Alphacoronaviruses (alfa-CoV) son miembros de la primera de las cuatro géneros ( alfa -, beta- , Gamma y Delta- ) de los coronavirus . Ellos son de sentido positivo , monocatenarios virus de ARN que infectan a mamíferos , incluyendo seres humanos . Tienen viriones esféricos con proyecciones superficiales en forma de maza y una envoltura viral .
Alfacoronavirus | |
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Genoma del virus de la diarrea epidémica porcina y estructura del virión | |
Clasificación de virus | |
(no clasificado): | Virus |
Reino : | Riboviria |
Reino: | Orthornavirae |
Filo: | Pisuviricota |
Clase: | Pisoniviricetes |
Pedido: | Nidovirales |
Familia: | Coronaviridae |
Subfamilia: | Orthocoronavirinae |
Género: | Alfacoronavirus |
Subgéneros y especies | |
Los alfacoronavirus pertenecen a la subfamilia Orthocoronavirinae de la familia Coronaviridae . Tanto el linaje Alfa como el Betacoronavirus descienden del acervo genético viral del murciélago . [1] [2] [3] Los alfacoronavirus se conocían anteriormente como " coronavirus del phylogroup 1".
Etimología
El nombre alfacoronavirus se deriva del griego antiguo ἄλφα ( álpha , "la primera letra del alfabeto griego ") y κορώνη (korṓnē, "guirnalda, guirnalda"), que significa corona, que describe la apariencia de las proyecciones superficiales vistas bajo microscopía electrónica que se asemejan a una corona solar . [4]
Estructura
El virión está envuelto y es esférico y mide entre 120 y 160 nm de diámetro y una capa central de aproximadamente 65 nm. Las glicoproteínas y los trímeros forman grandes proyecciones superficiales que crean la apariencia de corona solar. Este género, como otros coronavirus, tiene una proteína de pico con una máquina de fusión tipo II (S2) y un dominio de unión al receptor (S1). Se ensambla en un trimer. A diferencia de los beta y gammacoronavirus, esta proteína no se divide en dos mitades. [5]
Genoma
El genoma está de sentido positivo , de una sola hebra de ARN con una longitud de 27 a 29 kilobases y una cola 3 'poliA. Dos grandes ORF superpuestos en el extremo 5 'del genoma codifican las principales proteínas no estructurales expresadas como una proteína de fusión por desplazamiento del marco ribosómico . Estos incluyen regiones con motivos de proteasa , helicasa y ARN polimerasa. Hay otros siete genes aguas abajo que codifican proteínas estructurales. Estos se expresan a partir de un conjunto anidado en 3 'coterminal de ARNm subgenómicos .
Recombinación
Se sabe que ambos tipos de alfacoronavirus 1 , coronavirus felino (FCoV) y coronavirus canino (CCoV), existen en dos serotipos. El serotipo II se dirige a la aminopeptidasa N , mientras que se desconoce el receptor del serotipo I. La diferencia se debe a una proteína de pico diferente. [7] Existe un ancestro común para FCoV y CCoV. Este ancestro evolucionó gradualmente en FCoV I y CCoV I. Una proteína S de un virus desconocido se recombinó en el ancestro y dio lugar a CCoV II. CCoV II se recombinó una vez más con FCoV para crear FCoV II. CCoV II evolucionó gradualmente a TGEV. Una eliminación de picos en TGEV crea PRCV. Todos estos virus se clasifican en el subgénero Tegacovirus . [7]
Clasificación
Se reconocen los siguientes subgéneros y especies: [8]
- Colacovirus
- Murciélago coronavirus CDPHE15
- Decacovirus
- Murciélago coronavirus HKU10
- Rhinolophus ferrumequinum alfacoronavirus HuB-2013
- Duvinacovirus
- Coronavirus humano 229E
- Luchacovirus
- Coronavirus de rata Lucheng Rn
- Minacovirus
- Coronavirus de visón 1
- Coronavirus de hurón
- Coronavirus de visón 1
- Minunacovirus
- Coronavirus del murciélago miniopterus 1
- Miniopterus murciélago coronavirus HKU8
- Myotacovirus
- Myotis ricketti alfacoronavirus Sax-2011
- Nyctacovirus
- Nyctalus velutinus alfacoronavirus SC-2013
- Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398
- Pedacovirus
- Virus de la diarrea epidémica porcina
- Coronavirus 512 del murciélago Scotophilus
- Rinacovirus
- Coronavirus del murciélago Rhinolophus HKU2
- Setracovirus
- Coronavirus humano NL63
- Cepa BtKYNL63-9b de coronavirus de murciélago relacionada con NL63
- Soracovirus
- Sorex araneus coronavirus T14
- Sunacovirus
- Coronavirus X74 de Suncus murinus
- Tegacovirus
- Alfacoronavirus 1
- Coronavirus canino
- Coronavirus felino
- Human CCoV-HuPn-2018
- Coronavirus de gastroenteritis transmisible porcina
- Alfacoronavirus 1
Ver también
- Betacoronavirus
- Coronavirus
- Virus de ARN
Referencias
- ^ Woo, PC; Wang, M .; Lau, SK; Xu, H .; Poon, RW; Guo, R .; Wong, BH; Gao, K .; Tsoi, HW; Huang, Y .; Li, KS; Lam, CS; Chan, KH; Zheng, BJ; Yuen, KY (2007). "El análisis comparativo de doce genomas de tres nuevos coronavirus del grupo 2c y del grupo 2d revela características únicas de grupo y subgrupo" . Revista de Virología . 81 (4): 1574–85. doi : 10.1128 / JVI.02182-06 . PMC 1797546 . PMID 17121802 .
- ^ Lau, SK; Woo, PC; Yip, CC; Fan, RY; Huang, Y .; Wang, M .; Guo, R .; Lam, CS; Tsang, AK; Lai, KK; Chan, KH; Che, XY; Zheng, BJ; Yuen, KY (2012). "Aislamiento y caracterización de un nuevo coronavirus del subgrupo A de Betacoronavirus, coronavirus de conejo HKU14, de conejos domésticos" . Revista de Virología . 86 (10): 5481–96. doi : 10.1128 / JVI.06927-11 . PMC 3347282 . PMID 22398294 .
- ^ Lau, SK; Poon, RW; Wong, BH; Wang, M .; Huang, Y .; Xu, H .; Guo, R .; Li, KS; Gao, K .; Chan, KH; Zheng, BJ; Woo, PC; Yuen, KY (2010). "Coexistencia de diferentes genotipos en un mismo murciélago y caracterización serológica del coronavirus HKU9 del murciélago Rousettus perteneciente a un nuevo subgrupo de Betacoronavirus" . Revista de Virología . 84 (21): 11385–94. doi : 10.1128 / JVI.01121-10 . PMC 2953156 . PMID 20702646 .
- ^ Decaro, Nicola (2011). "Alfacoronavirus". El índice de virus de Springer . págs. 371–383. doi : 10.1007 / 978-0-387-95919-1_56 . ISBN 978-0-387-95918-4.
- ^ Wrapp, Daniel; McLellan, Jason S .; Gallagher, Tom (13 de noviembre de 2019). "La estructura de microscopía crioelectrónica de 3,1 Angstrom de la proteína de pico del virus de la diarrea epidémica porcina en la conformación de prefusión" . Revista de Virología . 93 (23): e00923-19. doi : 10.1128 / JVI.00923-19 . PMC 6854500 . PMID 31534041 .
- ^ Le Poder, Sophie (31 de julio de 2011). "Coronavirus felinos y caninos: características genéticas y patobiológicas comunes" . Avances en virología . Consultado el 29 de junio de 2020 .
- ^ a b Jaimes, Javier A .; Mijo, Jean K .; Stout, Alison E .; André, Nicole M .; Whittaker, Gary R. (10 de enero de 2020). "Una historia de dos virus: las glicoproteínas puntiagudas distintas de los coronavirus felinos" . Virus . 12 (1): 83. doi : 10.3390 / v12010083 . PMC 7019228 . PMID 31936749 .
- ^ "Taxonomía de virus: versión 2019" . talk.ictvonline.org . Comité Internacional de Taxonomía de Virus . Consultado el 20 de junio de 2020 .
enlaces externos
- http://viralzone.expasy.org/all_by_protein/766.html