La supuesta auxilina tirosina-proteína fosfatasa es una enzima que en los seres humanos está codificada por el gen DNAJC6 . [5] [6] [7]
DNAJC6 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | DNAJC6 , DJC6, PARK19, Auxilin, miembro C6 de la familia de proteínas de choque térmico DnaJ (Hsp40) | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 608375 MGI : 1919935 HomoloGene : 8865 GeneCards : DNAJC6 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 1: 65,25 - 65,42 Mb | Crónicas 4: 101,5 - 101,64 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
DNAJC6 pertenece a la familia de proteínas DNAJ / HSP40 conservadas evolutivamente, que regulan la actividad de chaperona molecular estimulando la actividad de ATPasa. Las proteínas DNAJ pueden tener hasta 3 dominios distintos: un dominio J conservado de 70 aminoácidos, generalmente en el extremo N, una región rica en glicina / fenilalanina (G / F) y un dominio rico en cisteína que contiene 4 motivos que se asemejan a un zinc. -Dominio de los dedos (Ohtsuka y Hata, 2000). [7]
Estructura
El dominio de proteína tirosina fosfatasa y el par de dominios C2 de auxilina, ubicado cerca del extremo N-terminal del polipéptido, constituyen un superdominio, una disposición en tándem de dos o más dominios nominalmente no relacionados que forman una única unidad hereditaria. [8] El dominio de la fosfatasa pertenece a la subfamilia de las fosfatasas lipídicas de las auxilinas y se prevé que sea catalíticamente inactivo. [9] [10]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000116675 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028528 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Seki N, Ohira M, Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Nakajima D, Nomura N, Ohara O (octubre de 1997). "Caracterización de clones de ADNc en bibliotecas de ADNc de tamaño fraccionado de cerebro humano" . Investigación de ADN . 4 (5): 345–9. doi : 10.1093 / dnares / 4.5.345 . PMID 9455484 .
- ^ Ohtsuka K, Hata M (abril de 2000). "Homólogos de mamíferos HSP40 / DNAJ: clonación de nuevos cDNA y una propuesta para su clasificación y nomenclatura" . Estrés celular y acompañantes . 5 (2): 98-112. doi : 10.1379 / 1466-1268 (2000) 005 <0098: MHDHCO> 2.0.CO; 2 . PMC 312896 . PMID 11147971 .
- ^ a b "Entrez Gene: homólogo de DNAJC6 DnaJ (Hsp40), subfamilia C, miembro 6" .
- ^ Haynie DT, Xue B (mayo de 2015). "Superdominios en la jerarquía de estructura de proteínas: el caso de PTP-C2" . Ciencia de las proteínas . 24 (5): 874–82. doi : 10.1002 / pro.2664 . PMC 4420535 . PMID 25694109 .
- ^ "Auxilina de la subfamilia de fosfatasa - PhosphataseWiki" . phosphatome.net .
- ^ Chen MJ, Dixon JE, Manning G (abril de 2017). "Genómica y evolución de las proteínas fosfatasas". Señalización científica . 10 (474): eaag1796. doi : 10.1126 / scisignal.aag1796 . PMID 28400531 . S2CID 41041971 .
enlaces externos
- Ubicación del genoma humano DNAJC6 y página de detalles del gen DNAJC6 en UCSC Genome Browser .
Otras lecturas
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (septiembre de 2004). "La comparación de secuencias de genes humanos y de ratón revela una estructura de bloques homóloga en las regiones promotoras" . Investigación del genoma . 14 (9): 1711–8. doi : 10.1101 / gr.2435604 . PMC 515316 . PMID 15342556 .
- Scheele U, Alves J, Frank R, Duwel M, Kalthoff C, Ungewickell E (julio de 2003). "Caracterización molecular y funcional de los determinantes de unión de clatrina y AP-2 dentro de un dominio desordenado de auxilina" . La revista de química biológica . 278 (28): 25357–68. doi : 10.1074 / jbc.M303738200 . PMID 12732633 .
- Scheele U, Kalthoff C, Ungewickell E (septiembre de 2001). "Múltiples interacciones de auxilina 1 con clatrina y el complejo adaptador AP-2" . La revista de química biológica . 276 (39): 36131–8. doi : 10.1074 / jbc.M106511200 . PMID 11470803 .
- Ishikawa K, Nagase T, Nakajima D, Seki N, Ohira M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (octubre de 1997). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. VIII. 78 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro" . Investigación de ADN . 4 (5): 307–13. doi : 10.1093 / dnares / 4.5.307 . PMID 9455477 .