BDP1

BDP1
Identificadores
Alias	BDP1 , HSA238520, TAF3B1, TFC5, TFIIIB , TFIIIB150, TFIIIB90, TFNR, B doble primo 1, subunidad de ARN polimerasa III factor de iniciación de la transcripción IIIB, DFNB112
Identificaciones externas	OMIM : 607012 MGI : 1347077 HomoloGene : 34582 GeneCards : BDP1
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 5 (humano) [1] Banda 5q13.2 Comienzo 71.455.651 pb [1] Fin 71.567.820 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 13 (ratón) [2] Banda 13 D1 | 13 52,92 cm Comienzo 100.017.994 pb [2] Fin 100.104.070 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • la unión al ADN • de clase TFIIIC factor de transcripción complejo de unión • ARN polimerasa III actividad del factor de iniciación de la transcripción en general Componente celular • núcleo • complejo de factor de transcripción TFIIIB • nucleoplasma Proceso biológico • regulación de la transcripción por la ARN polimerasa III • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • transcripción, plantilla de ADN • Ensamblaje del complejo de preiniciación de ARN polimerasa III • transcripción por ARN polimerasa III Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	55814	544971
Ensembl	ENSG00000274803 ENSG00000273873 ENSG00000145734	ENSMUSG00000049658
UniProt	A6H8Y1 H7C5U4	Q571C7
RefSeq (ARNm)	NM_018429	NM_001081061
RefSeq (proteína)	NP_060899	NP_001074530
Ubicación (UCSC)	Crónicas 5: 71,46 - 71,57 Mb	Crónicas 13: 100,02 - 100,1 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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El homólogo del componente B ”del factor de transcripción TFIIIB también conocido como TFIIIB150 es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen BDP1 . ^{[5] [6] [7]}

Función

TFIIIB150 es una subunidad del complejo de iniciación de la transcripción TFIIIB, que recluta ARN polimerasa III para apuntar a los promotores con el fin de iniciar la transcripción. La proteína codificada se localiza en agregados concentrados en el núcleo y es necesaria para la transcripción de los tres tipos de promotores de la polimerasa III. Es fosforilado por la caseína quinasa 2 durante la mitosis , lo que resulta en su liberación de la cromatina y la supresión de la transcripción de la polimerasa III. ^[7]

Referencias

1. ENSG00000273873, ENSG00000145734 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000274803, ENSG00000273873, ENSG00000145734 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000049658 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Nagase T, Kikuno R, Hattori A, Kondo Y, Okumura K, Ohara O (febrero de 2001). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XIX. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro" . DNA Res . 7 (6): 347–55. doi : 10.1093 / dnares / 7.6.347 . PMID 11214970 . 
6. Schramm L, Pendergrast PS, Sun Y, Hernandez N (noviembre de 2000). "Diferentes actividades de TFIIIB humano dirigen la transcripción de la ARN polimerasa III de promotores que contienen y que no contienen TATA" . Genes Dev . 14 (20): 2650–63. doi : 10.1101 / gad.836400 . PMC 316990 . PMID 11040218 .  
7. "Entrez Gene: BDP1 B doble prima 1, subunidad del factor de iniciación de la transcripción de ARN polimerasa III IIIB" .

Otras lecturas

• Chu WM, Wang Z, Roeder RG, Schmid CW (1997). "Transcripción de la ARN polimerasa III reprimida por Rb a través de sus interacciones con TFIIIB y TFIIIC2" . J. Biol. Chem . 272 (23): 14755–61. doi : 10.1074 / jbc.272.23.14755 . PMID  9169441 .
• Wang Z, Roeder RG (1997). "Tres subunidades específicas de la ARN polimerasa III humana forman un subcomplejo con una función selectiva en el inicio de la transcripción específico" . Genes Dev . 11 (10): 1315-26. doi : 10.1101 / gad.11.10.1315 . PMID  9171375 .
• Nagase T, Ishikawa K, Kikuno R, et al. (2000). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XV. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro" . DNA Res . 6 (5): 337–45. doi : 10.1093 / dnares / 6.5.337 . PMID  10574462 .
• Kelter AR, Herchenbach J, Wirth B (2001). "El regulador nuclear similar al factor de transcripción (TFNR) contiene un motivo novedoso de 55 aminoácidos repetido nueve veces y se asigna de cerca a SMN1". Genómica . 70 (3): 315-26. doi : 10.1006 / geno.2000.6396 . PMID  11161782 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH y col. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
• Hu P, Wu S, Hernández N (2003). "Un sistema de transcripción mínima de ARN polimerasa III de células humanas revela funciones reguladoras positivas y negativas para CK2" . Mol. Celular . 12 (3): 699–709. doi : 10.1016 / j.molcel.2003.08.011 . PMID  14527415 .
• Fairley JA, Scott PH, White RJ (2003). "TFIIIB se fosforila, se rompe y se libera selectivamente de los promotores de ARNt durante la mitosis in vivo" . EMBO J . 22 (21): 5841–50. doi : 10.1093 / emboj / cdg544 . PMC  275401 . PMID  14592981 .
• Weser S, Gruber C, Hafner HM y col. (2004). "Regulador nuclear similar al factor de transcripción (TF), la forma de 250 kDa de Homo sapiens TFIIIB", es un componente esencial de la actividad TFIIIC1 humana " . J. Biol. Chem . 279 (26): 27022-9. Doi : 10.1074 /jbc.M312790200 . PMID  15096501 .
• Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, et al. (2004). "La comparación de secuencias de genes humanos y de ratón revela una estructura de bloques homóloga en las regiones promotoras" . Genome Res . 14 (9): 1711–8. doi : 10.1101 / gr.2435604 . PMC  515316 . PMID  15342556 .
• Hu P, Samudre K, Wu S y col. (2004). "La fosforilación de CK2 de Bdp1 ejecuta la represión de la transcripción de la ARN polimerasa III específica del ciclo celular" . Mol. Celular . 16 (1): 81–92. doi : 10.1016 / j.molcel.2004.09.008 . PMID  15469824 .
• Schoenen F, Wirth B (2006). "La proteína de dedo de zinc ZNF297B interactúa con BDP1, una subunidad de TFIIIB". Biol. Chem . 387 (3): 277–84. doi : 10.1515 / BC.2006.037 . PMID  16542149 . S2CID  28560128 .
• Johnson SS, Zhang C, Fromm J y col. (2007). "Mammalian Maf1 es un regulador negativo de la transcripción de las tres polimerasas nucleares de ARN" . Mol. Celular . 26 (3): 367–79. doi : 10.1016 / j.molcel.2007.03.021 . PMID  17499043 .

enlaces externos

• FactorBook BDP1
• Ubicación del genoma humano BDP1 y página de detalles del gen BDP1 en UCSC Genome Browser .

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