árbol filogenético


Un árbol filogenético (también filogenia o árbol evolutivo [3] ) es un diagrama de ramificación o un árbol que muestra las relaciones evolutivas entre varias especies biológicas u otras entidades basadas en similitudes y diferencias en sus características físicas o genéticas. Toda la vida en la Tierra es parte de un solo árbol filogenético, lo que indica una ascendencia común .

En un árbol filogenético enraizado , cada nodo con descendientes representa el ancestro común más reciente inferido de esos descendientes, [ cita requerida ] y las longitudes de los bordes en algunos árboles pueden interpretarse como estimaciones de tiempo. Cada nodo se denomina unidad taxonómica. Los nodos internos generalmente se denominan unidades taxonómicas hipotéticas, ya que no se pueden observar directamente. Los árboles son útiles en campos de la biología como la bioinformática , la sistemática y la filogenética . Los árboles sin raíz ilustran solo la relación de los nodos de hoja y no requieren que la raíz ancestral sea conocida o inferida.

La idea de un " árbol de la vida " surgió de las nociones antiguas de una progresión en forma de escalera desde formas de vida inferiores a superiores (como en la Gran Cadena del Ser ). Las primeras representaciones de árboles filogenéticos "ramificados" incluyen un "gráfico paleontológico" que muestra las relaciones geológicas entre plantas y animales en el libro Geología elemental , de Edward Hitchcock (primera edición: 1840).

Charles Darwin (1859) también produjo una de las primeras ilustraciones y popularizó de manera crucial la noción de un "árbol" evolutivo en su libro seminal El origen de las especies . Más de un siglo después, los biólogos evolutivos todavía usan diagramas de árbol para representar la evolución porque dichos diagramas transmiten efectivamente el concepto de que la especiación ocurre a través de la división adaptativa y semialeatoria de linajes. Con el tiempo, la clasificación de especies se ha vuelto menos estática y más dinámica.

El término filogenético , o filogenia , deriva de las dos palabras griegas antiguas φῦλον ( phûlon ), que significa "raza, linaje", y γένεσις ( génesis ), que significa "origen, fuente". [4] [5]

Un árbol filogenético enraizado (ver dos gráficos en la parte superior) es un árbol dirigido con un nodo único, la raíz, correspondiente al ancestro común más reciente (generalmente imputado ) de todas las entidades en las hojas del árbol. El nodo raíz no tiene un nodo principal, pero actúa como el principal de todos los demás nodos del árbol. Por lo tanto, la raíz es un nodo de grado 2, mientras que otros nodos internos tienen un grado mínimo de 3 (donde "grado" aquí se refiere al número total de aristas entrantes y salientes).


BacteriaArchaeaEukaryotaAquifexThermotogaBacteroides–CytophagaPlanctomyces"Cyanobacteria"ProteobacteriaSpirochetesGram-positivesChloroflexiThermoproteus–PyrodictiumThermococcus celerMethanococcusMethanobacteriumMethanosarcinaHaloarchaeaEntamoebaeSlime moldsAnimalsFungiPlantsCiliatesFlagellatesTrichomonadsMicrosporidiaDiplomonads
Un árbol filogenético basado en genes de ARNr , [ cita requerida ] que muestra los tres dominios de la vida : bacterias , arqueas y eucariotas . La rama negra en la parte inferior del árbol filogenético conecta las tres ramas de los organismos vivos con el último ancestro común universal . En ausencia de un grupo externo, la raíz es especulativa.
Un árbol de la vida altamente resuelto y generado automáticamente , basado en genomas completamente secuenciados. [1] [2]
Árbol filogenético enraizado optimizado para personas ciegas. El punto más bajo del árbol es la raíz, que simboliza el ancestro común universal a todos los seres vivos. El árbol se ramifica en tres grupos principales: bacterias (rama izquierda, letras de la a a la i), arqueas (rama del medio, letras de la j a la p) y eucariotas (rama derecha, letras de la q a la z). Cada letra corresponde a un grupo de organismos, enumerados debajo de esta descripción. Estas letras y la descripción deben convertirse a fuente Braille e imprimirse con una impresora Braille. La figura se puede imprimir en 3D copiando el archivo png y usando Cura u otro software para generar el Gcode para la impresión en 3D.
Un árbol filogenético sin raíz para la miosina , una superfamilia de proteínas . [6]
Aumento del número total de árboles filogenéticos en función del número de hojas etiquetadas: árboles binarios sin raíz (rombos azules), árboles binarios con raíz (círculos rojos) y árboles multifurcantes o binarios con raíz (verde: triángulos). La escala del eje Y es logarítmica .
Dendrograma de la filogenia de algunas razas caninas
Un cronograma de lepidópteros . [13] En este tipo de árbol filogenético, las longitudes de las ramas son proporcionales al tiempo geológico.
Un diagrama de huso, que muestra la evolución de los vertebrados a nivel de clase, el ancho de los husos indica el número de familias. Los diagramas de huso se utilizan a menudo en la taxonomía evolutiva .
el coral de la vida