En biología molecular , el dominio proteico Sacaropina deshidrogenasa (SDH), también llamado Sacaropina reductasa, es una enzima involucrada en el metabolismo del aminoácido lisina , a través de una sustancia intermedia llamada sacaropina . La enzima Sacaropina deshidrogenasa se puede clasificar en EC 1.5.1.7 , EC 1.5.1.8 , EC 1.5.1.9 y EC 1.5.1.10 . Tiene una función importante en el metabolismo de la lisina y cataliza una reacción en la vía del ácido alfa-aminoadípico . Este camino es exclusivo de organismos fúngicos por tanto, esta molécula podría ser útil en la búsqueda de nuevos antibióticos . Esta familia de proteínas también incluye la sacaropina deshidrogenasa y la homospermidina sintasa . Se encuentra en procariotas , eucariotas y arqueas .
Sacaropina deshidrogenasa | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() Sacaropina deshidrogenasa de Magnaporthe grisea | ||||||||
Identificadores | ||||||||
Símbolo | Saccharop_dh | |||||||
Pfam | PF03435 | |||||||
Clan pfam | CL0063 | |||||||
InterPro | IPR005097 | |||||||
SCOP2 | 1ff9 / SCOPe / SUPFAM | |||||||
|
sacaropina deshidrogenasa (putativo) | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Identificadores | ||||||
Símbolo | SCCPDH | |||||
Gen NCBI | 51097 | |||||
HGNC | 24275 | |||||
RefSeq | NM_016002 | |||||
UniProt | Q8NBX0 | |||||
Otros datos | ||||||
Lugar | Chr. 1 q44 | |||||
|
Función
De manera simplista, SDH usa NAD + como oxidante para catalizar la desaminación oxidativa reversible dependiente de nucleótidos de piridina del sustrato , Saccharopine, para formar los productos, lisina y alfa-cetoglutarato. Esto se puede describir mediante la siguiente ecuación: [1]
- SDH
Sacaropina ⇌ lisina + alfa-cetoglutarato
La sacaropina deshidrogenasa EC cataliza la condensación de l-alfa-aminoadipato-delta-semialdehído (AASA) con l-glutamato para dar una imina, que es reducida por NADPH para dar sacaropina. [2] En algunos organismos, esta enzima se encuentra como un polipéptido bifuncional con lisina cetoglutarato reductasa (PF).
Homoespermidina sintasa proteínas ( CE ). La homopermidina sintasa (HSS) cataliza la síntesis de la poliamina homospermidina a partir de 2 moles de putrescina en una reacción dependiente de NAD + . [3]
Estructura
Parece haber dos dominios proteicos de tamaño similar. Un dominio es un pliegue de Rossmann que se une a NAD + / NADH , y el otro es relativamente similar. Ambos dominios contienen una hoja beta paralela de seis hebras rodeada por hélices alfa y bucles (pliegue alfa / beta). [4]
Significación clínica
Las deficiencias están asociadas con la hiperlisinemia .
Referencias
- ^ Kumar VP, West AH, Cook PF (junio de 2012). "Función de apoyo de la lisina 13 y el glutamato 16 en el mecanismo ácido-base de la sacaropina deshidrogenasa de Saccharomyces cerevisiae". Archivos de Bioquímica y Biofísica . 522 (1): 57–61. doi : 10.1016 / j.abb.2012.03.027 . PMID 22521736 .
- ^ Vashishtha AK, West AH, Cook PF (junio de 2009). "Mecanismo químico de la sacaropina reductasa de Saccharomyces cerevisiae". Bioquímica . 48 (25): 5899–907. doi : 10.1021 / bi900599s . PMID 19449898 .
- ^ Tholl D, Ober D, Martin W, Kellermann J, Hartmann T (septiembre de 1996). "Purificación, clonación molecular y expresión en Escherichia coli de homospermidina sintasa de Rhodopseudomonas viridis" . Revista europea de bioquímica . 240 (2): 373–9. doi : 10.1111 / j.1432-1033.1996.0373h.x . PMID 8841401 .
- ^ Andi B, Xu H, Cook PF, West AH (noviembre de 2007). "Estructuras cristalinas de la sacaropina deshidrogenasa ligada a ligando de Saccharomyces cerevisiae". Bioquímica . 46 (44): 12512–21. doi : 10.1021 / bi701428m . PMID 17939687 .
- Sacaropina + deshidrogenasas en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .