El USS S-3 (SS-107) fue el prototipo de los submarinos de clase S "tipo gobierno" de la Armada de los Estados Unidos . ( El S-1 era el prototipo del "tipo Holland" y el S-2 el del "tipo Lake"). Su quilla fue colocada el 29 de agosto de 1917 por el Portsmouth Navy Yard . Fue botado el 21 de diciembre de 1918 patrocinado por la Sra. William L. Hill y comisionado el 30 de enero de 1919 con el comandante John W. Lewis al mando.
Después del equipamiento y las pruebas, el S-3 comenzó su carrera con operaciones de entrenamiento a lo largo de la costa de Nueva Inglaterra , operando desde Portsmouth y New London, Connecticut . En 1920, visitó dos veces La Habana, Cuba : primero en enero y nuevamente en diciembre.
En julio de 1921, se adjuntó a la División de Submarinos 12 (SubDiv 12) que, junto con la SubDiv 18, se reuniría en Portsmouth para el viaje más largo registrado, en ese momento, para submarinos estadounidenses. Las dos divisiones fueron asignadas a la Flota Asiática como Submarine Flotilla 3 (SubFlot 3) en la Estación Naval de Cavite en las Islas Filipinas . Navegaron a través del Canal de Panamá hasta Pearl Harbor , donde el S-3 fue separado y reasignado para operar en la costa oeste de los Estados Unidos desde Mare Island, California . Las dos divisiones continuaron y completaron con éxito el viaje, llegando a Cavite el 1 de diciembre.
El S-3 partió de Pearl Harbor el 9 de noviembre y navegó hacia la costa oeste de EE. UU., donde operó hasta mediados de julio de 1923. El 17 de julio, partió de la Bahía de San Francisco para volver a transitar por el Canal de Panamá en ruta a New London.
Al llegar a New London el 5 de septiembre, se adjuntó a la SubDiv 2, Flota del Atlántico , y se le asignó un deber experimental en la Escuela Submarina de New London, asumiendo las funciones de S-1 , buque insignia de la SubDiv 2, que estaba realizando experimentos especiales con aviones . Durante el resto de 1923 y los años siguientes, hasta 1927, recorrió la costa este de los Estados Unidos realizando operaciones de entrenamiento y evaluando nuevas técnicas en el desarrollo de submarinos.
En julio de 1927, S-3 y S-1 formaron la SubDiv 4 y comenzaron un programa que incluía cruceros operativos a la Zona del Canal de Panamá en los meses de primavera de 1928-1930. Los meses restantes de esos años los pasó en operaciones a lo largo de la costa de Nueva Inglaterra.