TAF9 ARN polimerasa II, factor asociado a la proteína de unión a caja TATA (TBP), 32 kDa , también conocida como TAF9 , es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen TAF9 . [4] [5]
TAF9 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | TAF9 , MGC: 5067, STAF31 / 32, TAF2G, TAFII-31, TAFII-32, TAFII31, TAFII32, TAFIID32, factor 9 asociado a la proteína de unión a la caja TATA | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 600822 MGI : 1888697 HomoloGene : 39986 GeneCards : TAF9 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 5: 69,36 - 69,37 Mb | n / A | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [2] | [3] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
El inicio de la transcripción por la ARN polimerasa II requiere las actividades de más de 70 polipéptidos. El complejo proteico que coordina estas actividades es el factor de transcripción IID ( TFIID ), que se une al promotor central para posicionar la polimerasa correctamente, sirve como andamio para el ensamblaje del resto del complejo de transcripción y actúa como un canal para las señales reguladoras. TFIID está compuesto por la proteína de unión a TATA ( TBP ) y un grupo de proteínas conservadas evolutivamente conocidas como factores asociados a TBP o TAF. Los TAF pueden participar en la transcripción basal, servir como coactivadores, funcionar en el reconocimiento de promotores o modificar los factores de transcripción generales (GTF) para facilitar el ensamblaje complejo y el inicio de la transcripción. Este gen codifica una de las subunidades más pequeñas de TFIID que se une al factor de transcripción basal GTF2B , así como a varios activadores de la transcripción como p53 y VP16 . Se ha encontrado un gen similar pero distinto ( TAF9B ) en el cromosoma X y se ha identificado un pseudogén en el cromosoma 19 . El empalme alternativo da como resultado múltiples variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas. [4]
Estructura
Se informó que los dominios de activación en trans (TAD) de 17 aminoácidos de varios factores de transcripción se unen directamente a TAF9: p53, VP16, HSF1 , NF-IL6 , NFAT1 , NF-κB y ALL1 / MLL1. [6] Dentro de estos 17 aminoácidos, se identificó un dominio de transactivación único de nueve aminoácidos (9aaTAD) para cada factor de transcripción informado. [7] 9aaTAD es un nuevo dominio común a una gran superfamilia de factores de transcripción eucariotas representados por Gal4 , Oaf1, Leu3, Rtg3, Pho4 , Gln4, Gcn4 en levadura y por p53, NFAT, NF-κB y VP16 en mamíferos. [8] Se supone que TAF9 es un cofactor de transactivación universal para los factores de transcripción 9aaTAD. [7]
Interacciones
Se ha demostrado que TAF9 interactúa con:
- GCN5L2 , [9]
- Myc , [10]
- SF3B3 , [9]
- SUPT7L , [9]
- TADA3L , [9]
- TAF5 , [9] [11]
- TAF6L , [9]
- TAF10 , [9]
- TAF12 , [9]
- TAF5L , [9]
- Proteína de unión a TATA , [9] [12]
- Homólogo de la proteína de iniciación de la transcripción SPT3 , [9] y
- Proteína asociada al dominio de transformación / transcripción . [9]
Referencias
- ^ a b c ENSG00000276463 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000273841, ENSG00000276463 - Ensembl , mayo de 2017
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Otras lecturas
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