En biología molecular , un elemento promotor aguas abajo (DPE) es un elemento promotor central . Como todos los promotores centrales, el DPE juega un papel importante en el inicio de la transcripción génica por la ARN polimerasa II . El DPE fue descrito por primera vez por TW Burke y James T. Kadonaga en Drosophila melanogaster en la Universidad de California, San Diego en 1996. [2] También está presente en otras especies, incluidos los humanos, pero no en Saccharomyces cerevisiae . [3]
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Junto con el motivo iniciador (Inr), otro elemento promotor central, el DPE es reconocido por las subunidades TAF6 y TAF9 del factor de transcripción II D (TFIID) . [2] [4] [5] Se ha demostrado que la transcripción basal dependiente de DPE depende en gran medida del Inr (y viceversa) y del espaciado correcto entre los dos elementos. [2] [4] [6]
Originalmente se pensó que la secuencia de consenso DPE era RGWCGTG, [2] sin embargo, estudios más recientes han sugerido que es la secuencia RGWYV (T) similar pero más general. [a] [1] [3] [7] Se encuentra a unos 28-33 nucleótidos corriente abajo del sitio de inicio de la transcripción . [3]
Ocurrencia
Se ha demostrado que el DPE es tan utilizado como la caja TATA en D. melanogaster . [6] Si bien se encontró un DPE en muchos promotores que no contienen una caja TATA, también hay promotores que contienen tanto una caja TATA como un DPE. [6]
Los promotores de casi todos los genes Hox de D. melanogaster , con la excepción de los genes evolutivamente más recientes, Ubx y Abd-A , contienen un motivo DPE y carecen de una caja TATA. [8] Los promotores de Drosophila que contienen la secuencia DPE incluyen Abd-B , Antp P2 , bride of sevenless , brown , caudal , E74 , E75 , engrailed , Gsα , labial , nmMHC , ras2 , chamuscado , estrellado y blanco . [2] En organismos distintos de D. melanogaster , se ha descubierto que el promotor del gen IRF1 humano y de ratón contiene una secuencia consenso de DPE a la distancia adecuada del sitio de inicio de la transcripción. Este promotor tampoco contiene una caja TATA.
También se ha informado que el DPE desempeña un papel en la primitiva Eukaryote Entamoeba histolytica . [9]
Notas
- ^ En la notación de ácido nucleico para ADN, R (pu R ine) representa A / G ( adenina o guanina , que son los dos purinas ); W ( W EAK) representa A / T (adenina o timina , que tanto en la forma sólo dos enlaces de hidrógeno ); Y (p Y rimidina) significa C / T ( citosina o timina, que son ambas pirimidinas ); y V significa A / C / G.
Referencias
- ^ a b Mayordomo, Jennifer EF; Kadonaga, James T (15 de octubre de 2002). "El promotor del núcleo de la ARN polimerasa II: un componente clave en la regulación de la expresión génica" . Genes y desarrollo . 16 (20): 2583-2592. doi : 10.1101 / gad.1026202 . PMID 12381658 .
- ^ a b c d e Burke, TW; Kadonaga, JT (15 de marzo de 1996). "Drosophila TFIID se une a un elemento promotor basal aguas abajo conservado que está presente en muchos promotores deficientes en la caja TATA" . Genes y desarrollo . 10 (6): 711–724. doi : 10.1101 / gad.10.6.711 . PMID 8598298 .
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