Siphoviridae es una familia de virus de ADN bicatenario del orden Caudovirales . Las bacterias y las arqueas sirven como huéspedes naturales. Hay 1,166 especies en esta familia, asignadas a 366 géneros y 22 subfamilias. [2] [3] Los rasgos estructurales característicos de esta familia son una cabeza no envuelta y una cola no contráctil.
Siphoviridae | |
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Imagen de TME de un virión del virus Escherichia HK97 , Siphoviridae | |
Clasificación de virus | |
(no clasificado): | Virus |
Reino : | Duplodnaviria |
Reino: | Heunggongvirae |
Filo: | Uroviricota |
Clase: | Caudoviricetes |
Pedido: | Caudovirales |
Familia: | Siphoviridae |
Genera | |
Sinónimos [1] | |
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Estructura
Los virus en Siphoviridae no tienen envoltura , con geometrías icosaédricas y cabeza-cola [2] ( morfotipo B1) o una cápside alargada (morfotipo B2), y simetría T = 7. El diámetro es de unos 60 nm. [2] Los miembros de esta familia también se caracterizan por sus colas filamentosas, con bandas cruzadas y no contráctiles, generalmente con fibras terminales y subterminales cortas. Los genomas son bicatenarios y lineales, alrededor de 50 kb de longitud, [2] contienen alrededor de 70 genes . El contenido de guanina / citosina suele rondar el 52%.
Ciclo vital
La replicación viral es citoplasmática. La entrada en la célula huésped se logra mediante adsorción en la célula huésped. La replicación sigue el modelo de transposición replicativa. La transcripción con plantilla de ADN es el método de transcripción. La traducción se lleva a cabo mediante un desplazamiento del marco ribosómico -1 y un desplazamiento del marco ribosómico +1. El virus sale de la célula huésped por lisis y proteínas holina / endolisina / spanina. [2] Las bacterias y las arqueas sirven como hospedadores naturales. Las rutas de transmisión son de difusión pasiva. [2]
Taxonomía
Se reconocen las siguientes subfamilias: [3]
- Arquatrovirinae
- Azeredovirinae
- Bclasvirinae
- Bronfenbrennervirinae
- Chebruvirinae
- Dclasvirinae
- Deejayvirinae
- Dolichocephalovirinae
- Gochnauervirinae
- Guernseyvirinae
- Gutmannvirinae
- Hendrixvirinae
- Langleyhallvirinae
- Mccleskeyvirinae
- Mclasvirinae
- Nclasvirinae
- Nymbaxtervirinae
- Pclasvirinae
- Queuovirinae
- Skryabinvirinae
- Trabyvirinae
- Tybeckvirinae
Los siguientes géneros no están asignados a una subfamilia: [3]
- Abbeymikolonvirus
- Abidjanvirus
- Agmunavirus
- Aguilavirus
- Ahduovirus
- Alachuavirus
- Alegríavirus
- Amigovirus
- Anatolevirus
- Andrewvirus
- Andrómedavirus
- Annadreamyvirus
- Appavirus
- Virus del albaricoque
- Arawnvirus
- Armstrongvirus
- Ashduovirus
- Attisvirus
- Attoomivirus
- Audreyjarvisvirus
- Austintatiousvirus
- Avanivirus
- Bantamvirus
- Virus del corral
- Beceayunavirus
- Beetrevirus
- Behunavirus
- Bernalvirus
- Betterkatzvirus
- Bievrevirus
- Bingvirus
- Bowservirus
- Bridgettevirus
- Britbratvirus
- Bronvirus
- Brussowvirus
- Camtrevirus
- Casadabanvirus
- Cbastvirus
- Cecivirus
- Ceduovirus
- Ceetrepovirus
- Cequinquevirus
- Chenonavirus
- Cheoctovirus
- Virus de Chertsey
- Chivirus
- Chunghsingvirus
- Cimpunavirus
- Cinunavirus
- Coetzeevirus
- Colunavirus
- Coralvirus
- Corndogvirus
- Cornievirus
- Coventryvirus
- Cronusvirus
- Cukevirus
- Daredevilvirus
- Decurrovirus
- Delepquintavirus
- Demóstenesvirus
- Detrevirus
- Deurplevirus
- Dhillonvirus
- Dinavirus
- Dismasvirus
- Doucettevirus
- Edenvirus
- Efquatrovirus
- Eiauvirus
- Eisenstarkvirus
- Elerivirus
- Emalynvirus
- Eyrevirus
- Fairfaxidumvirus
- Farahnazvirus
- Fattrevirus
- Feofaniavirus
- Fernvirus
- Fibralongavirus
- Virus de la boca de las aves
- Franklinbayvirus
- Fremauxvirus
- Fromanvirus
- Gaiavirus
- Galaxyvirus
- Galunavirus
- Gamtrevirus
- Gesputvirus
- Contraerseptimavirus
- Ghobesvirus
- Gilesvirus
- Gillianvirus
- Gilsonvirus
- Glaedevirus
- Godonkavirus
- Goodmanvirus
- Gordonvirus
- Gordtnkvirus
- Gorganvirus
- Gorjumvirus
- Gustavvirus
- Halcyonevirus
- Hattifnattvirus
- Hedwigvirus
- Helsingorvirus
- Hiyaavirus
- Hnatkovirus
- Holosalinivirus
- Homburgvirus
- Hubeivirus
- Iaduovirus
- Ikedavirus
- Ilzatvirus
- Incheonvrus
- Indlulamithivirus
- Inhavirus
- Jacevirus
- Jarrellvirus
- Jenstvirus
- Jouyvirus
- Juiceboxvirus
- Junavirus
- Kairosalinivirus
- Kamchatkavirus
- Karimacvirus
- Kelleziovirus
- Kilunavirus
- Klementvirus
- Knuthellervirus
- Kojivirus
- Konstantinevirus
- Korravirus
- Kostyavirus
- Krampusvirus
- Kryptosalinivirus
- Kuleanavirus
- Labanvirus
- Lacnuvirus
- Lacusarxvirus
- Lafunavirus
- Lambdavirus
- Lambovirus
- Lanavirus
- Larmunavirus
- Laroyevirus
- Latrobevirus
- Leicestervirus
- Lentavirus
- Liebevirus
- Liefievirus
- Lilamyvirus
- Lokivirus
- Lomovskayavirus
- Luckybarnesvirus
- Luckytenvirus
- Lughvirus
- Lwoffvirus
- Magadivirus
- Majavirus
- Manhattanvirus
- Mapvirus
- Mardecavirus
- Virus de Marienburg
- Marvinvirus
- Maxrubnervirus
- Mementomorivirus
- Metamorfoovirus
- Minunavirus
- Moineauvirus
- Montyvirus
- Mudcatvirus
- Mufasoctovirus
- Muminvirus
- Murrayvirus
- Nanhaivirus
- Nazgulvirus
- Nefertenavirus
- Nesevirus
- Nevevirus
- Nickievirus
- Nonanavirus
- Nyceiraevirus
- Oengusvirus
- Omegavirus
- Oneupvirus
- Virus de la orquídea
- Oshimavirus
- Pahexavirus
- Pamexvirus
- Pankowvirus
- Papirovirus
- Virus de la paciencia
- Pepyhexavirus
- Phifelvirus
- Picardvirus
- Pikminvirus
- Pleeduovirus
- Pleetrevirus
- Poushouvirus
- Predatorvirus
- Priunavirus
- Psavirus
- Psimunavirus
- Pulverervirus
- Questintvirus
- Quhwahvirus
- Radostvirus
- Virus de Raleigh
- Ravarandavirus
- Ravinvirus
- Rerduovirus
- Rigallicvirus
- Rimavirus
- Rockefellervirus
- Rockvillevirus
- Rogerhendrixvirus
- Ronaldovirus
- Roufvirus
- Rowavirus
- Ruthyvirus
- Samistivirus
- Samunavirus
- Samwavirus
- Sandinevirus
- Sanovirus
- Sansavirus
- Saphexavirus
- Sashavirus
- Sasvirus
- Saundersvirus
- Sawaravirus
- Scapunavirus
- Virus de Schnabeltier
- Schubertvirus
- Seongbukvirus
- Septimatrevirus
- Seussvirus
- Sextaecvirus
- Skunavirus
- Slashvirus
- Virus del Sleepyhead
- Smoothievirus
- Sonalivirus
- Virus de las sopas
- Sourvirus
- Sozzivirus
- Sparkyvirus
- Spbetavirus
- Spizizenvirus
- Squashvirus
- Squirtyvirus
- Stanholtvirus
- Steinhofvirus
- Sukhumvitvirus
- Tandoganvirus
- Tankvirus
- Tantvirus
- Terapinvirus
- Teubervirus
- Thetabobvirus
- Tigunavirus
- Timquatrovirus
- Tinduovirus
- Titanvirus
- Tortellinivirus
- Triavirus
- Trigintaduovirus
- Trinavirus
- Trinevirus
- Triplejayvirus
- Unahavirus
- Uwajimavirus
- Vashvirus
- Vedamuthuvirus
- Vendettavirus
- Vhulanivirus
- Vidquintavirus
- Vieuvirus
- Vividuovirus
- Voivodinavirus
- Waukeshavirus
- Wbetavirus
- Comadrejavirus
- Whackvirus
- Virus de la cabeza blanca
- Wildcatvirus
- Wilnyevirus
- Wizardvirus
- Woesvirus
- Woodruffvirus
- Xiamenvirus
- Xipdecavirus
- Yangvirus
- Yonseivirus
- Yuavirus
- Yvonnevirus
- Zetavirus
Referencias
- ^ Safferman, RS; Cannon, RE; Desjardins, PR; Gromov, BV; Haselkorn, R .; Sherman, LA; Shilo, M. (1983). "Clasificación y nomenclatura de virus de cianobacterias" . Intervirología . 19 (2): 61–66. doi : 10.1159 / 000149339 . PMID 6408019 .
- ^ a b c d e f "Zona Viral" . EXPASY . Consultado el 1 de julio de 2015 .
- ^ a b c "Taxonomía de virus: versión 2020" . Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV). Marzo de 2021 . Consultado el 12 de mayo de 2021 .
- ^ Lood R, Mörgelin M, Holmberg A, Rasmussen M, Collin M (2008). "Sifovirus inducibles en aislamientos de tejidos superficiales y profundos de Propionibacterium acnes" . BMC Microbiol . 8 : 139. doi : 10.1186 / 1471-2180-8-139 . PMC 2533672 . PMID 18702830 .
enlaces externos
- Zona viral : Siphoviridae
- ICTV
- Genomas completos de Siphoviridae