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Alameticina [1]
Alamethicin.png
Nombres
Nombre IUPAC
N -acetil-2-methylalanyl- L prolil-2-methylalanyl- L alanil-2-methylalanyl- L -alanyl- L -glutaminyl-2-methylalanyl- L valil-2-methylalanylglycyl- L leucil-2- methylalanyl- L prolil- L valil-2-metilalanilo-2-methylalanyl- L -α-glutamil N 1 - [(1 S ) -1-bencil-2-hidroxietil] - L -glutamamide
Identificadores
  • 27061-78-5 chequeY
Modelo 3D ( JSmol )
CHEMBL
ChemSpider
Tarjeta de información ECHA100.121.626 Edita esto en Wikidata
UNII
  • InChI=1S/C92H150N22O25/c1-47(2)43-58(72(127)108-92(24,25)84(139)113-41-29-33-59(113)73(128)103-65(48(3)4)75(130)111-90(20,21)82(137)112-89(18,19)80(135)102-56(37-40-64(120)121)70(125)101-55(35-38-61(93)117)69(124)98-54(46-115)44-53-31-27-26-28-32-53)99-63(119)45-95-77(132)85(10,11)110-76(131)66(49(5)6)104-81(136)88(16,17)107-71(126)57(36-39-62(94)118)100-67(122)50(7)96-78(133)86(12,13)106-68(123)51(8)97-79(134)87(14,15)109-74(129)60-34-30-42-114(60)83(138)91(22,23)105-52(9)116/h26-28,31-32,47-51,54-60,65-66,115H,29-30,33-46H2,1-25H3,(H2,93,117)(H2,94,118)(H,95,132)(H,96,133)(H,97,134)(H,98,124)(H,99,119)(H,100,122)(H,101,125)(H,102,135)(H,103,128)(H,104,136)(H,105,116)(H,106,123)(H,107,126)(H,108,127)(H,109,129)(H,110,131)(H,111,130)(H,112,137)(H,120,121)/t50-,51-,54-,55-,56-,57-,58-,59-,60-,65-,66-/m0/s1 checkY
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  • CC(C)CC(C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1CCCC1C(=O)NC(C(C)C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)NC(CCC(=O)N)C(=O)NC(Cc2ccccc2)CO)NC(=O)CNC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(CCC(=O)N)NC(=O)C(C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C3CCCN3C(=O)C(C)(C)NC(=O)C
Propiedades
C 92 H 150 N 22 O 25
Masa molar1964,31 g / mol
AparienciaSólido blanquecino
Punto de fusion 255 a 270 ° C (491 a 518 ° F; 528 a 543 K)
Insoluble
Solubilidad en DMSO , metanol , etanolSoluble
Salvo que se indique lo contrario, los datos se proporcionan para materiales en su estado estándar (a 25 ° C [77 ° F], 100 kPa).
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Referencias de Infobox

La alameticina es un antibiótico peptídico formador de canales , producido por el hongo Trichoderma viride . Pertenece a los péptidos de peptaibol que contienen el residuo de aminoácido no proteinogénico Aib ( ácido 2-aminoisobutírico ). Este residuo induce fuertemente la formación de una estructura alfa helicoidal . La secuencia de péptidos es:

Ac-Aib-Pro-Aib-Ala-Aib-Ala-Gln-Aib-Val-Aib-Gly-Leu-Aib-Pro-Val-Aib-Aib-Glu-Gln-Phl

(Ac = acetilo, Phl = fenilalaninol , Aib = ácido 2-aminoisobutírico )

En las membranas celulares , se forma de voltaje dependientes de iones de canales por agregación de cuatro a seis moléculas .

Biosíntesis

Se hipotetiza que la biosíntesis de alameticina está catalizada por alameticina sintasa, una péptido sintasa no ribosomal (NRPS) aislada por primera vez en 1975. [2] Aunque hay varias secuencias del péptido de alameticina aceptadas, [3] la evidencia sugiere que todas siguen el mecanismo general de NRPS [ 4] con pequeñas variaciones en determinados aminoácidos. [5] Comenzando con la acilación del N terminal del primer ácido aminoisobutírico en la enzima ALM sintasa por Acetil-CoA , [6] esto es seguido por la condensación secuencial de aminoácidos por cada unidad modular de la sintetasa. [7]Los aminoácidos se adenilan inicialmente mediante un dominio de " adenilación " (A) antes de unirse mediante un enlace tioéster a una proteína transportadora de peptidilo similar a la proteína transportadora de acilo . [8] La cadena en crecimiento se une al aminoácido que lleva PCP mediante el dominio de "condensación" (C), seguido de otra ronda de las mismas reacciones en el siguiente módulo. [8]

El mecanismo general de síntesis de NRPS en alameticina, que muestra la condensación de sustratos de aminoácidos de un módulo a otro. Ac = Acetil Aib = ácido aminoisobutírico. Componentes del módulo: A = Adenililación PCP = Proteína portadora de peptidilo C = Condensación

El ensamblaje se completa con la adición de fenilalaninol, un inusual sustrato similar a un aminoácido. [9] Después de la adición de fenilalaninol, la cadena peptídica completa es escindida por el dominio tioesterasa, escindiendo el enlace tioéster y dejando un alcohol.

Un diagrama de los módulos individuales y elongación de la biosíntesis de alameticina. La cadena de péptidos en crecimiento se muestra para cada módulo, terminando en la escisión del tioéster y la generación de alameticina lineal. Ac = Acetil Aib = Ácido aminoisobutírico Pheol = Fenilalaninol. Componentes del módulo: A = Adenililación PCP = Proteína portadora de peptidilo C = Condensación

Referencias

  1. ^ Página del producto alameticina de Fermentek
  2. ^ Rindfleisch, H .; Kleinkauf, H. (1 de marzo de 1976). "Biosíntesis de alameticina" . Cartas FEBS . 62 (3): 276–280. doi : 10.1016 / 0014-5793 (76) 80074-9 . ISSN  0014-5793 . PMID  945191 .
  3. ^ Kirschbaum, Jochen; Krause, Corina; Winzheimer, Ruth K .; Brückner, Hans (noviembre-diciembre de 2003). "Secuencias de alameticinas F30 y F50 reconsideradas y reconciliadas". Revista de ciencia de péptidos . 9 (11-12): 799-809. doi : 10.1002 / psc.535 . ISSN 1075-2617 . PMID 14658799 .  
  4. ^ Marahiel, Mohamed A .; Stachelhaus, Torsten; Mootz, Henning D. (1 de noviembre de 1997). "Sintetasas de péptidos modulares implicados en la síntesis de péptidos no ribosomales". Revisiones químicas . 97 (7): 2651-2674. doi : 10.1021 / cr960029e . ISSN 0009-2665 . PMID 11851476 .  
  5. ^ Kleinkauf, H .; Rindfleisch, H. (1975). "Biosíntesis no ribosomal del octadecapéptido cíclico alameticina". Acta Microbiologica Academiae Scientiarum Hungaricae . 22 (4): 411–418. ISSN 0001-6187 . PMID 1241650 .  
  6. ^ Mohr, H .; Kleinkauf, H. (12 de octubre de 1978). "Biosíntesis de alameticina: acetilación del extremo amino y unión de fenilalaninol". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Enzimología . 526 (2): 375–386. doi : 10.1016 / 0005-2744 (78) 90129-8 . ISSN 0006-3002 . PMID 568941 .  
  7. ^ Weber, Thomas; Marahiel, Mohamed A (enero de 2001). "Exploración de la estructura del dominio de sintetasas modulares de péptidos no ribosomales" . Estructura . 9 (1): –3 – R9. doi : 10.1016 / S0969-2126 (00) 00560-8 . ISSN 0969-2126 . PMID 11342140 .  
  8. ↑ a b Fischbach, Michael A .; Walsh, Christopher T. (agosto de 2006). "Enzimología de línea de montaje de antibióticos policétidos y péptidos no ribosómicos: lógica, maquinaria y mecanismos". Revisiones químicas . 106 (8): 3468–3496. doi : 10.1021 / cr0503097 . ISSN 0009-2665 . PMID 16895337 .  
  9. ^ Turner, S. Richard; Voit, Brigitte I .; Mourey, Thomas H. (1 de agosto de 1993). "Poliésteres hiperramificados totalmente aromáticos con grupos terminales C-fenilalaninol y N-acetato: síntesis y caracterización". Macromoléculas . 26 (17): 4617–4623. Código Bibliográfico : 1993MaMol..26.4617T . doi : 10.1021 / ma00069a031 . ISSN 0024-9297 . 

Lectura adicional

  • Jones, LR; Maddock, SW; Besch, HR Jr (1980). "Efecto desenmascarador de alameticina sobre la (Na +, K +) - ATPasa, adenilato ciclasa acoplada al receptor beta-adrenérgico y actividades de proteína quinasa dependientes de AMPc de vesículas sarcolemáticas cardíacas". J. Biol. Chem . 255 (20): 9971–9980. PMID  6253461 .
  • Explore las estructuras de alameticina en el banco de datos de proteínas
  • Alamethicin en Norine
    • A partir de "Un modelo de canal iónico dependiente de voltaje inferido de la estructura cristalina de alameticina a una resolución de 1,5 A". Fox Jr., RO; Richards, FM (1982). "Un modelo de canal iónico dependiente de voltaje inferido de la estructura cristalina de alameticina a una resolución de 1,5 A". Naturaleza . 300 (5890): 325-30. Código Bib : 1982Natur.300..325F . doi : 10.1038 / 300325a0 . PMID 6292726 . 
  • Leitgeb, Balázs; Szekeres, András; Manczinger, László; Vágvölgyi, Csaba; Kredics, László (1 de junio de 2007). "La historia de la alameticina: una revisión del Peptaibol más ampliamente estudiado". Química y Biodiversidad . 4 (6): 1027–1051. doi : 10.1002 / cbdv.200790095 . ISSN  1612-1880 . PMID  17589875 .