El tracto de polipirimidina es una región de ARN pre-mensajero (ARNm) que promueve el ensamblaje del espliceosoma , el complejo proteico especializado para llevar a cabo el corte y empalme del ARN durante el proceso de modificación postranscripcional . La región es rica en nucleótidos de pirimidina , especialmente uracilo , y por lo general tiene una longitud de 15 a 20 pares de bases , ubicada entre 5 y 40 pares de bases antes del extremo 3 ' del intrón que se va a empalmar. [1]
Varios factores proteicos se unen o se asocian con el tracto de polipirimidina, incluido el componente espliceosoma U2AF y la proteína de unión al tracto de polipirimidina (PTB), que desempeña un papel regulador en el empalme alternativo . La función principal de PTB es el silenciamiento del exón , mediante el cual una región de exón particular normalmente empalmada en el ARNm maduro se deja fuera, lo que da como resultado la expresión de una isoforma de la proteína que codifica el ARNm . Debido a que el PTB se expresa de forma ubicua en muchos eucariotas superiores , se cree que suprime la inclusión de exones "débiles" con sitios de corte y empalme mal definidos . [2] Sin embargo, la unión de PTB no es suficiente para suprimir exones "robustos". [3]
La supresión o selección de exones es fundamental para la expresión adecuada de isoformas específicas de tejido . Por ejemplo, el músculo liso y el músculo esquelético expresan isoformas alternativas que se distinguen por una selección de exones mutuamente excluyente en la alfatropomiosina . [4]
Referencias
- ^ Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipursky SL, Darnell J. (2004). Biología celular molecular. WH Freeman: Nueva York, NY. 5ª ed.
- ^ Wagner EJ, García-Blanco MA. (2001). La proteína de unión al tracto de polipirimidina antagoniza la definición del exón. Mol Cell Biol 21 (10): 3281-3288.
- ^ Gooding C, Roberts GC, Smith CW. (1998). Papel de un elemento inhibidor de pirimidina y proteína de unión al tracto de polipirimidina en la represión de un exón de alfa-tropomiosina regulado. ARN 4: 85-100.
- ^ Gooding C, Roberts GC, Moreau G, Nadal-Ginard B, Smith CW. (1994). Cambio específico del músculo liso de la selección de exón de alfa-tropomiosina mutuamente excluyente mediante la inhibición específica del exón por defecto fuerte. EMBO J 13 (16): 3861-72.