Top7 es una proteína artificial de 93 residuos , clasificada como una proteína de novo ya que fue diseñada por Brian Kuhlman y Gautam Dantas en el laboratorio de David Baker en la Universidad de Washington para tener un pliegue único que no se encuentra en la naturaleza. [1] La proteína se diseñó ab initio en una computadora con la ayuda de algoritmos de predicción de la estructura de la proteína . La determinación de la estructura de rayos X de alta resolución de la proteína purificada y expresada experimentalmente reveló que la estructura (ID de PDB: 1QYS ) era de hecho muy similar (1,2 Å RMSD ) al modelo diseñado por computadora. La estructura consta de dos hélices alfa empaquetadas en una hoja beta antiparalela de cinco hebras .
Top7 fue presentado como la 'Molécula del Mes' del RCSB Protein Data Bank en octubre de 2005, [2] y una superposición de los respectivos núcleos (residuos 60-79) de sus estructuras cristalinas predichas y de rayos X se presentan en Rosetta @ logotipo de inicio .
Referencias
- ↑ Kuhlman B, Dantas G, Ireton GC, Varani G, Stoddard BL, Baker D (21 de noviembre de 2003). "Diseño de un pliegue proteico globular novedoso con precisión a nivel atómico". Ciencia . 302 (5649): 1364-1368. Código Bibliográfico : 2003Sci ... 302.1364K . doi : 10.1126 / science.1089427 . PMID 14631033 .
- ^ "Molécula del mes de octubre de 2005: proteínas de diseño" . Banco de datos de proteínas RCSB. doi : 10.2210 / rcsb_pdb / mom_2005_10 . Consultado el 15 de enero de 2017 .