ATG4A

ATG4A
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 2P82
Identificadores
Alias	ATG4A , APG4A, AUTL2, cisteína peptidasa 4A relacionada con la autofagia
Identificaciones externas	OMIM : 300663 MGI : 2147903 HomoloGene : 70873 GeneCards : ATG4A
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma X (humano) [1] Banda Xq22.3 Comienzo 108.091.668 pb [1] Fin 108,154,671 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma X (ratón) [2] Banda X | X F1 Comienzo 140.956.907 pb [2] Fin 141.164.270 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Bgee Top expresado en bíceps braquial Cuerpo de páncreas corazón músculo gastrocnemio músculo de la pierna páncreas estómago ventrículo izquierdo Más datos de expresión de referencia BioGPS Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular actividad peptidasa actividad peptidasa de tipo cisteína GO: 0001948 unión a proteínas actividad hidrolasa actividad endopeptidasa de tipo cisteína Componente celular citoplasma citosol Proceso biológico autofagia transporte de proteinas autofagia del núcleo Lipidación de la proteína C-terminal deslipidación de proteínas autofagia de la mitocondria montaje de autofagosoma proteolisis proteína dirigida a la membrana Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	115201	666468
Ensembl	ENSG00000101844	ENSMUSG00000079418
UniProt	Q8WYN0	Q8C9S8
RefSeq (ARNm)	NM_052936 NM_178270 NM_178271 NM_001321287 NM_001321288 NM_001321289 NM_001321290	NM_174875
RefSeq (proteína)	NP_001308216 NP_001308217 NP_001308218 NP_001308219 NP_443168 NP_840054 NP_840055	NP_777364 NP_001366610 NP_001366611 NP_001366612 NP_001366613
Ubicación (UCSC)	Chr X: 108,09 - 108,15 Mb	Cr X: 140,96 - 141,16 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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La cisteína proteasa ATG4A es una enzima que en humanos está codificada por el gen ATG4A . ^{[5] [6]}

La autofagia es el proceso por el cual las proteínas endógenas y los orgánulos dañados se destruyen intracelularmente . Se postula que la autofagia es esencial para la homeostasis celular y la remodelación celular durante la diferenciación , la metamorfosis , la muerte celular no apoptótica y el envejecimiento . Se han descrito niveles reducidos de autofagia en algunos tumores malignos y se ha propuesto un papel de la autofagia en el control del crecimiento celular no regulado relacionado con el cáncer. Este gen codifica un miembro de la autofagina.familia de proteínas. La proteína codificada también se designa como miembro de la familia C-54 de cisteína proteasas . Se han identificado variantes de transcripción que codifican distintas isoformas . ^[6]

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000101844 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000079418 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Scherz-Shouval R, Sagiv Y, Shorer H, Elazar Z (abril de 2003). "El terminal COOH de GATE-16, un modulador de transporte intra-Golgi, es escindido por la cisteína proteasa humana HsApg4A" . J Biol Chem . 278 (16): 14053–8. doi : 10.1074 / jbc.M212108200 . PMID 12473658 . 
6. "Gen Entrez: ATG4A ATG4 homólogo 4 relacionado con autofagia A (S. cerevisiae)" .

enlaces externos

• Ubicación del genoma humano ATG4A y página de detalles del gen ATG4A en UCSC Genome Browser .

Otras lecturas

• Scherz-Shouval R, Shvets E, Fass E y col. (2007). "Las especies reactivas de oxígeno son esenciales para la autofagia y regulan específicamente la actividad de Atg4" . EMBO J . 26 (7): 1749–60. doi : 10.1038 / sj.emboj.7601623 . PMC  1847657 . PMID  17347651 .
• Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ y col. (2005). "La secuencia de ADN del cromosoma X humano" . Naturaleza . 434 (7031): 325–37. doi : 10.1038 / nature03440 . PMC  2665286 . PMID  15772651 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA y col. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
• Kabeya Y, Mizushima N, Yamamoto A, et al. (2005). "LC3, GABARAP y GATE16 se localizan en la membrana autofagosomal dependiendo de la formación de la forma II" . J. Cell Sci . 117 (Parte 13): 2805-12. doi : 10.1242 / jcs.01131 . PMID  15169837 .
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038 / ng1285 . PMID  14702039 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH y col. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .

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