Un elemento ultraconservado (UCE) es una región de ADN que es idéntica en al menos dos especies diferentes. [1] Uno de los primeros estudios de UCE mostró que ciertas secuencias de ADN humano de 200 nucleótidos de longitud o más estaban completamente conservadas ( secuencia de ácido nucleico idéntica ) en humanos, ratas y ratones. [2] A pesar de que a menudo son ADN no codificantes , [3] se ha encontrado que algunos elementos ultraconservados son transcripcionalmente activos, dando moléculas de ARN no codificantes . [4]
Evolución
Se cree que la conservación perfecta de estos largos tramos de ADN implica una importancia evolutiva, ya que estas regiones parecen haber experimentado una fuerte selección negativa (purificadora) durante 300-400 millones de años. [2] [3] [5] La probabilidad de encontrar elementos ultraconservados por casualidad (bajo evolución neutra ) se ha estimado en menos de 10-22 en 2.900 millones de bases. [2]
Funciones
Se han identificado 481 elementos ultraconservados en el genoma humano . [1] [2] Una base de datos que recopila información genómica sobre elementos ultraconservados ( UCbase ) que comparten el 100% de identidad entre humanos, ratones y ratas está disponible en http://ucbase.unimore.it . [6] Un pequeño número de los que se transcriben se han relacionado con carcinomas y leucemias humanos . [4] Por ejemplo, TUC338 está fuertemente regulado al alza en células de carcinoma hepatocelular humano . [7] De hecho, las UCE a menudo se ven afectadas por la variación del número de copias en las células cancerosas, [8] mucho más que en contextos saludables, [8] [9] [10] lo que sugiere que alterar el número de copias de elementos ultraconservados puede ser perjudicial y asociado con cáncer. Un estudio que compara elementos ultraconservados entre humanos y el pez globo japonés Takifugu rubripes propuso una importancia en el desarrollo de vertebrados. [11] Varios elementos ultraconservados se encuentran cerca de reguladores transcripcionales o genes de desarrollo. [2] [12] Otras funciones incluyen la mejora y la regulación de empalmes . [1] doble knockouts de UCEs cerca del gen ARX en ratones causó un encogido hipocampo en el cerebro. [13] Los efectos knockout no son letales en ratones de laboratorio, pero podrían ser en la naturaleza.
Ver también
Referencias
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