La repetición WD40 (también conocida como repetición WD o beta-transducina ) es un motivo estructural corto de aproximadamente 40 aminoácidos , que a menudo termina en un dipéptido triptófano - ácido aspártico (WD). [2] Las copias en tándem de estas repeticiones generalmente se pliegan para formar un tipo de dominio de proteína de solenoide circular llamado dominio WD40 .
Las proteínas que contienen el dominio WD40 tienen de 4 a 16 unidades repetitivas, todas las cuales se cree que forman una estructura de hélice beta circularizada (ver figura a la derecha). [3] [4] El dominio WD40 se compone de varias repeticiones, una región variable de alrededor de 20 residuos al principio seguida de un conjunto repetido de residuos más común. Estas repeticiones normalmente forman una hoja o cuchilla beta antiparalela de cuatro hebras. Estas palas se unen para formar una hélice, siendo la más común una hélice beta de 7 palas. Las hojas se entrelazan de modo que la última hebra beta de una repetición se forma con las tres primeras de la siguiente repetición para formar la estructura de hoja 3D.
Las proteínas de repetición WD40 son una gran familia que se encuentra en todos los eucariotas y están implicadas en una variedad de funciones que van desde la transducción de señales y la regulación de la transcripción hasta el control del ciclo celular , la autofagia y la apoptosis . [5] La función común subyacente de todas las proteínas de repetición WD40 es la coordinación de ensamblajes complejos de múltiples proteínas, donde las unidades repetidas sirven como un andamio rígido para las interacciones de proteínas. La especificidad de las proteínas está determinada por las secuencias fuera de las propias repeticiones. Ejemplos de estos complejos son las proteínas G (la subunidad beta es una hélice beta), TAFIIfactor de transcripción y ubiquitina ligasa E3 . [3] [4]
Según el análisis inicial del genoma humano, las repeticiones WD40 son la octava familia de proteínas más grande. En total, se identificaron 277 proteínas que las contenían. [6] Los genes humanos que codifican proteínas que contienen este dominio incluyen: