Esta familia representa el elemento del sitio de entrada del ribosoma interno del Picornavirus (IRES) presente en su región no traducida 5 '. [1] Estos elementos se descubrieron en picornavirus. [2] Son secuencias de ARN que actúan en cis que adoptan diversas estructuras tridimensionales, reclutan la maquinaria de traducción y que a menudo operan en asociación con proteínas de unión a ARN específicas. [2] Los elementos IRES permiten la traducción de ARNm en la célula huésped de forma independiente al final y al final . Se ha descubierto que el autoantígeno La (La) es necesario para el virus Coxsackie.Traducción mediada por IRES de B3 (CVB3), y se ha sugerido que La puede ser necesaria para la traducción eficaz del ARN viral en el páncreas . [3] [4] Según su estructura secundaria, los IRES de picornavirus se agrupan en cuatro tipos principales. El tipo I comprende los enterovirus y rinovirus IRES y el tipo II, los de cardio y aftovirus, entre otros. El tipo III se usa para nombrar la hepatitis A IRES. [2]
Sitio de entrada de ribosoma interno de picornavirus (IRES) | |
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![]() Estructura secundaria prevista y conservación de la secuencia de IRES_Picorna | |
Identificadores | |
Símbolo | IRES_Picorna |
Rfam | RF00229 |
Otros datos | |
Tipo de ARN | Cis-reg ; IRES |
Dominio (s) | Virus |
IR | IR: 0043022 |
ENTONCES | Entonces: 0000243 |
Estructuras PDB | PDBe |
Referencias
- ↑ Fernández-Miragall, Olga; Quinto, Sonia López de; Martínez-Salas, Encarnación (febrero de 2009). "Relevancia de la estructura del ARN para la actividad de los elementos IRES de picornavirus". Investigación de virus . 139 (2): 172–182. doi : 10.1016 / j.virusres.2008.07.009 . PMID 18692097 .
- ^ a b c Martínez-Salas, Encarnación; Francisco-Velilla, Rosario; Fernández-Chamorro, Javier; Lozano, Gloria; Díaz-Toledano, Rosa (agosto de 2015). "Elementos IRES de picornavirus: estructura del ARN e interacciones de proteínas del huésped". Investigación de virus . 206 : 62–73. doi : 10.1016 / j.virusres.2015.01.012 . hdl : 10261/140186 . PMID 25617758 .
- ^ Ray PS, Das S (octubre de 2002). "El autoantígeno La es necesario para la traducción mediada por el sitio de entrada del ribosoma interno del ARN de Coxsackievirus B3" . Investigación de ácidos nucleicos . 30 (20): 4500–4508. doi : 10.1093 / nar / gkf583 . PMC 137146 . PMID 12384597 .
- ^ Liu Z, Carthy CM, Cheung P, Bohunek L, Wilson JE, McManus BM, Yang D (diciembre de 1999). "Análisis estructural y funcional de la región 5 'no traducida del ARN de coxsackievirus B3: estudios de infectividad y traducción in vivo de mutantes de longitud completa". Virología . 265 (2): 206–217. doi : 10.1006 / viro.1999.0048 . PMID 10600593 .
enlaces externos
- http://rfam.xfam.org/family/RF00229 Sitio de entrada de ribosoma interno de picornavirus (IRES)
- Página para el sitio de entrada de ribosoma interno de Picornavirus (IRES) en Rfam