La variante Epsilon , también conocida como CAL.20C y se refiere a dos linajes PANGO B.1.427 y B.1.429 , es una de las variantes del SARS-CoV-2 , el virus que causa el COVID-19 . Se detectó por primera vez en California , EE. UU., En julio de 2020. [1]
![](http://wikiimg.tojsiabtv.com/wikipedia/commons/thumb/5/58/Epsilon_variant_countries.svg/330px-Epsilon_variant_countries.svg.png)
Leyenda:
A partir de julio de 2021, la OMS ya no considera a Epsilon como una variante de interés. [2]
Mutaciones
La variante tiene cinco mutaciones definitorias (I4205V y D1183Y en el gen ORF1ab, y S13I, W152C, L452R en el gen S de la proteína de pico ), [3] de las cuales L452R (previamente también detectado en otros linajes no relacionados) fue de especial preocupación. [4] B.1.429 es posiblemente más transmisible que las variantes anteriores que circulan localmente, pero se necesitan más estudios para confirmarlo. [4] Los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) han incluido B.1.429 y el B.1.427 relacionado como " variantes de preocupación ", y cita una preimpresión para decir que exhiben un aumento de ~ 20% en la transmisibilidad viral, que tienen un "impacto significativo en la neutralización de algunas, pero no todas" las terapias que han recibido Autorización de uso de emergencia (EUA) por la Administración de Alimentos y Medicamentos (FDA) para el tratamiento o la prevención de COVID-19, y que reducen moderadamente la neutralización por plasma recolectado por personas que han sido previamente infectadas por el virus o que han recibido una vacuna contra el virus. [5] [6] En mayo de 2021, la Organización Mundial de la Salud (OMS) le dio a la variante el nuevo nombre 'variante Epsilon'. [7]
Mutaciones de aminoácidos de la variante de Epsilon del SARS-CoV-2 representadas en un mapa del genoma del SARS-CoV-2 con un enfoque en el pico. [8]
Historia
Epsilon (CAL.20C) fue observado por primera vez en julio de 2020 por investigadores del Centro Médico Cedars-Sinai , California , en una de las 1,230 muestras de virus recolectadas en el condado de Los Ángeles desde el inicio de la epidemia de COVID-19 . [1] No se volvió a detectar hasta septiembre, cuando reapareció entre las muestras en California, pero los números se mantuvieron muy bajos hasta noviembre. [9] [10] En noviembre de 2020, la variante Epsilon representó el 36 por ciento de las muestras recolectadas en el Centro Médico Cedars-Sinai, y para enero de 2021, la variante Epsilon representó el 50 por ciento de las muestras. [4] En un comunicado de prensa conjunto de la Universidad de California, San Francisco , Departamento de Salud Pública de California , y el Departamento de Salud Pública del Condado de Santa Clara , [11] se anunció que la variante también se detectó en varios condados del norte de California. De noviembre a diciembre de 2020, la frecuencia de la variante en casos secuenciados del norte de California aumentó del 3% al 25%. [12] En una preimpresión, CAL.20C se describe como perteneciente al clado Nextstrain 20C y aporta aproximadamente el 36% de las muestras, mientras que una variante emergente del clado 20G representa aproximadamente el 24% de las muestras en un estudio centrado en el sur de California. Sin embargo, tenga en cuenta que en los EE. UU. En su conjunto, el clado 20G predomina, a partir de enero de 2021. Tras el número creciente de Epsilon en California, la variante se ha detectado con frecuencias variables en la mayoría de los estados de EE. UU. Se han detectado pequeñas cantidades en otros países de América del Norte y en Europa, Asia y Australia. [9] [10] Después de un aumento inicial, su frecuencia se redujo rápidamente a partir de febrero de 2021, ya que estaba siendo superada por la variante Alpha más transmisible . En abril, Epsilon seguía siendo relativamente frecuente en partes del norte de California, pero prácticamente había desaparecido del sur del estado y nunca había podido establecerse en otro lugar; solo el 3,2% de todos los casos en los Estados Unidos eran épsilon, mientras que para entonces más de dos tercios eran alfa. [13]
Estadísticas
Casos por país (actualizado a 1 de julio de 2021) GISAID [14] | ||
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País | Casos confirmados | Último caso informado |
EE.UU | 50,723 | 23 de junio de 2021 |
México | 474 | 08 junio 2021 |
Canadá | 326 | 07 de mayo de 2021 |
Corea del Sur | 103 | 26 de abril de 2021 |
Aruba | 57 | 24 de abril de 2021 |
Dinamarca | 37 | 22 de marzo de 2021 |
Chile | 30 | 07 de junio de 2021 |
Argentina | 28 | 12 de mayo de 2021 |
Reino Unido | 21 | 10 de mayo de 2021 |
Japón | 20 | 16 de abril de 2021 |
Australia | 20 | 12 de abril de 2021 |
Costa Rica | 12 | 05 mayo 2021 |
Alemania | 10 | 08 junio 2021 |
Israel | 10 | 25 de febrero de 2021 |
Guam | 8 | 27 de marzo de 2021 |
Taiwán | 8 | 31 de enero de 2021 |
Guatemala | 7 | |
Francia | 7 | 01 marzo 2021 |
Irlanda | 7 | 28 de abril de 2021 |
Países Bajos | 5 | 10 de marzo de 2021 |
España | 5 | 03 junio 2021 |
Nueva Zelanda | 4 | 28 de diciembre de 2020 |
Singapur | 4 | 27 de marzo de 2021 |
Suiza | 4 | 01 marzo 2021 |
Camerún | 3 | 05 de febrero de 2021 |
Guadalupe | 3 | 30 de enero de 2021 |
Noruega | 3 | 12 de abril de 2021 |
Camboya | 2 | 20 de enero de 2021 |
Finlandia | 2 | 06 de febrero de 2021 |
Italia | 2 | 11 de febrero de 2021 |
Perú | 2 | 24 de febrero de 2021 |
Suecia | 2 | 28 de enero de 2021 |
pavo | 2 | 11 de febrero de 2021 |
Islas Turcas y Caicos | 2 | 22 de marzo de 2021 |
Colombia | 2 | 08 de enero de 2021 |
Anguila | 1 | 19 de marzo de 2021 |
Antigua y Barbuda | 1 | 24 de abril de 2021 |
Barbados | 1 | 12 de abril de 2021 |
Bélgica | 1 | 18 de enero de 2021 |
Islas Vírgenes Británicas | 1 | 07 de enero de 2021 |
Curacao | 1 | 19 de marzo de 2021 |
India | 1 | 02 marzo 2021 |
Macedonia del Norte | 1 | 26 de enero de 2021 |
Islas Marianas del Norte | 1 | 16 de enero de 2021 |
Sint Maarten | 1 | 16 de febrero de 2021 |
República Dominicana | 1 | |
Mundo (46 países) | Total: 51.966 | Total al 1 de julio de 2021 |
Ver también
Referencias
- ^ a b "Cepa COVID-19 local encontrada en más de un tercio de los pacientes de Los Ángeles" . noticias sabias (Comunicado de prensa). California: Centro Médico Cedars Sinai. 19 de enero de 2021 . Consultado el 3 de marzo de 2021 .
- ^ "Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2" . quien.int . Organización Mundial de la Salud.
- ↑ Spike Variants: Epsilon, también conocido como B.1.427 / B.1.429, y CAL.20C / S: 452R covdb.stanford.edu , consultado el 3 de julio de 2021
- ^ a b c "Nueva variante de California puede estar impulsando la oleada de virus allí, sugiere un estudio" . The New York Times . 19 de enero de 2021.
- ^ "Clasificaciones y definiciones de variantes del SARS-CoV-2" . CDC.gov . Centros de Control y Prevención de Enfermedades. 24 de marzo de 2021 . Consultado el 4 de abril de 2021 .
- ^ Shen X, Tang H, Pajon R, Smith G, Glenn GM, Shi W, et al. (Abril de 2021). "Neutralización de las variantes B.1.429 y B.1.351 del SARS-CoV-2" . La Revista de Medicina de Nueva Inglaterra . 384 (24): 2352–2354. doi : 10.1056 / NEJMc2103740 . PMC 8063884 . PMID 33826819 .
- ^ Helen Branswell El juego de nombres para las variantes del coronavirus se ha vuelto un poco más fácil 31 de mayo de 2021 www.statnews.com , consultado el 28 de junio de 2021
- ^ "Variantes de pico: variante de Epsilon, también conocida como B.1.427 / B.1.429" . covdb.stanford.edu . Base de datos de resistencia y antivirales al coronavirus de la Universidad de Stanford . 1 de julio de 2021 . Consultado el 5 de julio de 2021 .
- ^ a b "B.1.429" . Rambaut Group, Universidad de Edimburgo . Linajes PANGO. 15 de febrero de 2021 . Consultado el 16 de febrero de 2021 .
- ^ a b "Informe de linaje B.1.429" . Investigación de Scripps . outbreak.info. 15 de febrero de 2021 . Consultado el 16 de febrero de 2021 .
- ^ "La variante COVID-19 encontrada por primera vez en otros países y estados ahora se ve con más frecuencia en California" . Departamento de Salud Pública de California . Consultado el 30 de enero de 2021 .
- ^ Weise E, Weintraub K. "Las nuevas cepas de COVID que se mueven rápidamente a través de los EE. UU. Necesitan una vigilancia cuidadosa, dicen los científicos" . USA Today . Consultado el 30 de enero de 2021 .
- ^ Zimmer, Carl; Mandavilli, Apoorva (14 de mayo de 2021). "Cómo Estados Unidos venció a las variantes, por ahora" . New York Times . Consultado el 17 de mayo de 2021 .
- ^ "Variantes de GISAID - hCov19" . www.gisaid.org . Consultado el 2 de julio de 2021 .