La proteína tipo 2 asociada a la contactina es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen CNTNAP2 . [5] [6] [7] Dado que el genoma humano de referencia más reciente GRCh38, CNTNAP2 es el gen más largo del genoma humano [8]
CNTNAP2 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | CNTNAP2 , AUTS15, CASPR2, CDFE, NRXN4, PTHSL1, proteína de tipo 2 asociada a contactina, proteína 2 asociada a contactina, proteína 2 asociada a contactina | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 604569 MGI : 1914047 HomoloGene : 69159 GeneCards : CNTNAP2 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (proteína) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ubicación (UCSC) | Crónicas 7: 146,12 - 148,42 Mb | Crónicas 6: 45,06 - 47,3 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Este gen codifica un miembro de la familia de las neurexinas que funciona en el sistema nervioso de los vertebrados como moléculas de adhesión celular y receptores. Esta proteína, al igual que otras proteínas de neurexina, contiene repeticiones del factor de crecimiento epidérmico y dominios de laminina G. Además, incluye un dominio de tipo C F5 / 8, dominios de tipo discoidina / neuropilina y fibrinógeno, dominios de tipo N-terminal de trombospondina y un sitio de unión de PDZ putativo. Esta proteína se localiza en los yuxtaparanodes de los axones mielinizados y se asocia con los canales de potasio . Puede desempeñar un papel en la diferenciación local del axón en distintos subdominios funcionales. Este gen abarca casi el 1,6% del cromosoma 7 y es uno de los genes más grandes del genoma humano . [9] Puede representar un gen candidato posicional para la forma DFNB13 de sordera no sindrómica. [7]
Significación clínica
CNTNAP2 se ha asociado con el trastorno del espectro autista, pero representa muy pocos casos. [10] [11] [12] CNTNAP2 también puede estar relacionado con un trastorno llamado deterioro específico del lenguaje . [13]
Las mutaciones recesivas en CNTNAP2 dan como resultado un trastorno que se asemeja al síndrome de Pitt-Hopkins . [14] [15]
Interacciones
Se ha demostrado que CNTNAP2 interactúa con CNTN2 . [dieciséis]
Referencias
- ^ a b c ENSG00000278728 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000174469, ENSG00000278728 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039419 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Poliak S, Gollan L, Martinez R, Custer A, Einheber S, Salzer JL, Trimmer JS, Shrager P, Peles E (diciembre de 1999). "Caspr2, un nuevo miembro de la superfamilia de neurexinas, se localiza en los yuxtaparanodes de axones mielinizados y se asocia con canales de K +". Neurona . 24 (4): 1037–47. doi : 10.1016 / S0896-6273 (00) 81049-1 . PMID 10624965 . S2CID 12444497 .
- ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (diciembre de 1998). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XII. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro" . Investigación de ADN . 5 (6): 355–64. doi : 10.1093 / dnares / 5.6.355 . PMID 10048485 .
- ^ a b "Entrez Gene: CNTNAP2 asociado a la proteína 2 similar a la contactina" .
- ^ Ashley, Euan A. (16 de agosto de 2016). "Hacia la medicina de precisión". Nature Reviews Genética . 17 (9): 507–522. doi : 10.1038 / nrg.2016.86 . PMID 27528417 . S2CID 2609065 .
- ^ Helmrich A, Ballarino M, Tora L (diciembre de 2011). "Las colisiones entre los complejos de replicación y transcripción provocan una inestabilidad común del sitio frágil en los genes humanos más largos" (PDF) . Célula molecular . 44 (6): 966–77. doi : 10.1016 / j.molcel.2011.10.013 . PMID 22195969 .
- ^ Alarcón M, Abrahams BS, Stone JL, Duvall JA, Perederiy JV, Bomar JM, Sebat J, Wigler M, Martin CL, Ledbetter DH, Nelson SF, Cantor RM, Geschwind DH (enero de 2008). "Los análisis de vinculación, asociación y expresión génica identifican CNTNAP2 como un gen de susceptibilidad al autismo" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 82 (1): 150–9. doi : 10.1016 / j.ajhg.2007.09.005 . PMC 2253955 . PMID 18179893 . Archivado desde el original el 16 de enero de 2008. Resumen de laicos - UCLA Newsroom (2008-01-10).
- ^ Arking DE, Cutler DJ, Brune CW, Teslovich TM, West K, Ikeda M, Rea A, Guy M, Lin S, Cook EH, Chakravarti A (enero de 2008). "Una variante genética común en el miembro de la superfamilia de neurexina CNTNAP2 aumenta el riesgo familiar de autismo" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 82 (1): 160–4. doi : 10.1016 / j.ajhg.2007.09.015 . PMC 2253968 . PMID 18179894 . Archivado desde el original el 16 de enero de 2008. Resumen de laicos - Johns Hopkins Medicine (2008-01-22).
- ^ Bakkaloglu B, O'Roak BJ, Louvi A, Gupta AR, Abelson JF, Morgan TM, Chawarska K, Klin A, Ercan-Sencicek AG, Stillman AA, Tanriover G, Abrahams BS, Duvall JA, Robbins EM, Geschwind DH, Biederer T, Gunel M, Lifton RP, State MW (enero de 2008). "Análisis citogenético molecular y resecuenciación de la proteína 2 asociada a la contactina en los trastornos del espectro autista" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 82 (1): 165–73. doi : 10.1016 / j.ajhg.2007.09.017 . PMC 2253974 . PMID 18179895 . Archivado desde el original el 16 de enero de 2008.
- ^ Vernes SC, Newbury DF, Abrahams BS, Winchester L, Nicod J, Groszer M, Alarcón M, Oliver PL, Davies KE, Geschwind DH, Monaco AP, Fisher SE (noviembre de 2008). "Un vínculo genético funcional entre distintos trastornos del desarrollo del lenguaje" . La Revista de Medicina de Nueva Inglaterra . 359 (22): 2337–45. doi : 10.1056 / NEJMoa0802828 . PMC 2756409 . PMID 18987363 .
- ^ Peippo M, Ignatius J (abril de 2012). "Síndrome de Pitt-Hopkins" . Sindromología molecular . 2 (3-5): 171-180. doi : 10.1159 / 000335287 . PMC 3366706 . PMID 22670138 .
- ^ Zweier C, de Jong EK, Zweier M, Orrico A, Ousager LB, Collins AL, et al. (Noviembre de 2009). "CNTNAP2 y NRXN1 están mutados en un retraso mental autosómico recesivo similar a Pitt-Hopkins y determinan el nivel de una proteína sináptica común en Drosophila" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 85 (5): 655–66. doi : 10.1016 / j.ajhg.2009.10.004 . PMC 2775834 . PMID 19896112 .
- ^ Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A, Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (septiembre de 2003). "La asociación de TAG-1 con Caspr2 es fundamental para la organización molecular de regiones yuxtaparanodales de fibras mielinizadas" . The Journal of Cell Biology . 162 (6): 1161–72. doi : 10.1083 / jcb.200305078 . PMC 2172849 . PMID 12975355 .
enlaces externos
- Ubicación del genoma humano CNTNAP2 y página de detalles del gen CNTNAP2 en UCSC Genome Browser .
- Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q9UHC6 (proteína de tipo 2 asociada a Contactin) en PDBe-KB .
Otras lecturas
- Nakabayashi K, Scherer SW (abril de 2001). "El gen 2 de tipo proteína asociado a la contactina humana (CNTNAP2) abarca más de 2 Mb de ADN en el cromosoma 7q35". Genómica . 73 (1): 108-12. doi : 10.1006 / geno.2001.6517 . PMID 11352571 . S2CID 16120451 .
- Spiegel I, Salomon D, Erne B, Schaeren-Wiemers N, Peles E (junio de 2002). "Caspr3 y caspr4, dos nuevos miembros de la familia caspr se expresan en el sistema nervioso e interactúan con dominios PDZ". Neurociencias moleculares y celulares . 20 (2): 283–97. doi : 10.1006 / mcne.2002.1110 . PMID 12093160 . S2CID 25024421 .
- Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (noviembre de 2002). "Interacciones proteína-proteína entre proteínas grandes: cribado de dos híbridos utilizando una biblioteca clasificada funcionalmente compuesta de ADNc largos" . Investigación del genoma . 12 (11): 1773–84. doi : 10.1101 / gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .
- Denisenko-Nehrbass N, Oguievetskaia K, Goutebroze L, Galvez T, Yamakawa H, Ohara O, Carnaud M, Girault JA (enero de 2003). "La proteína 4.1B se asocia con Caspr / paranodin y Caspr2 en paranodes y yuxtaparanodes de fibras mielinizadas". La Revista Europea de Neurociencia . 17 (2): 411–6. doi : 10.1046 / j.1460-9568.2003.02441.x . PMID 12542678 . S2CID 21570541 .
- Verkerk AJ, Mathews CA, Joosse M, Eussen BH, Heutink P, Oostra BA (julio de 2003). "CNTNAP2 se rompe en una familia con síndrome de Gilles de la Tourette y trastorno obsesivo compulsivo". Genómica . 82 (1): 1–9. doi : 10.1016 / S0888-7543 (03) 00097-1 . PMID 12809671 .
- Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A, Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (septiembre de 2003). "La asociación de TAG-1 con Caspr2 es fundamental para la organización molecular de regiones yuxtaparanodales de fibras mielinizadas" . The Journal of Cell Biology . 162 (6): 1161–72. doi : 10.1083 / jcb.200305078 . PMC 2172849 . PMID 12975355 .
- Fu GK, Wang JT, Yang J, Au-Young J, Stuve LL (julio de 2004). "Circular rápida amplificación de cDNA termina para clonación de extensión de alto rendimiento de genes parciales". Genómica . 84 (1): 205–10. doi : 10.1016 / j.ygeno.2004.01.011 . PMID 15203218 .
- Strauss KA, Puffenberger EG, Huentelman MJ, Gottlieb S, Dobrin SE, Parod JM, Stephan DA, Morton DH (marzo de 2006). "Epilepsia focal sintomática recesiva y proteína similar a 2 asociada a contactina mutante". La Revista de Medicina de Nueva Inglaterra . 354 (13): 1370–7. doi : 10.1056 / NEJMoa052773 . PMID 16571880 .
- Belloso JM, Bache I, Guitart M, Caballin MR, Halgren C, Kirchhoff M, Ropers HH, Tommerup N, Tümer Z (junio de 2007). "Alteración del gen CNTNAP2 en una familia de translocación (7; 15) sin síntomas del síndrome de Gilles de la Tourette" . Revista europea de genética humana . 15 (6): 711–3. doi : 10.1038 / sj.ejhg.5201824 . PMID 17392702 .