CEBPB

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CEBPB
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 1GTW , 1GU4 , 1GU5 , 1H88 , 1H89 , 1H8A , 1HJB , 1IO4 , 2E42 , 2E43
Identificadores
Alias	CEBPB , C / EBP-beta, IL6DBP, NF-IL6, TCF5, CCAAT / proteína de unión potenciadora beta, proteína de unión potenciadora CCAAT beta
Identificaciones externas	OMIM : 189965 MGI : 88373 HomoloGene : 3807 GeneCards : CEBPB
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 20 (humano) [1] Banda 20q13.13 Comienzo 50,190,830 pb [1] Fin 50.192.668 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 2 (ratón) [2] Banda 2 H3 | 2 87,58 cm Comienzo 167.688.915 pb [2] Fin 167.690.418 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • la unión al ADN • de unión a ADN específica de secuencia • de unión a ADN específica de secuencia de la ARN polimerasa II región reguladora • actividad homodimerización proteína • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 actividad del factor de transcripción de unión a ADN • GO: 0001077 , GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ADN vinculante actividad del activador de la transcripción, la ARN polimerasa II-específico • de unión al factor de transcripción • histona desacetilasa de unión • cromatina unión • GO: 0000980 ARN polimerasa II región reguladora en cis Unión de ADN específica de secuencia • Unión de quinasa • GO: proteína 0001948 unión • histona acetiltransferasa de unión • ubiquitina proteína ligasa de unión • heterodimerización actividad de la proteína • actividad del factor de transcripción, la ARN polimerasa II potenciador distal secuencia específica de unión • ARN polimerasa II promotor de unión de ADN de núcleo específico de secuencia • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Actividad represora de la transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II • Unión al receptor de glucocorticoides Componente celular • citoplasma • matriz nuclear • complejo CHOP-C / EBP • nucleoplasma • cromatina nuclear • núcleo celular • cromosoma condensado, región centromérica • complejo de factor de transcripción ARN polimerasa II Proceso biológico • regulación negativa del proceso apoptótico neuronal • proliferación de células epiteliales de la glándula mamaria • diferenciación celular • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II en respuesta al estrés del retículo endoplásmico • respuesta celular al compuesto cíclico orgánico • placenta embrionaria desarrollo • memoria • regulación positiva de la producción de interleucina-4 • respuesta al estrés del retículo endoplásmico • diferenciación de las células epiteliales de la glándula mamaria • transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • regulación negativa de la proliferación de células T • regulación de la transcripción implicada en el compromiso del destino celular • regeneración del hígado • regulación positiva de la diferenciación de osteoblastos • proliferación de hepatocitos • respuesta al lipopolisacárido • regulación de la diferenciación de osteoclastos • respuesta de defensa a la bacteria • respuesta de fase aguda • respuesta inmune • neurona diferenciación • respuesta celular a la interleucina-1 • diferenciación de las células de grasa marrón • respuesta celular a amino estímulo ácido • el desarrollo del folículo ovárico • el desarrollo del hígado • respuesta inflamatoria • regulación negativa de la transcripción, de plantilla de ADN • regulación positiva de la diferenciación de células de grasa • respuesta celular a lipopolisacárido • diferenciación de las células de grasa • regulación positiva de la transcripción de la ARN polimerasa II promotor • vía de señalización apoptótica intrínseca en respuesta al estrés del retículo endoplásmico • transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • formación de granulomas • activación de células T-helper 1 • regulación negativa de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación de la diferenciación de odontoblastos • regulación positiva del desarrollo de tejido biomineral • regulación positiva del transporte de fosfato dependiente de sodio • regulación positiva de la respuesta inflamatoria • regulación positiva de la termogénesis inducida por frío • regulación de la diferenciación de células dendríticas Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	1051	12608
Ensembl	ENSG00000172216	ENSMUSG00000056501
UniProt	P17676	P28033
RefSeq (ARNm)	NM_005194 NM_001285878 NM_001285879	NM_001287738 NM_001287739 NM_009883
RefSeq (proteína)	NP_001272807 NP_001272808 NP_005185	NP_001274667 NP_001274668 NP_034013
Ubicación (UCSC)	20: 50,19 - 50,19 Mb	Crónicas 2: 167,69 - 167,69 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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CCAAT / proteína beta de unión a potenciador es una proteína que en humanos está codificada por el gen CEBPB . ^{[5] [6]}

Función

La proteína codificada por este gen sin intrones es un factor de transcripción bZIP que puede unirse como homodímero a ciertas regiones reguladoras del ADN. También puede formar heterodímeros con las proteínas relacionadas CEBP-alfa , CEBP-delta y CEBP-gamma . La proteína codificada es importante en la regulación de genes implicados en las respuestas inmunes e inflamatorias y se ha demostrado que se une al elemento de respuesta de IL-1 en el gen de IL-6 , así como a regiones reguladoras de varios genes de fase aguda y de citocinas. . Además, la proteína codificada puede unirse al promotor y al elemento corriente arriba y estimular la expresión del gen del colágeno tipo I.^[7]

CEBP-beta es fundamental para el funcionamiento normal de los macrófagos , un importante subtipo de células inmunitarias ; Los ratones que no pueden expresar CEBP-beta tienen macrófagos que no pueden diferenciarse (especializarse) y, por lo tanto, no pueden realizar todas sus funciones biológicas, incluida la reparación muscular mediada por macrófagos. ^{[8] El} trabajo de observación ha demostrado que la expresión de CEBP-beta en los leucocitos sanguíneos se asocia positivamente con la fuerza muscular en humanos , ^[9] enfatizando la importancia del sistema inmunológico, y particularmente de los macrófagos, en el mantenimiento de la función muscular.

La función del gen CEBPB puede examinarse eficazmente mediante la eliminación del ARNip basándose en una validación independiente. ^[10]

Genes diana

CEBPB es capaz de aumentar la expresión de varios genes diana. Entre ellos, algunos tienen un papel específico en el sistema nervioso como el gen preprotachyquinin-1 , dando lugar a la sustancia P y neuroquinina A ^[11] y la colina acetiltransferasa responsable de la biosíntesis del importante neurotransmisor acetilcolina . ^[12] Otros objetivos incluyen genes que codifican citocinas como IL-6 , ^[13] IL-4 , ^[14] IL-5 , ^[15] y TNF-alfa . ^[dieciséis]También se ha descubierto que los genes que codifican proteínas transportadoras que confieren resistencia a múltiples fármacos a las células son activados por CEBPB. Estos genes incluyen ABCC2 ^[17] y ABCB1 . ^[18]

Interacciones

Se ha demostrado que CEBPB interactúa con:

• CREB1 , ^[19]
• CRSP3 ^[20]
• Transcripción inducible por daños en el ADN 3 , ^{[21] [22]}
• EP300 , ^[23]
• Receptor de estrógeno alfa , ^{[24] [25]}
• Receptor de glucocorticoides , ^[24]
• HMGA1 , ^[26]
• HSF1 , ^[27]
• Fosfoproteína nucleolar p130 , ^[28]
• RELA , ^{[29] [30]}
• Factor de respuesta sérica , ^{[31] [32]}
• SMARCA2 , ^[33]
• Factor de transcripción Sp1 , ^{[26] [34]}
• TRIM28 , ^{[35] [36]} y
• Zif268 . ^[37]

Ver también

• Proteínas de unión al potenciador de Ccaat

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000172216 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000056501 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Szpirer C, Riviere M, Cortese R, Nakamura T, Islam MQ, Levan G, Szpirer J (julio de 1992). "Localización cromosómica en el hombre y la rata de los genes que codifican los factores de transcripción C / EBP, DBP y HNF1 / LFB-1 enriquecidos en hígado (CEBP, DBP y factor de transcripción 1, TCF1, respectivamente) y del factor de crecimiento de hepatocitos / gen del factor de dispersión (HGF) ". Genómica . 13 (2): 293–300. doi : 10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-N . PMID 1535333 . 
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7. "Entrez Gen: CEBPB CCAAT / proteína de unión potenciadora (C / EBP), beta" .
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Enlaces externos

• Ubicación del genoma humano CEBPB y página de detalles del gen CEBPB en UCSC Genome Browser .
• CEBPB + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
• FactorBook CEBPB

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .