El factor de empalme 1, también conocido como proteína 162 con dedos de zinc ( ZFM162 ), es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen SF1 . [3] [4] [5]
SF1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | SF1 , BBP, D11S636, MBBP, ZCCHC25, ZFM1, ZNF162, factor de empalme 1 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 601516 HomoloGene : 138518 GeneCards : SF1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (proteína) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ubicación (UCSC) | Crónicas 11: 64,76 - 64,78 Mb | n / A | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [2] | n / A | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
El factor de empalme SF1 está involucrado en la formación dependiente de ATP del complejo de espliceosoma . [6] El gen SF1 es necesario para producir la gónada bipotencial; pero mientras que los niveles de SF1 disminuyen en la cresta genital de los embriones de ratón XX, el gen SF1 permanece en los testículos en desarrollo. SF 1 (factor de transcripción) parece estar activo en la masculinización tanto de las células de Leydig como de las células de Sertoli. En las células de Sertoli con la proteína SOX9, eleva el nivel de transcripción de AMH. En las células de Leydig, activa el gen que codifica la enzima que produce la hormona testosterona.
Interacciones
Se ha demostrado que SF1 (gen) interactúa con la región 1 del punto de ruptura del sarcoma de Ewing , [7] U2AF2 , [8] [9] [10] Factor determinante del testículo , [11] y regulador de elongación de la transcripción 1 . [12]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000168066 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Toda T, Iida A, Miwa T, Nakamura Y, Imai T (julio de 1994). "Aislamiento y caracterización de un gen novedoso que codifica una proteína nuclear en un locus (D11S636) estrechamente ligado a la neoplasia endocrina múltiple tipo 1 (MEN1)". Hum Mol Genet . 3 (3): 465–70. doi : 10.1093 / hmg / 3.3.465 . PMID 7912130 .
- ^ Kramer A, Quentin M, Mulhauser F (junio de 1998). "Diversos modos de empalme alternativo del factor de empalme humano SF-1 deducido de la estructura exón-intrón del gen". Gene . 211 (1): 29–37. doi : 10.1016 / S0378-1119 (98) 00058-4 . PMID 9573336 .
- ^ "Entrez Gene: factor de empalme SF1 1" .
- ^ Rino J, Desterro JM, Pacheco TR, Gadella TW, Carmo-Fonseca M (mayo de 2008). "Los factores de empalme SF1 y U2AF se asocian en complejos extraespliceosomales" . Mol. Célula. Biol . 28 (9): 3045–57. doi : 10.1128 / MCB.02015-07 . PMC 2293075 . PMID 18285458 .
- ^ Zhang D, Paley AJ, Childs G (julio de 1998). "El represor transcripcional ZFM1 interactúa y modula la capacidad de EWS para activar la transcripción" . J. Biol. Chem . 273 (29): 18086–91. doi : 10.1074 / jbc.273.29.18086 . PMID 9660765 .
- ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (octubre de 2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173–8. doi : 10.1038 / nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- ^ Berglund JA, Abovich N, Rosbash M (marzo de 1998). "Una interacción cooperativa entre U2AF65 y mBBP / SF1 facilita el reconocimiento de la región del punto de ramificación" . Genes Dev . 12 (6): 858–67. doi : 10.1101 / gad.12.6.858 . PMC 316625 . PMID 9512519 .
- ^ Abovich N, Rosbash M (mayo de 1997). "Las interacciones puente entre intrones en el complejo de compromiso de levadura se conservan en mamíferos". Celular . 89 (3): 403–12. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80221-4 . PMID 9150140 . S2CID 18466775 .
- ^ Kashimada K, Koopman P (diciembre de 2010). "Sry: el interruptor principal en la determinación del sexo de los mamíferos" . Desarrollo . 137 (23): 3921-30. doi : 10.1242 / dev.048983 . PMID 21062860 .
- ^ Goldstrohm AC, Albrecht TR, Suñé C, Bedford MT, Garcia-Blanco MA (noviembre de 2001). "El factor de elongación de la transcripción CA150 interactúa con la ARN polimerasa II y el factor de corte y empalme pre-ARNm SF1" . Mol. Célula. Biol . 21 (22): 7617-28. doi : 10.1128 / MCB.21.22.7617-7628.2001 . PMC 99933 . PMID 11604498 .
Otras lecturas
- Krämer A (1992). "Purificación del factor de empalme SF1, una proteína termoestable que funciona en el ensamblaje de un complejo de empalme" . Mol. Célula. Biol . 12 (10): 4545–52. doi : 10.1128 / MCB.12.10.4545 . PMC 360381 . PMID 1406644 .
- Naumovski L, Cleary ML (1996). "La proteína de unión a p53 53BP2 también interactúa con Bc12 e impide la progresión del ciclo celular en G2 / M" . Mol. Célula. Biol . 16 (7): 3884–92. doi : 10.1128 / MCB.16.7.3884 . PMC 231385 . PMID 8668206 .
- Arning S, Grüter P, Bilbe G, Krämer A (1996). "El factor de corte y empalme de mamíferos SF1 está codificado por ADNc variantes y se une al ARN" . ARN . 2 (8): 794–810. PMC 1369416 . PMID 8752089 .
- Abovich N, Rosbash M (1997). "Las interacciones puente entre intrones en el complejo de compromiso de levadura se conservan en mamíferos". Celular . 89 (3): 403–12. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80221-4 . PMID 9150140 . S2CID 18466775 .
- Caslini C, Spinelli O, Cazzaniga G, et al. (1997). "Identificación de dos nuevas isoformas del gen ZNF162: una familia creciente de transducción de señales y activador de proteínas de ARN". Genómica . 42 (2): 268–77. doi : 10.1006 / geno.1997.4705 . PMID 9192847 .
- Zhang D, Childs G (1998). "La proteína ZFM1 humana es un represor transcripcional que interactúa con el dominio de activación de la transcripción de la proteína activadora específica de la etapa" . J. Biol. Chem . 273 (12): 6868–77. doi : 10.1074 / jbc.273.12.6868 . PMID 9506990 .
- Berglund JA, Abovich N, Rosbash M (1998). "Una interacción cooperativa entre U2AF65 y mBBP / SF1 facilita el reconocimiento de la región del punto de ramificación" . Genes Dev . 12 (6): 858–67. doi : 10.1101 / gad.12.6.858 . PMC 316625 . PMID 9512519 .
- Zhang D, Paley AJ, Childs G (1998). "El represor transcripcional ZFM1 interactúa y modula la capacidad de EWS para activar la transcripción" . J. Biol. Chem . 273 (29): 18086–91. doi : 10.1074 / jbc.273.29.18086 . PMID 9660765 .
- Neubauer G, King A, Rappsilber J, et al. (1998). "La espectrometría de masas y la búsqueda de bases de datos EST permiten la caracterización del complejo de espliceosomas de múltiples proteínas". Nat. Genet . 20 (1): 46–50. doi : 10.1038 / 1700 . PMID 9731529 . S2CID 585778 .
- Wang X, Bruderer S, Rafi Z y col. (1999). "La fosforilación del factor de empalme SF1 en Ser20 por proteína quinasa dependiente de cGMP regula el ensamblaje del espliceosoma" . EMBO J . 18 (16): 4549–59. doi : 10.1093 / emboj / 18.16.4549 . PMC 1171529 . PMID 10449420 .
- Lapteva N, Nieda M, Ando Y, et al. (2001). "Expresión de genes del sistema renina-angiotensina en células dendríticas inmaduras y maduras identificadas mediante microarrays de ADNc humano". Biochem. Biophys. Res. Comun . 285 (4): 1059–65. doi : 10.1006 / bbrc.2001.5215 . PMID 11467860 .
- Goldstrohm AC, Albrecht TR, Suñé C, et al. (2001). "El factor de elongación de la transcripción CA150 interactúa con la ARN polimerasa II y el factor de corte y empalme pre-ARNm SF1" . Mol. Célula. Biol . 21 (22): 7617-28. doi : 10.1128 / MCB.21.22.7617-7628.2001 . PMC 99933 . PMID 11604498 .
- Liu Z, Luyten I, Bottomley MJ y col. (2001). "Base estructural para el reconocimiento del ARN del sitio de ramificación del intrón por factor de empalme 1" . Ciencia . 294 (5544): 1098–102. doi : 10.1126 / science.1064719 . PMID 11691992 . S2CID 21402023 .
- Rappsilber J, Ryder U, Lamond AI, Mann M (2002). "Análisis proteómico a gran escala del espliceosoma humano" . Genome Res . 12 (8): 1231–45. doi : 10.1101 / gr.473902 . PMC 186633 . PMID 12176931 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH y col. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Selenko P, Gregorovic G, Sprangers R, et al. (2003). "Base estructural para el reconocimiento molecular entre factores de empalme humanos U2AF65 y SF1 / mBBP". Mol. Celular . 11 (4): 965–76. doi : 10.1016 / S1097-2765 (03) 00115-1 . PMID 12718882 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Caracterización a gran escala de fosfoproteínas nucleares de células HeLa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. doi : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
- Lin KT, Lu RM, Tarn WY (2004). "Las proteínas que contienen el dominio WW interactúan con el espliceosoma temprano y participan en el empalme de pre-ARNm in vivo" . Mol. Célula. Biol . 24 (20): 9176–85. doi : 10.1128 / MCB.24.20.9176-9185.2004 . PMC 517884 . PMID 15456888 .