Bat coronavirus RaTG13 es un betacoronavirus similar al SARS que infecta al murciélago de herradura Rhinolophus affinis . [2] [3] Fue descubierto en 2013 en excrementos de murciélago de una cueva minera cerca de la ciudad de Tongguan en el condado de Mojiang en Yunnan , China . A partir de 2020 [actualizar], es el pariente más cercano conocido del SARS-CoV-2 , el virus que causa el COVID-19 . [4] [5]
BatCoV RaTG13 | |
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Clasificación de virus | |
(no clasificado): | Virus |
Reino : | Riboviria |
Reino: | Orthornavirae |
Filo: | Pisuviricota |
Clase: | Pisoniviricetes |
Pedido: | Nidovirales |
Familia: | Coronaviridae |
Género: | Betacoronavirus |
Subgénero: | Sarbecovirus |
Especies: | |
Presion: | BatCoV RaTG13 |
Sinónimos [1] | |
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Descubrimiento
En la primavera de 2012, tres mineros que limpiaban heces de murciélago en una mina de cobre abandonada cerca de la ciudad de Tongguan en el condado autónomo de Mojiang Hani desarrollaron una neumonía mortal . [6] Las muestras de suero recolectadas de los mineros se enviaron al Instituto de Virología de Wuhan y fueron analizadas por Shi Zhengli y su grupo para detectar el virus del Ébola , el virus Nipah y el murciélago SARSr-CoV Rp3. Las muestras dieron negativo. [3] [7] [6]
Para descubrir la posible causa de la infección, se tomaron muestras de diferentes animales (incluidos murciélagos, ratas y musarañas almizcleras ) dentro y alrededor de la cueva minera. Entre 2012 y 2015, Shi Zhengli y su grupo aislaron 293 coronavirus diversos (284 alfacoronavirus y 9 betacoronavirus ) de muestras de heces de murciélago en la cueva. Una de las muestras recolectadas en 2013 de heces de murciélago Rhinolophus affinis fue el coronavirus de murciélago RaTG13. El nombre de la cepa se derivó de la especie de murciélago de origen, la ubicación geográfica y el año de recolección. [3] [7]
En 2020, Shi y su grupo volvieron a analizar las muestras de suero de los mineros para detectar el SARS-CoV-2. Las muestras dieron negativo. [3]
Virología
RaTG13 es un virus de ARN de cadena positiva con una membrana externa. Su genoma es de aproximadamente 29.800 nucleótidos. El genoma codifica una replicasa (ORF1a / 1b) y cuatro proteínas estructurales; incluyendo una proteína de pico (S), proteína de membrana (M), proteína de membrana externa (E) y proteína de cápside (N); y cinco proteínas auxiliares no estructurales, incluidas NS3, NS6, NS7a, NS7b y NS8, que son comunes en los coronavirus . [8]
RaTG13 tiene un gran parecido con el virus SARS-CoV-2 (comparte una similitud de nucleótidos del 96,1%), y su existencia es una prueba que respalda el origen natural del SARS-CoV-2. [9] La diferencia entre RaTG13 y SARS-CoV-2 está en el dominio de unión al receptor (RBD) de la proteína de pico (S), que es la porción que se une a la proteína receptora en la superficie de la célula huésped y causa infección, lo que indica que el virus RaTG13 podría no usar la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) como su sitio de entrada en la célula como lo hace el SARS-CoV-2. [10] Además, la proteína S del virus RaTG13 carece del motivo de escisión de furina RRAR ↓ S. [10]
Filogenético
En enero de 2021, el árbol filogenético basado en secuencias del genoma completo del coronavirus relacionado con el SARS-CoV-2 es: [11] [12]
Coronavirus relacionado con el SARS-CoV-2 |
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SARS-CoV-1 , 79% a SARS-COV-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ver también
- Murciélago coronavirus similar al SARS RsSHC014
- Murciélago coronavirus similar al SARS WIV1
- Virus Mòjiāng
Referencias
- ^ "Navegador de taxonomía (Bat coronavirus RaTG13)" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 2 de enero de 2021 .
- ^ Ge XY, Wang N, Zhang W y col. (Febrero de 2016). "Coexistencia de múltiples coronavirus en varias colonias de murciélagos en una mina abandonada" . Virologica Sinica . 31 (1): 31–40. doi : 10.1007 / s12250-016-3713-9 . PMC 7090819 . PMID 26920708 .
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- ^ Poudel U, Subedi D, Pantha S y col. (Octubre de 2020). "Coronavirus animales y enfermedad de coronavirus 2019: lección para el enfoque de una sola salud" . Revista veterinaria abierta . 10 (3): 239-251. doi : 10.4314 / ovj.v10i3.1 . PMC 7703617 . PMID 33282694 .
- ^ Xiao C, Li X, Liu S y col. (2020). "El VIH-1 no contribuyó al genoma de 2019-nCoV" . Microbios e infecciones emergentes . 9 (1): 378–381. doi : 10.1080 / 22221751.2020.1727299 . PMC 7033698 . PMID 32056509 .
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