Nidovirales es un orden de envoltura , los virus de cadena positiva de ARN que infectan a los vertebrados y los invertebrados . Los organismos hospedadores incluyen mamíferos , aves , reptiles , anfibios , peces , artrópodos , moluscos y helmintos . [1] El orden incluye las familias Coronaviridae , Arteriviridae , Ronivíridos , y Mesoniviridae . [2]
Nidovirales | |
---|---|
Ciclo de vida de los nidovirus | |
Clasificación de virus | |
(no clasificado): | Virus |
Reino : | Riboviria |
Reino: | Orthornavirae |
Filo: | Pisuviricota |
Clase: | Pisoniviricetes |
Pedido: | Nidovirales |
Miembros virus tienen una envoltura viral y una de sentido positivo , de una sola cadena genoma de ARN que se tapó y poliadenilado . [3] Los nidovirus reciben el nombre del latín nidus , que significa nido, ya que todos los virus en este orden producen un conjunto anidado co-terminal 3 'de ARNm subgenómicos durante la infección. [4]
Virología
El orden Nidovirales consta de los virus que tienen de sentido positivo , genomas de ARN monocatenario. Los virus pertenecen al Grupo IV del sistema de clasificación de Baltimore . Como genomas de sentido positivo, los virus pueden utilizar algunas proteínas de la célula huésped durante la replicación y expresión génica que se produce en el citoplasma de la célula huésped.
Este grupo de virus expresa proteínas estructurales por separado de las no estructurales. Las proteínas estructurales están codificadas en la región 3 'del genoma y se expresan a partir de un conjunto de ARNm subgenómicos . Estos virus codifican una proteinasa principal y entre una y tres proteinasas accesorias que participan principalmente en la expresión del gen de la replicasa . Estas proteinasas también son responsables de activar o inactivar proteínas específicas en el momento correcto del ciclo de vida del virus, asegurando que la replicación se produzca en el momento adecuado.
Se han identificado muchas proteínas en los genomas de Nidovirales , pero aún no se ha determinado su función. Otras enzimas que pueden estar presentes en el genoma incluyen las actividades de proteasas de tipo papaína , unión de ADP-ribosa / poli (ADP-ribosa) o ADP-ribosa 1 '' - fosfato fosfatasa y nucleótidos cíclicos fosfodiesterasa .
La mayoría, pero no todos, los ARN subgenómicos de nidovirus contienen una secuencia líder 5 'derivada del extremo 5' del ARN genómico.
El cambio de marco que genera el cambio de marco de ORF 1b se produce en una secuencia "resbaladiza" de heptanucleótidos UUUAAAC situada corriente arriba del codón de parada ORF1a y una estructura de pseudonudo de ARN putativo .
Genoma
Este orden de virus se puede distinguir de otros virus de ARN por una constelación de siete dominios conservados: 5'-TM2-3CLpro-TM3-RdRp-Zm-HEL1-NendoU-3 ', con los tres primeros codificados en ORF1a y los restantes cuatro en ORF1b. TM2 y TM3 y dominios transmembrana; RdRp es la ARN polimerasa; Zm es un dominio de unión de grupo de Zn fusionado con una helicasa (HEL1); 3CLpro es una proteasa similar a 3C ; y NendoU es una endonucleasa específica de uridilato . El 3CLpro tiene una díada catalítica His - Cys y está relacionado con la proteinasa principal del coronavirus del SARS (Mpro).
Taxonomía
El orden Nidovirales se puede dividir en dos clados dependiendo del tamaño del genoma: aquellos con genomas grandes (26,3 a 31,7 kilobases) que incluían Coronaviridae y Roniviridae (los nidovirus grandes) y aquellos con genomas pequeños (los nidovirus pequeños) —a clado que incluye Arteriviridae, parientes lejanos (12,7–15,7 kb). Las grandes nidovirus codifican tanto un 2'-O- metiltransferasa y un 3 'a 5' exoribonuclease (exón) -el siendo este último muy inusual para un virus de ARN. También codifican una helicasa de la superfamilia 1 , una endonucleasa específica de uridilato (una enzima exclusiva de los nidovirus) y varias proteasas.
Se reconocen los siguientes subórdenes y familias (- virineae denota subórdenes y - viridae denota familias): [5]
- Abnidovirineae
- Abyssoviridae
- Arnidovirineae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Gresnaviridae
- Olifoviridae
- Cornidovirineae
- Coronaviridae
- Mesnidovirineae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Monidovirineae
- Mononiviridae
- Nanidovirinae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Ronidovirineae
- Euroniviridae
- Roniviridae
- Tornidovirineae
- Tobaniviridae
Adiciones
El virus que tiene el genoma de ARN no segmentado más grande conocido de 41,1 kb, el nidovirus de células secretoras planarias (PSCNV), es del orden Nidovirales. [6] Su anfitrión es el gusano plano planario . [7]
Ver también
- Virus animales
- Virus de ARN
- Coronavirus
- Arterivirus
Referencias
- ↑ Ogando, Natacha S .; Ferron, Francois; Decroly, Etienne; Canard, Bruno; Posthuma, Clara C .; Snijder, Eric J. (2019). "El curioso caso de la exoribonucleasa de nidovirus: su papel en la síntesis de ARN y la fidelidad de la replicación" . Fronteras en microbiología . 10 : 1813. doi : 10.3389 / fmicb.2019.01813 . ISSN 1664-302X . PMC 6693484 . PMID 31440227 .
- ^ "Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV)" . talk.ictvonline.org . Consultado el 8 de junio de 2020 .
- ^ King, Andrew MQ; Adams, Michael J .; Carstens, Eric B .; Lefkowitz, Elliot J., eds. (2012-01-01), "Order - Nidovirales" , Virus Taxonomy , Elsevier, págs. 784–794, ISBN 978-0-12-384684-6, consultado el 8 de junio de 2020
- ^ Antoine AF de Vries, Marian C. Horzinek, Peter JM Rottier, Raoul J. de Groot (1997). "La organización del genoma de los Nidovirales: similitudes y diferencias entre arteri, toro y coronavirus". Seminarios de Virología . 8 (1): 33–47. CiteSeerX 10.1.1.462.1825 . doi : 10.1006 / smvy.1997.0104 . S2CID 85383257 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ "Taxonomía de virus: versión 2019" . talk.ictvonline.org . Comité Internacional de Taxonomía de Virus . Consultado el 30 de abril de 2020 .
- ^ "Navegador de taxonomía (Planidovirus 1)" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 8 de junio de 2020 .
- ^ Saberi, Amir; Gulyaeva, Anastasia A .; Brubacher, John L .; Newmark, Phillip A .; Gorbalenya, Alexander E. (1 de noviembre de 2018). "Un nidovirus planario amplía los límites del tamaño del genoma del ARN" . PLOS Patógenos . 14 (11): e1007314. doi : 10.1371 / journal.ppat.1007314 . ISSN 1553-7374 . PMC 6211748 . PMID 30383829 .
- Ziebuhr, J; Snijder, EJ; Gorbalenya, AE (abril de 2000). "Proteinasas codificadas por virus y procesamiento proteolítico en los Nidovirales" (PDF) . La Revista de Virología General . 81 (Pt 4): 853–79. doi : 10.1099 / 0022-1317-81-4-853 . PMID 10725411 . Archivado desde el original (PDF) el 16 de diciembre de 2008 . Consultado el 23 de febrero de 2007 .
enlaces externos
- Nidovirales —ICTVdB — The Universal Virus Database, versión 4.
- Nidovirales en los encabezados de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- NIH / MeSH
- "Los Nidovirus" ISBN 0306466341