2 / MDM4 unión • transcripción región reguladora de unión a ADN específica de secuencia • de unión de ARN polimerasa II de ADN específica de secuencia región reguladora • unión a ácidos grasos • ligando dependiente de la actividad de transcripción coactivador receptor nuclear
Componente celular
• núcleo celular • nucleoplasma • complejo de factor de transcripción de ARN polimerasa II
Proceso biológico
• proceso metabólico de las lipoproteínas • regulación negativa de la transcripción de pri-miARN del promotor de la ARN polimerasa II • regulación positiva de la beta-oxidación de ácidos grasos • regulación negativa del proceso glucolítico • respuesta a la hipoxia • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • regulación negativa de la presión arterial • metabolismo de lípidos • proceso rítmico • cicatrización de heridas • regulación negativa de la adhesión célula-célula leucocitaria • regulación negativa de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • transporte de ácidos grasos • regulación negativa de la unión a proteínas • regulación negativa del apetito • regulación circadiana de la expresión génica • transcripción, plantilla de ADN • proceso metabólico de ácidos grasos • respuesta conductual a la nicotina • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • regulación negativa del almacenamiento de colesterol • respuesta a insulina • desarrollo del corazón • vía de señalización del receptor intracelular • regulación negativa de la unión al ADN de la región reguladora de la transcripción • regulación negativa del secuestro de triglicéridos • regulación del ritmo circadiano • regulación del proceso metabólico de los ácidos grasos • desarrollo de la epidermis • regulación de la expresión génica • mineralización del esmalte • regulación positiva de la gluconeogénesis • iniciación de la transcripción a partir del promotor de la ARN polimerasa II • regulación negativa de la respuesta inflamatoria • regulación negativa de la diferenciación de células espumosas derivadas de macrófagos • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • vía de señalización mediada por hormonas esteroides • regulación negativa de la muerte neuronal • regulación positiva de la oxidación de ácidos grasos • regulación del proceso metabólico de lípidos • transducción de señales • desarrollo de organismos multicelulares • vía de señalización mediada por hormonas • diferenciación celular • respuesta a lípidos • regulación negativa de la transcripción, plantilla de ADN • regulación negativa del crecimiento celular involucrado en el corazón desarrollo de las células musculares
El receptor alfa activado por proliferador de peroxisomas ( PPAR-α ), también conocido como NR1C1 (subfamilia 1 del receptor nuclear, grupo C, miembro 1), es una proteína receptora nuclear que en humanos está codificada por el gen PPARA . [5] Junto con peroxisoma delta receptor activado por el proliferador y peroxisoma receptor gamma activado por el proliferador , PPAR-alfa es parte de la subfamilia de peroxisomas receptores activados por el proliferador . Fue el primer miembro de la familia PPAR a ser clonada en 1990 por Stephen Green, y se ha identificado como el receptor nuclear para una clase diversa de roedores hepato carcinógenosque provoca la proliferación de peroxisomas . [6]
Contenido
1 expresión
2 Función
3 Distribución tisular
4 estudios de knockout
5 Farmacología
6 genes diana
7 Interacciones
8 Véase también
9 referencias
10 Lecturas adicionales
Expresión [ editar ]
PPAR-α se activa principalmente mediante la unión de ligandos. Los ligandos endógenos incluyen ácidos grasos como el ácido araquidónico, así como otros ácidos grasos poliinsaturados y varios compuestos derivados de ácidos grasos como ciertos miembros de la familia de metabolitos del ácido araquidónico del ácido 15-hidroxiicosatetraenoico , por ejemplo, 15 ( S ) -HETE, 15 (R ) -HETE, y 15 (S) -HpETE y ácido 13-hidroxioctadecadienoico , un metabolito del ácido linoleico . Los ligandos sintéticos incluyen los fármacos fibratos , que se utilizan para tratar la hiperlipidemia , y un conjunto diverso de insecticidas, herbicidas, plastificantes y disolventes orgánicos denominados colectivamente proliferadores de peroxisomas.
Función [ editar ]
Transcriptoma de PPARalpha de hígado de ratón
Transcriptoma de hepatocitos humanos PPARalpha
PPAR-α es un factor de transcripción y un importante regulador del metabolismo de los lípidos en el hígado. El PPAR-alfa se activa en condiciones de privación de energía y es necesario para el proceso de cetogénesis , una respuesta adaptativa clave al ayuno prolongado. [7] [8] La activación de PPAR-alfa promueve la captación, utilización y catabolismo de ácidos grasos mediante la regulación positiva de genes implicados en el transporte de ácidos grasos, la unión y activación de ácidos grasos y la β-oxidación de ácidos grasos peroxisomales y mitocondriales . [9]
Distribución de tejidos [ editar ]
La expresión de PPAR-α es máxima en los tejidos que oxidan los ácidos grasos a un ritmo rápido. En roedores, los niveles más altos de expresión de ARNm de PPAR-alfa se encuentran en el hígado y el tejido adiposo marrón, seguidos del corazón y el riñón. [10] Los niveles más bajos de expresión de PPAR-alfa se encuentran en el intestino delgado y grueso, el músculo esquelético y la glándula suprarrenal. El PPAR-alfa humano parece expresarse de manera más equitativa entre varios tejidos, con una alta expresión en hígado, intestino, corazón y riñón.
Estudios de knockout [ editar ]
Los estudios que utilizan ratones que carecen de PPAR-alfa funcional indican que PPAR-α es esencial para la inducción de la proliferación de peroxisomas por un conjunto diverso de compuestos sintéticos denominados proliferadores de peroxisomas. [11] Los ratones que carecen de PPAR-alfa también tienen una respuesta deteriorada al ayuno, que se caracteriza por alteraciones metabólicas importantes, que incluyen niveles bajos de cuerpos cetónicos en plasma , hipoglucemia e hígado graso . [7]
Farmacología [ editar ]
PPAR-α es el objetivo farmacéutico de los fibratos , una clase de fármacos utilizados en el tratamiento de la dislipidemia. Los fibratos reducen eficazmente los triglicéridos séricos y aumentan los niveles séricos de colesterol HDL . [12] Aunque se han observado beneficios clínicos del tratamiento con fibratos, los resultados generales son mixtos y han generado reservas sobre la amplia aplicación de los fibratos para el tratamiento de la enfermedad coronaria , a diferencia de las estatinas . Los agonistas de PPAR-alfa pueden tener un valor terapéutico para el tratamiento de la enfermedad del hígado graso no alcohólico . PPAR-alfa también puede ser un sitio de acción de ciertos anticonvulsivos . [13] [14]
Genes diana [ editar ]
PPAR-α gobierna los procesos biológicos alterando la expresión de una gran cantidad de genes diana. En consecuencia, el papel funcional de PPAR-alfa está directamente relacionado con la función biológica de sus genes diana. Los estudios de perfiles de expresión genética han indicado que los genes diana de PPAR-alfa se cuentan por centenares. [9] Los genes diana clásicos de PPAR-alfa incluyen PDK4 , ACOX1 y CPT1 . El análisis de expresión génica de bajo y alto rendimiento ha permitido la creación de mapas completos que ilustran el papel de PPAR-alfa como regulador maestro del metabolismo de los lípidos a través de la regulación de numerosos genes implicados en varios aspectos del metabolismo de los lípidos. Estos mapas, construidos para hígado de ratón e hígado humano, colocan a PPAR-alfa en el centro de un centro regulador que afecta la captación de ácidos grasos y la unión intracelular, la oxidación β mitocondrial y la oxidación de ácidos grasos peroxisomales, la cetogénesis , el recambio de triglicéridos, la gluconeogénesis y la síntesis / secreción de bilis .
Interacciones [ editar ]
Se ha demostrado que PPAR-α interactúa con:
AIP , [15]
EP300 [16] [17]
HSP90AA1 , [15]
NCOA1 , [16] [18] y
NCOR1 . [17]
Ver también [ editar ]
Receptor activado por proliferador de peroxisoma
Fibra
Referencias [ editar ]
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Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .
vtmiGalería PDB
1i7g : ESTRUCTURA DE CRISTAL DEL DOMINIO VINCULANTE DE LIGANDA DE HUMAN PPAR-ALPHA EN COMPLEJO CON EL AGONISTA AZ 242
1k7l : La estructura cristalina de resolución de 2,5 Angstrom del dominio de unión del ligando PPARalpha humano unido con GW409544 y un péptido coactivador.
1kkq : estructura cristalina del dominio de unión a ligando de PPAR-alfa humano en complejo con un antagonista GW6471 y un motivo correpresor SMRT
2p54 : una estructura cristalina de PPAR alfa unida con el péptido SRC1 y GW735
vtmiFactores de transcripción y receptores intracelulares
(1) Dominios básicos
(1.1) Cremallera básica de leucina ( bZIP )
Factor de transcripción activador
AATF
1
2
3
4
5
6
7
AP-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
c-jun
JUNB
JunD
LLEVAR UNA VIDA DE SOLTERO
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
DBP
DDIT3
GABPA
GCN4
HLF
MAF
B
F
GRAMO
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Hélice-bucle-hélice básica ( bHLH )
Grupo A
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
MANO
1
2
MESP2
Factores reguladores miogénicos
MyoD
Miogenina
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Neurogeninas
1
2
3
OLIG
1
2
Paraxis
TCF15
Escleraxis
SLC
LYL1
TAL
1
2
Giro
Grupo B
FIGLA
Mi c
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Grupo C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
RELOJ
HIF
1A
EPAS1
3A
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Grupo D
BHLH
2
3
9
Pho4
IDENTIFICACIÓN
1
2
3
4
Grupo E
ÉL ES
1
2
3
4
5
6
7
OYE
1
2
L
Grupo F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
AP-4
MAX
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Mi c
SREBP
1
2
USF1
(1,4) NF-1
NFI
A
B
C
X
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
ESTÁ LOCO
6
7
4 )
(1,5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
ANK
(1.6) Hélice-tramo-hélice básica (bHSH)
AP-2
α
β
γ
δ
ε
(2) Dominios de unión al ADN con dedos de zinc
(2.1) Receptor nuclear (Cys 4 )
subfamilia 1
Hormona tiroidea
α
β
AUTO
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
subfamilia 2
GOLPE-TF
( Yo
II
Oreja-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Receptor testicular
2
4
TLX
subfamilia 3
Hormona esteroide
Andrógino
Estrógeno
α
β
Glucocorticoide
Mineralocorticoide
Progesterona
Relacionado con el estrógeno
α
β
γ
subfamilia 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
subfamilia 5
LRH-1
SF1
subfamilia 6
GCNF
subfamilia 0
DAX1
SHP
(2.2) Otras Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Factores de transcripción generales
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
TFIIF
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3A
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11A
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Familia Krüppel
1
2
3
DESCANSO
S1
S2
YY1
HIC
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
VENDER
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7A
7B
ZBTB
11
dieciséis
17
20
32
33
40
dedo de zinc
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35
41
43
44
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Composición alternante
AIRE
DIDO1
GRLF1
EN G
1
2
4
JARID
1A
1B
1C
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Dominios de hélice-vuelta-hélice
(3.1) Homeodominio
Clase ANTP de Antennapedia
protoHOX similar a Hox
ParaHox
Gsx
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
Hox extendido: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
B2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
tipo metaHOX NK
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
ES
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
OTAN
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
otro
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1A
1B
SIN CAJA
CUENTO
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
MEIS
1
2
PBX
1
2
3
PKNOX
1
2
SEIS
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
dieciséis
17
20
21A
Dominio de POU
PIT-1
BRN-3 : A
B
C
Factor de transcripción octamer : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Caja emparejada
PAZ
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
PHOX
2A
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Bicoide
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Cabeza de horquilla / hélice alada
E2F
1
2
3
4
5
Proteínas FOX
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Factores de choque térmico
HSF
1
2
4
(3.5) Grupos de triptófano
DUENDE
2
4
5
EGF
ALCE
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ERGIO
SPIB
ETV
1
4
5
6
FLI1
Factores reguladores del interferón
1
2
3
4
5
6
7
8
MI B
MYBL2
(3.6) Dominio TEA
factor potenciador transcripcional
1
2
3
4
(4) factores β-andamio con contactos de ranura menor
(4.1) Región de homología rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
RELA
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) ESTADÍSTICA
STAT
1
2
3
4
5
6
(4.3) similar a p53
p53 p63 p73 familia
p53
TP63
p73
TBX
1
2
3
5
19
21
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Caja MADS
Mef2
A
B
C
D
SRF
(4.6) Proteínas de unión a TATA
TBP
TBPL1
(4.7) Grupo de alta movilidad
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1A
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
TOX
1
2
3
4
(4.9) Granulado
TFCP2
(4.10) Dominio de choque frío
CSDA
YBX1
(4.11) Enano
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Otros factores de transcripción
(0,2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Dominio de bolsillo
Rb
RBL1
RBL2
(0.5) Factores relacionados con AP-2 / EREBP
Apetala 2
EREBP
B3
(0.6) Varios
ÁRIDO
1A
1B
2
3A
3B
4A
GORRA
SI YO
dieciséis
35
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
A
B
C
Rho / Sigma
ver también deficiencias de factor de transcripción / corregulador