La subunidad A del factor de ensamblaje de cromatina 1 es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen CHAF1A . [4] [5]
CHAF1A | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | CHAF1A , CAF-1, CAF1, CAF1B, CAF1P150, P150, factor de ensamblaje de cromatina 1 subunidad A | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 601246 MGI : 1351331 HomoloGene : 4003 GeneCards : CHAF1A | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 19: 4,4 - 4,45 Mb | n / A | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [2] | [3] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
El factor de ensamblaje de cromatina I ( CAF-1 ) es un complejo nuclear que consta de subunidades p50, p60 ( CHAF1B ; MIM 601245) y p150 (CHAF1A) que ensambla tetrámeros de histona en ADN replicante in vitro (Kaufman et al., 1995). suministrado por OMIM] [5]
Interacciones
Se ha demostrado que CHAF1A interactúa con:
- ASF1A , [6]
- ASF1B , [6] [7]
- BLM , [8]
- CBX5 , [9] [10] y
- MBD1 . [9]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000167670 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Kaufman PD, Kobayashi R, Kessler N, Stillman B (agosto de 1995). "Las subunidades p150 y p60 del factor de ensamblaje de la cromatina I: un vínculo molecular entre las histonas recién sintetizadas y la replicación del ADN". Celular . 81 (7): 1105–14. doi : 10.1016 / S0092-8674 (05) 80015-7 . PMID 7600578 . S2CID 13502921 .
- ^ a b "Entrez Gene: factor de ensamblaje de cromatina CHAF1A 1, subunidad A (p150)" .
- ^ a b Mello JA, Silljé HH, Roche DM, Kirschner DB, Nigg EA, Almouzni G (abril de 2002). "Human Asf1 y CAF-1 interactúan y se sinergizan en una vía de ensamblaje de nucleosoma acoplado a reparación" . Rep . EMBO 3 (4): 329–34. doi : 10.1093 / embo-reports / kvf068 . PMC 1084056 . PMID 11897662 .
- ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humana por espectrometría de masas" . Mol. Syst. Biol . 3 : 89. doi : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
- ^ Jiao R, Bachrati CZ, Pedrazzi G, Kuster P, Petkovic M, Li JL, Egli D, Hickson ID, Stagljar I (junio de 2004). "Interacción física y funcional entre el producto del gen del síndrome de Bloom y la subunidad más grande del factor de ensamblaje de cromatina 1" . Mol. Célula. Biol . 24 (11): 4710–9. doi : 10.1128 / MCB.24.11.4710-4719.2004 . PMC 416397 . PMID 15143166 .
- ^ a b Reese BE, Bachman KE, Baylin SB, Rountree MR (mayo de 2003). "La proteína de unión metil-CpG MBD1 interactúa con la subunidad p150 del factor de ensamblaje de cromatina 1" . Mol. Célula. Biol . 23 (9): 3226–36. doi : 10.1128 / mcb.23.9.3226-3236.2003 . PMC 153189 . PMID 12697822 .
- ^ Lechner MS, Begg GE, Speicher DW, Rauscher FJ (septiembre de 2000). "Determinantes moleculares para dirigirse al silenciamiento génico mediado por la proteína 1 de heterocromatina: la interacción directa del correpresor del dominio de sombra de cromosomas-KAP-1 es esencial" . Mol. Célula. Biol . 20 (17): 6449–65. doi : 10.1128 / mcb.20.17.6449-6465.2000 . PMC 86120 . PMID 10938122 .
Otras lecturas
- Ridgway P, Almouzni G (2000). "CAF-1 y la herencia de los estados de cromatina: en la encrucijada de la replicación y reparación del ADN". J. Cell Sci . 113 (15): 2647–58. PMID 10893180 .
- Verreault A, Kaufman PD, Kobayashi R, Stillman B (1996). "Ensamblaje de nucleosomas por un complejo de CAF-1 e histonas acetiladas H3 / H4". Celular . 87 (1): 95–104. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81326-4 . PMID 8858152 . S2CID 1416453 .
- Marheineke K, Krude T (1998). "Actividad de ensamblaje de nucleosomas y localización intracelular de cambios de CAF-1 humano durante el ciclo de división celular" . J. Biol. Chem . 273 (24): 15279–86. doi : 10.1074 / jbc.273.24.15279 . PMID 9614144 .
- Shibahara K, Stillman B (1999). "El marcado dependiente de la replicación del ADN por PCNA facilita la herencia de cromatina acoplada a CAF-1". Celular . 96 (4): 575–85. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80661-3 . PMID 10052459 . S2CID 13912324 .
- Murzina N, Verreault A, Laue E, Stillman B (1999). "Dinámica de heterocromatina en células de ratón: interacción entre el factor de ensamblaje de cromatina 1 y proteínas HP1". Mol. Celular . 4 (4): 529–40. doi : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80204-X . PMID 10549285 .
- Moggs JG, Grandi P, Quivy JP, Jónsson ZO, Hübscher U, Becker PB, Almouzni G (2000). "Una ruta de ensamblaje de cromatina mediada por CAF-1-PCNA desencadenada por la detección de daños en el ADN" . Mol. Célula. Biol . 20 (4): 1206–18. doi : 10.1128 / MCB.20.4.1206-1218.2000 . PMC 85246 . PMID 10648606 .
- Lechner MS, Begg GE, Speicher DW, Rauscher FJ (2000). "Determinantes moleculares para apuntar al silenciamiento génico mediado por la proteína 1 de heterocromatina: la interacción directa del corepressor KAP-1 del dominio Chromoshadow es esencial" . Mol. Célula. Biol . 20 (17): 6449–65. doi : 10.1128 / MCB.20.17.6449-6465.2000 . PMC 86120 . PMID 10938122 .
- Dong H, Lin W, Zhang CK, Xiong H, Fu G, Jin WR, Chen R, Chen Z, Qi ZT, Huang GM (2001). "Análisis de expresión y secuencia genómica del gen p150 del factor de ensamblaje de cromatina humana 1". Gene . 264 (2): 187–96. doi : 10.1016 / S0378-1119 (01) 00335-3 . PMID 11250073 .
- Mello JA, Silljé HH, Roche DM, Kirschner DB, Nigg EA, Almouzni G (2002). "Human Asf1 y CAF-1 interactúan y se sinergizan en una vía de ensamblaje de nucleosoma acoplado a reparación" . Rep . EMBO 3 (4): 329–34. doi : 10.1093 / embo-reports / kvf068 . PMC 1084056 . PMID 11897662 .
- Reese BE, Bachman KE, Baylin SB, Rountree MR (2003). "La proteína de unión metil-CpG MBD1 interactúa con la subunidad p150 del factor de ensamblaje de cromatina 1" . Mol. Célula. Biol . 23 (9): 3226–36. doi : 10.1128 / MCB.23.9.3226-3236.2003 . PMC 153189 . PMID 12697822 .
- Morel AP, Sentis S, Bianchin C, Le Romancer M, Jonard L, Rostan MC, Rimokh R, Corbo L (2004). "La proteína antiproliferativa BTG2 interactúa con el complejo CCR4 humano existente in vivo en tres formas reguladas por el ciclo celular" . J. Cell Sci . 116 (Pt 14): 2929–36. doi : 10.1242 / jcs.00480 . PMID 12771185 .
- Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagawa T, Ito T, Ishimi Y, Nagasawa H, Matsumoto T, Yanagisawa J, Kato S (2003). "El complejo de remodelación de cromatina WINAC dirige un receptor nuclear a los promotores y está alterado en el síndrome de Williams" . Celular . 113 (7): 905-17. doi : 10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7 . PMID 12837248 .
- Glinsky GV, Glinskii AB, Stephenson AJ, Hoffman RM, Gerald WL (2004). "El perfil de expresión génica predice el resultado clínico del cáncer de próstata" . J. Clin. Invertir . 113 (6): 913–23. doi : 10.1172 / JCI20032 . PMC 362118 . PMID 15067324 .
- Jiao R, Bachrati CZ, Pedrazzi G, Kuster P, Petkovic M, Li JL, Egli D, Hickson ID, Stagljar I (2004). "Interacción física y funcional entre el producto génico del síndrome de Bloom y la subunidad más grande del factor de ensamblaje de cromatina 1" . Mol. Célula. Biol . 24 (11): 4710–9. doi : 10.1128 / MCB.24.11.4710-4719.2004 . PMC 416397 . PMID 15143166 .
- Lehner B, Sanderson CM (2004). "Un marco de interacción de proteínas para la degradación del ARNm humano" . Genome Res . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101 / gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). "Caracterización a gran escala de fosfoproteínas nucleares de células HeLa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. doi : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
- Sarraf SA, Stancheva I (2004). "La proteína de unión de metil-CpG MBD1 acopla la metilación de la histona H3 en la lisina 9 por SETDB1 para la replicación del ADN y el ensamblaje de la cromatina" . Mol. Celular . 15 (4): 595–605. doi : 10.1016 / j.molcel.2004.06.043 . PMID 15327775 .
enlaces externos
- Ubicación del gen humano CHAF1A en UCSC Genome Browser .
- Detalles del gen humano CHAF1A en UCSC Genome Browser .