CDK5R1

CDK5R1
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 1H4L , 1UNG , 1UNH , 1UNL , 3O0G
Identificadores
Alias	CDK5R1 , CDK5P35, CDK5R, NCK5A, p23, p25, p35, p35nck5a, quinasa 5 dependiente de ciclina, subunidad reguladora 1 (p35), subunidad reguladora 1 de quinasa 5 dependiente de ciclina
Identificaciones externas	OMIM : 603460 MGI : 101764 HomoloGene : 31200 GeneCards : CDK5R1
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 17 (humano) [1] Banda 17q11.2 Comienzo 32 486 993 pb [1] Fin 32 491 253 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 11 (ratón) [2] Banda 11 B5 | 11 47,94 cm Comienzo 80 477 023 pb [2] Fin 80.481.184 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • actividad de proteína quinasa • unión de iones de calcio • efrina de unión al receptor • cadherina unión • GO: 0016534 proteína dependiente de ciclina de la serina / treonina quinasa activador actividad • quinasa actividad • GO: proteína 0001948 unión • proteína quinasa de unión • serina / treonina proteína quinasa activador actividad • unión proteasa • actina de unión • receptor de glutamato ionotrópicos de unión • unión alfa-tubulina • beta-tubulina de unión • actina de unión de filamentos • actividad activadora de la proteína quinasa Componente celular • citoplasma • citosol • membrana • GO: 0097483, GO: 0097481 densidad postsináptica • orgánulo delimitado por la membrana intracelular • cono de crecimiento • unión neuromuscular • espina dendrítica • axón • cuerpo celular neuronal • dendrita • complejo de proteína quinasa 5 • región perinuclear del citoplasma • fibra contráctil • núcleo • nucleoplasma • membrana celular • microtúbulos • proyección de neuronas • presinapsis Proceso biológico • regulación positiva de la actividad de proteína quinasa • regulación de la diferenciación de neuronas • G receptor de acetilcolina acoplado a la proteína vía de señalización • regulación de la proteína dependiente de ciclina de la serina / treonina quinasa actividad • regulación de actina organización del citoesqueleto • el desarrollo del embrión • proceso rítmico • ephrin receptor vía de señalización • adhesión célula-neurona • regulación de la organización del citoesqueleto de los microtúbulos • migración de neuronas • desarrollo del cerebelo • regulación positiva de la actividad de la proteína serina / treonina quinasa • Regulación positiva del proceso apoptótico neuronal • Desarrollo cerebral • Vía de señalización del receptor de glutamato ionotrópico • Formación de capas en la corteza cerebral • Fosforilación de peptidil-serina • Diferenciación neuronal • Proliferación de la población celular • Fosforilación de peptidil-treonina • Regulación negativa de la transcripción, plantilla de ADN • Neurona desarrollo de la proyección • migración de células de orientación radial de la corteza cerebral • fasciculación axonal • desarrollo del hipocampo • regulación negativa de la extensión del axón • Regulación de la morfogénesis de la columna dendrítica • Regulación de la macroautofagia • Maduración del núcleo olivar superior • Regulación positiva de la orientación de la proteína a la membrana • Guía del axón • Regulación de la transducción de señales por el mediador de la clase p53 • Fosforilación de la proteína STAT en la serina • Organización del citoesqueleto de los microtúbulos • Desarrollo del embrión que termina en nacimiento o eclosión del huevo • regulación positiva de la polimerización de microtúbulos • regulación positiva de la actividad de la proteína serina / treonina quinasa dependiente de ciclina • regulación del ciclo de vesículas sinápticas • activación de la actividad de la proteína quinasa Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	8851	12569
Ensembl	ENSG00000176749	ENSMUSG00000048895
UniProt	Q15078	P61809
RefSeq (ARNm)	NM_003885	NM_009871
RefSeq (proteína)	NP_003876	NP_034001
Ubicación (UCSC)	Crónicas 17: 32,49 - 32,49 Mb	Crónicas 11: 80,48 - 80,48 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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El activador 1 de la quinasa 5 dependiente de ciclina es una enzima que en humanos está codificada por el gen CDK5R1 . ^{[5] [6]}

Función

La proteína codificada por este gen (p35) es un activador neuronal específico de la quinasa 5 dependiente de ciclina (CDK5); la activación de CDK5 es necesaria para el correcto desarrollo del sistema nervioso central. La forma p35 de esta proteína es escindida proteolíticamente por la calpaína , generando una forma p25. La escisión de p35 en p25 da como resultado la relocalización de la proteína desde la periferia celular hacia las regiones nuclear y perinuclear. P25 desregula la actividad de CDK5 al prolongar su activación y cambiar su ubicación celular. La forma p25 se acumula en las neuronas del cerebro de pacientes con enfermedad de Alzheimer. Esta acumulación se correlaciona con un aumento en la actividad de la quinasa CDK5 y puede conducir a formas aberrantemente fosforiladas de la proteína tau asociada a microtúbulos, que contribuye aEnfermedad de Alzheimer . ^[6]

En las células melanocíticas, la expresión del gen CDK5R1 puede estar regulada por MITF . ^[7]

Interacciones

Se ha demostrado que CDK5R1 interactúa con:

• Actinina, alfa 1 ^[8]
• Anfifisina , ^[9]
• Beta-catenina , ^[10]
• CAMK2A , ^[11]
• CDK5RAP2 , ^[12]
• Quinasa dependiente de ciclina 5 , ^{[13] [14]}
• SET de proteínas , ^[15]

Ver también

• CDK5RAP1
• CDK5RAP2
• CDK5RAP3

Referencias

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000176749 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000048895 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Tsai LH, Delalle I, Caviness VS Jr, Chae T, Harlow E (octubre de 1994). "p35 es una subunidad reguladora neural específica de la quinasa 5 dependiente de ciclina". Naturaleza . 371 (6496): 419–23. doi : 10.1038 / 371419a0 . PMID 8090221 . S2CID 4267944 .  
6. "Gen Entrez: quinasa 5 dependiente de ciclina CDK5R1, subunidad reguladora 1 (p35)" .
7. Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, et al. (2008). "Nuevos objetivos MITF identificados mediante una estrategia de microarrays de ADN de dos pasos" . Melanoma de células pigmentarias Res . 21 (6): 665–76. doi : 10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971 . S2CID 24698373 .  
8. Cheng K, Li Z, Fu WY, Wang JH, Fu AK, Ip NY (agosto de 2002). "Pctaire1 interactúa con p35 y es un sustrato novedoso para Cdk5 / p35" . J. Biol. Chem . 277 (35): 31988–93. doi : 10.1074 / jbc.M201161200 . PMID 12084709 . 
9. Floyd SR, Porro EB, Slepnev VI, Ochoa GC, Tsai LH, De Camilli P (marzo de 2001). "La anfifisina 1 se une a la subunidad reguladora p35 de la quinasa dependiente de ciclina (cdk) 5 y es fosforilada por cdk5 y cdc2" . J. Biol. Chem . 276 (11): 8104–10. doi : 10.1074 / jbc.M008932200 . PMID 11113134 . 
10. Kesavapany S, Lau KF, McLoughlin DM, Brownlees J, Ackerley S, Leigh PN, Shaw CE, Miller CC (enero de 2001). "p35 / cdk5 se une y fosforila beta-catenina y regula la interacción beta-catenina / presenilina-1". EUR. J. Neurosci . 13 (2): 241–7. doi : 10.1046 / j.1460-9568.2001.01376.x . PMID 11168528 . 
11. Dhavan R, Greer PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsai LH (septiembre de 2002). "Los activadores de la quinasa 5 dependientes de ciclina p35 y p39 interactúan con la subunidad alfa de la proteína quinasa II dependiente de Ca2 + / calmodulina y la alfa-actinina-1 de una manera dependiente del calcio" . J. Neurosci . 22 (18): 7879–91. doi : 10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002 . PMC 6758084 . PMID 12223541 .  
12. Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M, Wang JH (octubre de 2000). "Identificación de una región de asociación de proteína común en el activador neuronal Cdk5" . J. Biol. Chem . 275 (41): 31763–9. doi : 10.1074 / jbc.M004358200 . PMID 10915792 . 
13. Chen F, Studzinski GP (junio de 2001). "La expresión del activador de quinasa 5 dependiente de ciclina neuronal p35Nck5a en células monocíticas humanas está asociada con la diferenciación" . Sangre . 97 (12): 3763–7. doi : 10.1182 / sangre.V97.12.3763 . PMID 11389014 . 
14. Tarricone C, Dhavan R, Peng J, Areces LB, Tsai LH, Musacchio A (septiembre de 2001). "Estructura y regulación del complejo CDK5-p25 (nck5a)" . Mol. Celular . 8 (3): 657–69. doi : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00343-4 . PMID 11583627 . 
15. Qu D, Li Q, Lim HY, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (marzo de 2002). "La proteína SET se une al activador neuronal de Cdk5 p35nck5a y modula la actividad de Cdk5 / p35nck5a" . J. Biol. Chem . 277 (9): 7324–32. doi : 10.1074 / jbc.M107270200 . PMID 11741927 . 

Otras lecturas

• Peruzzi F, Gordon J, Darbinian N, Amini S (2003). "Desregulación inducida por Tat de la diferenciación neuronal y la supervivencia por la vía del factor de crecimiento nervioso". J. Neurovirol . 8 Suppl 2 (2): 91–6. doi : 10.1080 / 13550280290167885 . PMID  12491158 .
• Studzinski GP, Harrison JS (2003). "La actividad del activador de quinasa 5 neuronal dependiente de ciclina p35Nck5a y Cdk5 en células monocíticas". Leuk. Linfoma . 44 (2): 235–40. doi : 10.1080 / 1042819021000030009 . PMID  12688339 . S2CID  30242995 .
• Takahashi M, Tomizawa K, Sato K y col. (1995). "Una nueva tau-tubulina quinasa de cerebro bovino" . FEBS Lett . 372 (1): 59–64. doi : 10.1016 / 0014-5793 (95) 00955-9 . PMID  7556643 . S2CID  42295269 .
• Tang D, Yeung J, Lee KY, et al. (1995). "Una isoforma del activador de quinasa 5 (Cdk5) dependiente de ciclina neuronal" . J. Biol. Chem . 270 (45): 26897–903. doi : 10.1074 / jbc.270.45.26897 . PMID  7592934 .
• Chae T, Kwon YT, Bronson R y col. (1997). "Los ratones que carecen de p35, un activador neuronal específico de Cdk5, muestran defectos de laminación cortical, convulsiones y letalidad en adultos" . Neurona . 18 (1): 29–42. doi : 10.1016 / S0896-6273 (01) 80044-1 . PMID  9010203 . S2CID  18685470 .
• Poon RY, Lew J, Hunter T (1997). "Identificación de dominios funcionales en la proteína activadora neuronal Cdk5" . J. Biol. Chem . 272 (9): 5703–8. doi : 10.1074 / jbc.272.9.5703 . PMID  9038181 .
• Fletcher AI, Shuang R, Giovannucci DR, et al. (1999). "Regulación de la exocitosis por quinasa 5 dependiente de ciclina vía fosforilación de Munc18" . J. Biol. Chem . 274 (7): 4027–35. doi : 10.1074 / jbc.274.7.4027 . PMID  9933594 .
• Patrick GN, Zukerberg L, Nikolic M, et al. (2000). "La conversión de p35 a p25 desregula la actividad de Cdk5 y promueve la neurodegeneración". Naturaleza . 402 (6762): 615–22. doi : 10.1038 / 45159 . PMID  10604467 . S2CID  4414281 .
• Ching YP, Qi Z, Wang JH (2000). "Clonación de tres nuevas proteínas de unión del activador neuronal Cdk5". Gene . 242 (1–2): 285–94. doi : 10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0 . PMID  10721722 .
• Kwon YT, Gupta A, Zhou Y, et al. (2000). "Regulación de la adhesión mediada por N-cadherina por la quinasa p35-Cdk5" . Curr. Biol . 10 (7): 363–72. doi : 10.1016 / S0960-9822 (00) 00411-5 . PMID  10753743 . S2CID  16438320 .
• Lee MS, Kwon YT, Li M y col. (2000). "La neurotoxicidad induce la escisión de p35 a p25 por calpaína". Naturaleza . 405 (6784): 360–4. doi : 10.1038 / 35012636 . PMID  10830966 . S2CID  205006589 .
• Wang X, Ching YP, Lam WH y col. (2000). "Identificación de una región de asociación de proteína común en el activador neuronal Cdk5" . J. Biol. Chem . 275 (41): 31763–9. doi : 10.1074 / jbc.M004358200 . PMID  10915792 .
• Floyd SR, Porro EB, Slepnev VI y col. (2001). "La anfifisina 1 se une a la subunidad reguladora p35 de la quinasa dependiente de ciclina (cdk) 5 y es fosforilada por cdk5 y cdc2" . J. Biol. Chem . 276 (11): 8104–10. doi : 10.1074 / jbc.M008932200 . PMID  11113134 .
• Kesavapany S, Lau KF, McLoughlin DM y col. (2001). "p35 / cdk5 se une y fosforila beta-catenina y regula la interacción beta-catenina / presenilina-1". EUR. J. Neurosci . 13 (2): 241–7. doi : 10.1046 / j.1460-9568.2001.01376.x . PMID  11168528 .
• Chen F, Studzinski GP (2001). "La expresión del activador de quinasa 5 dependiente de ciclina neuronal p35Nck5a en células monocíticas humanas está asociada con la diferenciación" . Sangre . 97 (12): 3763–7. doi : 10.1182 / sangre.V97.12.3763 . PMID  11389014 .
• Tarricone C, Dhavan R, Peng J y col. (2001). "Estructura y regulación del complejo CDK5-p25 (nck5a)" . Mol. Celular . 8 (3): 657–69. doi : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00343-4 . PMID  11583627 .
• Rashid T, Banerjee M, Nikolic M (2002). "La fosforilación de Pak1 por la quinasa p35 / Cdk5 afecta la morfología neuronal" . J. Biol. Chem . 276 (52): 49043–52. doi : 10.1074 / jbc.M105599200 . PMID  11604394 .
• Qu D, Li Q, Lim HY y col. (2002). "La proteína SET se une al activador neuronal de Cdk5 p35nck5a y modula la actividad de Cdk5 / p35nck5a" . J. Biol. Chem . 277 (9): 7324–32. doi : 10.1074 / jbc.M107270200 . PMID  11741927 .
• Patzke H, Tsai LH (2002). "Escisión mediada por calpaína del activador de quinasa-5 dependiente de ciclina p39 a p29" . J. Biol. Chem . 277 (10): 8054–60. doi : 10.1074 / jbc.M109645200 . PMID  11784720 .

enlaces externos

• Ubicación del genoma humano CDK5R1 y página de detalles del gen CDK5R1 en UCSC Genome Browser .