El regulador transcripcional ATRX también conocido como helicasa ATRX dependiente de ATP , helicasa II ligada al X o proteína nuclear ligada al X (XNP) es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen ATRX . [5] [6] [7]
ATRX | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | ATRX , ATR2, JMS, MRXHF1, RAD54, RAD54L, SFM1, SHS, XH2, XNP, ZNF-HX, MRX52, alfa talasemia / síndrome de retraso mental ligado al cromosoma X, remodelador de cromatina, remodelador de cromatina ATRX | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 300032 MGI : 103067 HomoloGene : 416 GeneCards : ATRX | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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Ubicación (UCSC) | Cr X: 77,5 - 77,79 Mb | Chr X: 105,8 - 105,93 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
El regulador transcripcional ATRX contiene un dominio ATPasa / helicasa y, por lo tanto, pertenece a la familia SWI / SNF de proteínas remodeladoras de cromatina . Se requiere ATRX para la deposición de la variante de histona H3.3 en los telómeros y otras repeticiones genómicas. [8] Estas interacciones son importantes para mantener el silenciamiento en estos sitios. [9] [10] [11]
Además, ATRX sufre una fosforilación dependiente del ciclo celular, que regula su matriz nuclear y la asociación de la cromatina, y sugiere su participación en la regulación génica en la interfase y la segregación cromosómica en la mitosis. [7]
Significación clínica
Mutaciones heredadas
Las mutaciones heredadas del gen ATRX se asocian con un síndrome de retraso mental ligado al cromosoma X ( XLMR ) acompañado con mayor frecuencia por el síndrome de alfa-talasemia ( ATR-X ). Se ha demostrado que estas mutaciones causan diversos cambios en el patrón de metilación del ADN , lo que puede proporcionar un vínculo entre la remodelación de la cromatina, la metilación del ADN y la expresión génica en los procesos de desarrollo. Se han informado múltiples variantes de transcripciones empalmadas alternativamente que codifican distintas isoformas. Las mujeres portadoras pueden demostrar una inactivación del cromosoma X sesgada . [7]
Mutaciones somáticas
Se han informado mutaciones adquiridas en ATRX en varios cánceres humanos, incluidos tumores neuroendocrinos pancreáticos, [12] gliomas, [13] astrocitomas, [14] osteosarcomas, [15] y feocromocitomas malignos. [16] Existe una fuerte correlación entre las mutaciones de ATRX y un fenotipo de alargamiento alternativo de los telómeros (ALT) en los cánceres. [12]
Interacciones
ATRX forma un complejo con DAXX que es una histona H3.3 acompañante. [17]
También se ha demostrado que ATRX interactúa con EZH2 . [18]
Ver también
- Síndrome de retraso mental por alfa-talasemia
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000085224 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031229 - Ensembl , mayo de 2017
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Otras lecturas
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enlaces externos
- Entrada de GeneReviews / NCBI / NIH / UW sobre el síndrome de retraso mental ligado a alfa-talasemia X; Síndrome de ATRX; Alfa talasemia / retraso mental, ligado al cromosoma X; XLMR-síndrome de la cara hipotónica
- Entradas de OMIM sobre el síndrome de retraso mental ligado a la alfa-talasemia X
- Ubicación del genoma humano ATRX y página de detalles del gen ATRX en UCSC Genome Browser .
- Ubicación del genoma humano RAD54L y página de detalles del gen RAD54L en UCSC Genome Browser .