• actividad del receptor de virus • constituyente estructural del ribosoma • unión a ribosomas • actividad del receptor de laminina • GO: proteína de unión 0001948 • unión de ARN • unión laminina
• Escisión endonucleolítica para generar el extremo 3 'maduro de SSU-rRNA a partir de (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • Escisión endonucleolítica en ITS1 para separar SSU-rRNA de 5.8S rRNA y LSU-rRNA del transcrito de rRNA tricistrónico (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • Transcripción viral • Proteína cotraduccional dependiente de SRP dirigida a la membrana • Iniciación de la traducción • Exportación de rRNA desde el núcleo • Entrada viral en la célula huésped • Proceso catabólico de mRNA transcrito nuclearmente, mediado por sinsentidos desintegración • biosíntesis de proteínas • GO: 0022415 proceso viral • procesamiento de rRNA • Ensamblaje de subunidades pequeñas ribosómicas • Adhesión celular • Traslación citoplásmica
Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies
Humano
Ratón
Entrez
3921
16785
Ensembl
ENSG00000168028
ENSMUSG00000032518
UniProt
P08865
P14206
RefSeq (ARNm)
NM_002295 NM_001304288
NM_011029
RefSeq (proteína)
NP_001291217 NP_002286
NP_035159
Ubicación (UCSC)
Crónicas 3: 39,41 - 39,41 Mb
Crónicas 9: 120,13 - 120,13 Mb
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La proteína 40S ribosómica SA es una proteína ribosómica que en humanos está codificada por el gen RPSA . [5] [6] También actúa como un receptor de la superficie celular , en particular para la laminina , y está involucrado en varios procesos patógenos.
Contenido
1 función
2 Estructura y estabilidad
3 Interacciones
4 referencias
5 Lecturas adicionales
Función
Las lamininas , una familia de glicoproteínas de la matriz extracelular , son el principal componente no colágeno de las membranas basales . Se les ha implicado en una amplia variedad de procesos biológicos que incluyen la adhesión celular , diferenciación , migración , señalización , crecimiento de neuritas y metástasis . Muchos de los efectos de la laminina están mediados por interacciones con los receptores de la superficie celular . Estos receptores incluyen miembros de la integrinafamilia, así como proteínas de unión a laminina que no son integrinas. El gen RPSA codifica una proteína multifuncional, que es tanto una proteína ribosómica como un receptor de laminina no integrina de alta afinidad. Esta proteína se ha denominado de forma diversa proteína ribosómica SA; RPSA; LamR; LamR1; Precursor del receptor de laminina de 37 kDa; 37LRP; Receptor de laminina de 67 kDa; 67LR; Receptor de laminina de 37/67 kDa; LRP / LR; LBP / p40; y proteína asociada a ribosoma p40. La proteína ribosómica SA y RPSA son el nombre y el símbolo aprobados. La secuencia de aminoácidos de RPSA está altamente conservada a lo largo de la evolución , lo que sugiere una función biológica clave . Se ha observado que el nivel de transcripción de RPSA es mayor en tejido de carcinoma de colon y líneas celulares de cáncer de pulmón que sus contrapartes normales. Además, existe una correlación entre la regulación positiva de este polipéptido en las células cancerosas y su fenotipo invasivo y metastásico . Existen múltiples copias del gen RPSA; sin embargo, la mayoría de ellos son pseudogenes que se cree que han surgido de eventos retroposicionales . Se han encontrado dos variantes de transcripción empalmadas alternativamente que codifican la misma proteína para este gen. [7]
Estructura y estabilidad
El ADN complementario (ADNc) del gen RPSA está formado por el ensamblaje de siete exones, seis de los cuales corresponden a la secuencia codificante. [6] La secuencia de aminoácidos de RPSA, deducida de la secuencia de su ADNc, incluye 295 residuos. RPSA se puede subdividir en dos dominios principales: un dominio N (residuos 1-209), que corresponde a los exones 2-5 del gen, y un dominio C (residuos 210-295), que corresponde a los exones 6 -7. El dominio N de RPSA es homólogo a la proteína ribosómica S2 (RPS2) de procariotas. Contiene una secuencia palindrómica 173LMWWML178 que se conserva en todos los metazoos. Su dominio C está muy conservado en vertebrados. La secuencia de aminoácidos de RPSA es 98% idéntica en todos los mamíferos. La RPSA es una proteína ribosómica que ha adquirido la función de receptor de laminina durante la evolución. [8][9] La estructura del dominio N de RPSA es similar a la del procariótico RPS2. [10] El dominio C está intrínsecamente desordenado en solución. El dominio N es monomérico en solución y se despliega de acuerdo con un equilibrio de tres estados. El intermedio de plegado predomina a 37 ° C. [11]
Interacciones
Varias interacciones de RPSA que se habían descubierto originalmente mediante métodos de biología celular, se han confirmado posteriormente mediante el uso de derivados recombinantes y experimentos in vitro. Estos últimos han demostrado que el dominio N plegado y el dominio C desordenado de RPSA tienen funciones tanto comunes como específicas. [12]
RPSA se une a proteínas que participan en la traducción del código genético. (i) Los cribados de dos híbridos de levadura han demostrado que RPSA se une a la proteína ribosómica S21 de la subunidad ribosómica pequeña 40S. [13] [14] (ii) Las deleciones en serie de RPSA han demostrado que el segmento de residuos 236-262, incluido en el dominio C, está involucrado en la interacción entre RPSA y la subunidad 40S del ribosoma. [15] (iii) Los estudios que se basaron en la espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN), han demostrado que el dominio de unión al anticodón de la lisil-tRNA sintetasa se une directamente al dominio C de RPSA. [dieciséis]
La RPSA se identificó inicialmente como una proteína de unión a laminina. [17] [18] Tanto el dominio N recombinante como el dominio C de RPSA se unen a laminina in vitro y se unen con constantes de disociación similares (300 nM). [10] [12]
Tanto la RPSA como la laminina pertenecen al interactoma heparina / heparán sulfato. [19] La heparina se une in vitro al dominio N de RPSA pero no a su dominio C. Además, el dominio C de RPSA y la heparina compiten por la unión a la laminina, lo que muestra que el dominio C altamente ácido de RPSA imita a la heparina (y potencialmente a los heparán sulfatos) por la unión a la laminina. [12]
RPSA es un receptor celular potencial para varios flavivirus patógenos , incluido el virus del dengue (DENV), [20] [21] y los alfavirus , incluido el virus Sindbis (SINV). [22] El dominio N de RPSA incluye un sitio de unión para SINV in vitro. [10] El dominio N también incluye sitios de unión débiles para el dominio recombinante 3 (ED3, residuos 296-400) de las proteínas de la envoltura de dos Flavivirus , el virus del Nilo Occidental y el serotipo 2 de DENV. El dominio C incluye sitios de unión débiles para el dominio 3 del virus de la fiebre amarilla (YFV) y de los serotipos 1 y 2 de DENV. Por el contrario, el dominio 3 del virus de la encefalitis japonesa no parece unirse a RPSA in vitro. [12]
RPSA también es un receptor de moléculas pequeñas. (i) RPSA se une a la aflatoxina B1 tanto in vivo como in vitro. [23] (ii) RPSA es un receptor de galato de epigalocatequina (EGCG), que es un componente principal del té verde y tiene muchos efectos relacionados con la salud. [24] [25] EGCG se une solo al dominio N de RPSA in vitro, con una constante de disociación de 100 nM, pero no a su dominio C. [12]
Referencias
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