El dominio de cremallera de leucina básico ( dominio bZIP ) se encuentra en muchas proteínas eucariotas que se unen al ADN . Una parte del dominio contiene una región que media las propiedades de unión al ADN específicas de la secuencia y la cremallera de leucina que se requiere para mantener juntas (dimerizar) dos regiones de unión al ADN. La región de unión al ADN comprende varios aminoácidos básicos como arginina y lisina . Las proteínas que contienen este dominio son factores de transcripción . [1] [2]
factor de transcripción bZIP | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | bZIP_1 | |||||||
Pfam | PF00170 | |||||||
InterPro | IPR011616 | |||||||
PROSITE | PDOC00036 | |||||||
SCOP2 | 1ysa / SCOPe / SUPFAM | |||||||
CDD | cd14686 | |||||||
Membranome | 235 | |||||||
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factores de transcripción bZIP
Los factores de transcripción bZIP se encuentran en todos los eucariotas y forman una de las familias más grandes de TF dimerizantes. [3] [4] Un estudio evolutivo de 2008 reveló que 4 genes bZIP estaban codificados por el genoma del ancestro común más reciente de todas las plantas. [5] Las interacciones entre los factores de transcripción bZIP son numerosas y complejas [6] [7] [3] y desempeñan funciones importantes en el desarrollo del cáncer [8] en los tejidos epiteliales, la síntesis de hormonas esteroides por las células de los tejidos endocrinos, [9] los factores que afectan la reproducción funciones, [10] y varios otros fenómenos que afectan la salud humana.
Dominio bZIP que contiene proteínas
- Heterodímero AP-1 fos / jun que forma un factor de transcripción
- Factor de transcripción Jun-B
- Factor de transcripción del elemento de respuesta CREB cAMP
- Factor de transcripción OPAQUE2 (O2) del gen zein de 22 kD que codifica una clase de proteínas de almacenamiento en el endospermo de los granos de maíz ( Zea Mays )
- NFE2L2 o Nrf2
- Factores de transcripción de Bzip Maf
Proteínas humanas que contienen este dominio
ATF1 ; ATF2 ; ATF4 ; ATF5 ; ATF6 ; ATF7 ; BACH1 ; BACH2 ; BATF ; BATF2 ; CEBPA ; CEBPB ; CEBPD ; CEBPE ; CEBPG ; CEBPZ ; CREB1 ; CREB3 ; CREB3L1 ; CREB3L2 ; CREB3L3 ; CREB3L4 ; CREB5 ; CREBL1 ; CREM ; E4BP4 ; FOSL1 ; FOSL2 ; JUN ; JUNB ; JUND ; MAFA ; MAFB ; NFE2 ; NFE2L2 ; NFE2L3 ; SNFT ; XBP1
Referencias
- ^ Ellenberger T (1994). "Obtener un control en el reconocimiento de ADN: estructuras de la cremallera de leucina de la región básica y los dominios de unión al ADN de la región básica hélice-bucle-hélice". Curr. Opin. Struct. Biol . 4 (1): 12-21. doi : 10.1016 / S0959-440X (94) 90054-X .
- ^ Hurst HC (1995). "Factores de transcripción 1: proteínas bZIP". Perfil de proteínas . 2 (2): 101–68. PMID 7780801 .
- ^ a b Amoutzias, GD; Veron, AS; Weiner, J .; Robinson-Rechavi, M .; Bornberg-Bauer, E .; Oliver, SG; Robertson, DL (1 de marzo de 2007). "Mil millones de años de evolución del factor de transcripción bZIP: conservación y cambio en la dimerización y la especificidad del sitio de unión al ADN" . Biología Molecular y Evolución . 24 (3): 827–835. doi : 10.1093 / molbev / msl211 . ISSN 0737-4038 . PMID 17194801 .
- ^ Amoutzias, Grigoris D .; Robertson, David L .; Van de Peer, Yves; Oliver, Stephen G. (1 de mayo de 2008). "Elija sus socios: dimerización en factores de transcripción eucariotas". Tendencias en Ciencias Bioquímicas . 33 (5): 220-229. doi : 10.1016 / j.tibs.2008.02.002 . ISSN 0968-0004 . PMID 18406148 .
- ^ Corrêa LG, Riaño-Pachón DM, Schrago CG, dos Santos RV, Mueller-Roeber B, Vincentz M (2008). Shiu S (ed.). "El papel de los factores de transcripción bZIP en la evolución de las plantas verdes: características adaptativas que surgen de los cuatro genes fundadores" . PLOS ONE . 3 (8): e2944. doi : 10.1371 / journal.pone.0002944 . PMC 2492810 . PMID 18698409 .
- ^ Vinson, Charles; Acharya, Asha; Taparowsky, Elizabeth J. (1 de enero de 2006). "Descifrando las interacciones del factor de transcripción B-ZIP in vitro e in vivo" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Estructura y expresión génica . 1759 (1–2): 4–12. doi : 10.1016 / j.bbaexp.2005.12.005 . ISSN 0006-3002 . PMID 16580748 .
- ^ Newman, John RS; Keating, Amy E. (27 de junio de 2003). "Identificación completa de interacciones bZIP humanas con matrices de bobinas en espiral". Ciencia . 300 (5628): 2097–2101. doi : 10.1126 / science.1084648 . ISSN 1095-9203 . PMID 12805554 . S2CID 36715183 .
- ^ Vlahopoulos SA, Logotheti S, Mikas D, Giarika A, Gorgoulis V, Zoumpourlis V (abril de 2008). "El papel de ATF-2 en la oncogénesis". BioEssays . 30 (4): 314-27. doi : 10.1002 / bies.20734 . PMID 18348191 . S2CID 678541 .
- ^ Manna PR, Dyson MT, Eubank DW, Clark BJ, Lalli E, Sassone-Corsi P, Zeleznik AJ, Stocco DM (enero de 2002). "Regulación de la esteroidogénesis y la proteína reguladora aguda esteroidogénica por un miembro de la familia de proteínas de unión al elemento de respuesta al AMPc" . Mol. Endocrinol . 16 (1): 184–99. doi : 10.1210 / me.16.1.184 . PMID 11773448 .
- ^ Hoare S, Copland JA, Wood TG, Jeng YJ, Izban MG, Soloff MS (mayo de 1999). "Identificación de un sitio de unión de GABP alfa / beta implicado en la inducción de la expresión del gen del receptor de oxitocina en células de mama humana, potenciación por c-Fos / c-Jun" . Endocrinología . 140 (5): 2268–79. doi : 10.1210 / es.140.5.2268 . PMID 10218980 .
enlaces externos
- Entrada de dominio bZIP en la base de datos SMART
- Familia bZIP en PlantTFDB: Base de datos de factores de transcripción de plantas
- Factores de transcripción de Plant bZIP Archivado el 20 de marzo de 2012 en la Wayback Machine.