Sage Bionetworks es una organización sin fines de lucro en Seattle que promueve la ciencia abierta y la participación del paciente en el proceso de investigación. Está dirigido por Lara Mangravite. [1] Fue cofundada por Stephen Friend y Eric Schadt . [2] [3]
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Tipo | organización sin ánimo de lucro |
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Propósito | Ciencia abierta |
Sede | Seattle |
Gente clave |
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Afiliaciones | Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson |
Sitio web | http://www.sagebionetworks.org |
Ciencia abierta
Sage Bionetworks se destaca por ser uno de los primeros defensores de la ciencia abierta. [4] [5] La compañía opera una plataforma de software para el análisis colaborativo de datos llamada Synapse [6] que permite a los investigadores trabajar juntos en la curación de datos y el modelado computacional de forma asincrónica de una manera inspirada en GitHub . Synapse también sirve como infraestructura de software para ejecutar desafíos computacionales. [7] Sage también está desarrollando una plataforma de ciencia ciudadana llamada Bridge. [8] [9]
Investigar
La mayor parte de los resultados científicos de Sage surgen del cáncer y las neurociencias, con contribuciones notables al proyecto Cancer Genome Atlas Pan-Cancer. [10] Otra iniciativa de Sage, The Resilience Project [11] se describe a sí misma como una búsqueda de individuos que tienen cambios genéticos que se espera que causen una enfermedad grave pero que permanecen perfectamente sanos. La esperanza es brindar información sobre los factores que protegen a estas personas de las enfermedades. [12] [13] En 2019, Sage Bionetworks se unió al Open-AD Drug Discovery Center, que tiene como objetivo encontrar nuevos medicamentos para el Alzheimer. "Este proyecto une los enfoques de ciencia abierta en la investigación experimental y computacional", dijo la presidenta de Sage, la Dra. Lara Mangravite, en un comunicado. [14]
Historia
Sage Bionetworks se fundó en 2009 como una empresa derivada de Merck & Co. , que lanzó software, hardware, propiedad intelectual y personal conectado a su unidad Rosetta Inpharmatics. [15] Una donación de Quintiles proporcionó financiación anticipada. [dieciséis]
En marzo de 2011, Sage se asoció con la Fundación CHDI para desarrollar simulaciones por computadora para estudiar la enfermedad de Huntington . Al mismo tiempo, Sage también anunció una asociación con Takeda Pharmaceutical Company en la que Sage investigaría para identificar objetivos biológicos para enfermedades del sistema nervioso central . [17]
En febrero de 2013, Sage Bionetworks se asoció con el proyecto Dialogue on Reverse Engineering Assessment and Methods (DREAM) para proporcionar experiencia e infraestructura para DREAM Challenges en la plataforma Synapse.org . [18]
Ver también
Referencias
- ^ "Liderazgo - Sage Bionetworks" . sagebase.org . Consultado el 19 de enero de 2017 .
- ^ Kaiser, Jocelyn (2012). "Perfil Stephen Friend: el visionario". Ciencia . 335 (6069): 651–653. doi : 10.1126 / science.335.6069.651 . PMID 22323794 .
- ^ "Sage Bionetworks Seattle | Directores" . Archivado desde el original el 11 de febrero de 2012.
- ^ Strauss, S. (2011). "Consorcio de acceso abierto" . Biotecnología de la naturaleza . 29 (4): 298. doi : 10.1038 / nbt0411-298b .
- ^ Hunter, J .; Stephens, S. (2010). "¿Es la innovación abierta el camino a seguir para las grandes farmacéuticas?". Nature Reviews Descubrimiento de medicamentos . 9 (2): 87. doi : 10.1038 / nrd3099 .
- ^ "Sinapsis de salvia" . Consultado el 10 de febrero de 2014 .
- ^ "Sage Bionetworks y el ecosistema próspero del descubrimiento basado en desafíos" . 2 de junio de 2014.
- ^ O'Hagan, Maureen (11 de febrero de 2012). "Sage Bionetworks de Seattle busca una revolución de descubrimiento de fármacos" . Seattle Times . Consultado el 12 de febrero de 2012 .
- ^ "Sage Bionetworks anuncia programa para desarrollar BRIDGE: una plataforma de TI que aprovecha la sabiduría y los datos del paciente para la investigación biomédica del siglo XXI" . 27 de septiembre de 2013.
- ^ Chang, K .; Creighton, CJ; Davis, C .; Donehower, L .; Drummond, J .; Wheeler, D .; Ally, A .; Balasundaram, M .; Birol, I .; Butterfield, YSN; Chu, A .; Chuah, E .; Chun, HJE; Dhalla, N .; Guin, R .; Hirst, M .; Hirst, C .; Holt, RA; Jones, SJM; Lee, D .; Li, HI; Marra, MA; Mayo, M .; Moore, RA; Mungall, AJ; Robertson, AG; Schein, JE; Sipahimalani, P .; Tam, A .; et al. (2013). "El proyecto de análisis Pan-Cancer del Atlas del genoma del cáncer" . Genética de la naturaleza . 45 (10): 1113–20. doi : 10.1038 / ng.2764 . PMC 3919969 . PMID 24071849 .
- ^ "El Proyecto Resilence" .
- ^ Amigo, SH; Schadt, EE (2014). "Pistas de los resilientes" . Ciencia . 344 (6187): 970–2. Código Bibliográfico : 2014Sci ... 344..970F . doi : 10.1126 / science.1255648 . PMID 24876479 .
- ^ Swartz, Aimee (29 de mayo de 2014). "La búsqueda de genes que previenen enfermedades" . El Atlántico .
- ^ James Thorne (1 de octubre de 2019). "Sage Bionetworks, una organización sin fines de lucro de Seattle, se une al esfuerzo nacional de $ 37 millones para buscar medicamentos para la enfermedad de Alzheimer" . GeekWire.
- ^ Timmerman, Luke (6 de agosto de 2009). "Stephen Friend, dejando el concierto de Merck de alta potencia, enciende el fuego para el movimiento de biología de código abierto" . Xconomy . Consultado el 6 de septiembre de 2014 .
- ^ Timmerman, Luke (5 de octubre de 2009). "Sage Bionetworks, Spark de código abierto de biología," Importante "donación de Quintiles | Xconomy" . Xconomy . Consultado el 16 de enero de 2012 .
- ^ "Sage Bionetworks lanza asociaciones internacionales de neurobiología" . Business Wire . 30 de marzo de 2011.
- ^ Timmerman, Luke (19 de febrero de 2013). "Sage Bionetworks absorbe sueño, planes de ciencia abierta 'desafíos ' " . Xconomy . Consultado el 6 de septiembre de 2014 .
enlaces externos
- Bionetworks sabio
- Sinapsis
- Desafíos DREAM