• la unión al ADN • unión específica de proteínas de dominio • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA-binding factor de transcripción actividad • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Actividad activadora de la transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II • Unión del factor de transcripción • GO: 0000980 Unión de ADN específica de la secuencia de la región reguladora cis de la ARN polimerasa II • GO: 0001948 Unión de proteínas • Unión de cromatina específica del promotor • Actividad de dimerización de proteínas • GO : 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específico de la ARN polimerasa II • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Actividad represora de la transcripción de unión al ADN, ARN polimerasa II específica • Unión al ADN específica de la secuencia
Componente celular
• complejo regulador de la transcripción • nucleoplasma • cromatina nuclear • núcleo de la célula • complejo ARN polimerasa II factor de transcripción
Proceso biológico
• Regulación del tamaño celular • Desarrollo de células epiteliales • Homeostasis del volumen celular • Regulación de la transcripción, plantilla de ADN • Diferenciación de células epiteliales multiciliadas • Transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • Regulación de la transcripción involucrada en la transición G1 / S del ciclo celular mitótico • circulación sanguínea • organización de proyección celular • regulación de la proliferación celular • morfogénesis de órganos animales • ciclo celular • ensamblaje de cilio móvil • ensamblaje de centriolo • transcripción, plantilla de ADN • GO: 0007067 ciclo celular mitótico • Respuesta al daño del ADN, transducción de señales por el mediador de la clase p53 que da como resultado la detención del ciclo celular • Regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • Morfogénesis del cilio • Regulación negativa de la transcripción de la ARN polimerasa II promotor • regulación del ciclo celular
Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies
Humano
Ratón
Entrez
1874
104394
Ensembl
ENSG00000205250
ENSMUSG00000014859
UniProt
Q16254
Q8R0K9
RefSeq (ARNm)
NM_001950
NM_148952
RefSeq (proteína)
NP_001941
NP_683754
Ubicación (UCSC)
Crónicas 16: 67,19 - 67,2 Mb
Crónicas 8: 105,3 - 105,31 Mb
Búsqueda en PubMed
[3]
[4]
Wikidata
Ver / editar humano
Ver / Editar mouse
El factor de transcripción E2F4 es una proteína que en humanos está codificada por el gen E2F4 . [5] [6]
Contenido
1 función
2 Estructura
3 Interacciones
4 Ver también
5 referencias
6 Lecturas adicionales
7 Enlaces externos
Función [ editar ]
La proteína codificada por este gen es miembro de la familia de factores de transcripción E2F . La familia E2F juega un papel crucial en el control del ciclo celular y la acción de las proteínas supresoras de tumores y también es un objetivo de las proteínas transformadoras de los virus tumorales de ADN pequeño. Esta proteína se une a las tres proteínas supresoras de tumores pRB, p107 y p130, pero con mayor afinidad por las dos últimas. Desempeña un papel importante en la supresión de genes asociados a la proliferación, y su mutación genética y su expresión aumentada pueden estar asociadas con el cáncer humano. [7]
Estructura [ editar ]
Las proteínas E2F contienen varios dominios conservados evolutivamente que se encuentran en la mayoría de los miembros de la familia. Estos dominios incluyen un dominio de unión al ADN , un dominio de dimerización que determina la interacción con las proteínas del factor de transcripción regulado por diferenciación (DP), un dominio de transactivación enriquecido en aminoácidos ácidos ( Asp + Glu ) y un dominio de asociación de proteínas supresoras de tumores que está incrustado dentro el dominio de transactivación.
Interacciones [ editar ]
Se ha demostrado que E2F4 interactúa con Smad3 . [8]
Ver también [ editar ]
E2F
Referencias [ editar ]
^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000205250 - Ensembl , mayo de 2017
^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000014859 - Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Ginsberg D, Vairo G, Chittenden T, Xiao ZX, Xu G, Wydner KL, DeCaprio JA, Lawrence JB, Livingston DM (diciembre de 1994). "E2F-4, un nuevo miembro de la familia de factores de transcripción E2F, interactúa con p107" . Genes Dev . 8 (22): 2665–79. doi : 10.1101 / gad.8.22.2665 . PMID 7958924 .
^ Sardet C, Vidal M, Cobrinik D, Geng Y, Onufryk C, Chen A, Weinberg RA (abril de 1995). "E2F-4 y E2F-5, dos miembros de la familia E2F, se expresan en las primeras fases del ciclo celular" . Proc Natl Acad Sci USA . 92 (6): 2403–7. Código Bibliográfico : 1995PNAS ... 92.2403S . doi : 10.1073 / pnas.92.6.2403 . PMC 42492 . PMID 7892279 .
^ "Gen Entrez: factor de transcripción E2F4 E2F 4, unión de p107 / p130" .
^ Chen CR, Kang Y, Siegel PM, Massagué J (julio de 2002). "E2F4 / 5 y p107 como cofactores Smad que unen el receptor de TGFbeta a la represión de c-myc". Celular . 110 (1): 19–32. doi : 10.1016 / S0092-8674 (02) 00801-2 . PMID 12150994 . S2CID 8945574 .
Lectura adicional [ editar ]
Bandyopadhyay D, Timchenko N, Suwa T, et al. (2001). "El melanocito humano: un sistema modelo para estudiar la complejidad del envejecimiento celular y la transformación en células no fibroblásticas". Exp. Gerontol . 36 (8): 1265–75. doi : 10.1016 / S0531-5565 (01) 00098-5 . PMID 11602203 . S2CID 26041753 .
Beijersbergen RL, Kerkhoven RM, Zhu L y col. (1994). "E2F-4, un nuevo miembro de la familia de genes E2F, tiene actividad oncogénica y se asocia con p107 in vivo" . Genes Dev . 8 (22): 2680–90. doi : 10.1101 / gad.8.22.2680 . PMID 7958925 .
Xiao ZX, Ginsberg D, Ewen M, Livingston DM (1996). "Regulación de la proteína relacionada con la proteína del retinoblastoma p107 por quinasas asociadas a ciclina G1" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (10): 4633–7. Código Bibliográfico : 1996PNAS ... 93.4633X . doi : 10.1073 / pnas.93.10.4633 . PMC 39330 . PMID 8643455 .
Moberg K, Starz MA, Lees JA (1996). "E2F-4 cambia de p130 a p107 y pRB en respuesta a la reentrada del ciclo celular" . Mol. Celda. Biol . 16 (4): 1436–49. doi : 10.1128 / mcb.16.4.1436 . PMC 231128 . PMID 8657117 .
Vidal M, Brachmann RK, Fattaey A, et al. (1996). "Sistemas de dos híbridos y uno híbrido inverso para detectar la disociación de interacciones proteína-proteína y ADN-proteína" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (19): 10315-20. Código Bib : 1996PNAS ... 9310315V . doi : 10.1073 / pnas.93.19.10315 . PMC 38381 . PMID 8816797 .
Williams CD, Linch DC, Sørensen TS, et al. (1997). "El complejo E2F predominante en células hematopoyéticas primarias humanas y en blastos de AML contiene E2F-4, DP-1 y p130" . Br. J. Haematol . 96 (4): 688–96. doi : 10.1046 / j.1365-2141.1997.d01-2086.x . PMID 9074408 . S2CID 23265759 .
Lindeman GJ, Gaubatz S, Livingston DM, Ginsberg D (1997). "La localización subcelular de E2F-4 depende del ciclo celular" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (10): 5095–100. Código Bibliográfico : 1997PNAS ... 94.5095L . doi : 10.1073 / pnas.94.10.5095 . PMC 24637 . PMID 9144196 .
Wang H, Shao N, Ding QM y col. (1997). "Las proteínas BRCA1 se transportan al núcleo en ausencia de suero y variantes de empalme BRCA1a, BRCA1b son tirosina fosfoproteínas que se asocian con E2F, ciclinas y quinasas dependientes de ciclina" . Oncogén . 15 (2): 143–57. doi : 10.1038 / sj.onc.1201252 . PMID 9244350 .
Müller H, Moroni MC, Vigo E, et al. (1997). "La inducción de la entrada de la fase S por factores de transcripción E2F depende de su localización nuclear" . Mol. Celda. Biol . 17 (9): 5508-20. doi : 10.1128 / mcb.17.9.5508 . PMC 232399 . PMID 9271426 .
Pierce AM, Schneider-Broussard R, Philhower JL, Johnson DG (1998). "Actividades diferenciales de los miembros de la familia E2F: funciones únicas en la regulación de la transcripción". Mol. Carcinog . 22 (3): 190–8. doi : 10.1002 / (SICI) 1098-2744 (199807) 22: 3 <190 :: AID-MC7> 3.0.CO; 2-P . PMID 9688145 .
Ferreira R, Magnaghi-Jaulin L, Robin P, et al. (1998). "Los tres miembros de la familia de las proteínas de bolsillo comparten la capacidad de reprimir la actividad de E2F mediante el reclutamiento de una histona desacetilasa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (18): 10493–8. Código Bibliográfico : 1998PNAS ... 9510493F . doi : 10.1073 / pnas.95.18.10493 . PMC 27922 . PMID 9724731 .
Timchenko NA, Wilde M, Darlington GJ (1999). "C / EBPalpha regula la formación de complejos E2F-p107 específicos de fase S en hígados de ratones recién nacidos" . Mol. Celda. Biol . 19 (4): 2936–45. doi : 10.1128 / mcb.19.4.2936 . PMC 84088 . PMID 10082561 .
Zheng N, Fraenkel E, Pabo CO, Pavletich NP (1999). "Base estructural del reconocimiento de ADN por el factor de transcripción del ciclo celular heterodimérico E2F-DP" . Genes Dev . 13 (6): 666–74. doi : 10.1101 / gad.13.6.666 . PMC 316551 . PMID 10090723 .
Furukawa Y, Iwase S, Kikuchi J, et al. (1999). "La represión transcripcional del gen E2F-1 por interferón-alfa está mediada por la inducción de complejos E2F-4 / pRB y E2F-4 / p130" . Oncogén . 18 (11): 2003–14. doi : 10.1038 / sj.onc.1202500 . PMID 10208422 .
Lam EW, Glassford J, van der Sman J y col. (1999). "Modulación de la actividad E2F en células B primarias de ratón después de la estimulación a través de receptores de superficie IgM y CD40" . EUR. J. Immunol . 29 (10): 3380–9. doi : 10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199910) 29:10 <3380 :: AID-IMMU3380> 3.0.CO; 2-C . PMID 10540350 .
Zhong X, Hemmi H, Koike J y col. (2000). "Varios números de repetición de AGC en la región codificante del gen del factor de transcripción humano E2F-4". Tararear. Mutat . 15 (3): 296–7. doi : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200003) 15: 3 <296 :: AID-HUMU18> 3.0.CO; 2-X . PMID 10679953 .
Takahashi Y, Rayman JB, Dynlacht BD (2000). "Análisis de la unión del promotor por las familias E2F y pRB in vivo: distintas proteínas E2F median la activación y represión" . Genes Dev . 14 (7): 804–16. doi : 10.1101 / gad.14.7.804 (inactivo 2021-01-14). PMC 316494 . PMID 10766737 .Mantenimiento de CS1: DOI inactivo a partir de enero de 2021 ( enlace )
Schwemmle S, Pfeifer GP (2000). "Cribado de estructura genómica y mutación del gen E2F4 en tumores humanos" . En t. J. Cancer . 86 (5): 672–7. doi : 10.1002 / (SICI) 1097-0215 (20000601) 86: 5 <672 :: AID-IJC11> 3.0.CO; 2-X . PMID 10797289 .
Enlaces externos [ editar ]
E2F4 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
FactorBook E2F4
PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información de estructura disponible en el PDB para el factor de transcripción humano E2F4
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .
vtmiGalería PDB
1cf7 : BASE ESTRUCTURAL DEL RECONOCIMIENTO DE ADN MEDIANTE EL FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN DEL CICLO CELULAR HETERODIMÉRICO E2F-DP
vtmiFactores de transcripción y receptores intracelulares
(1) Dominios básicos
(1.1) Cremallera básica de leucina ( bZIP )
Factor de transcripción activador
AATF
1
2
3
4
5
6
7
AP-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
c-jun
JUNB
JunD
LLEVAR UNA VIDA DE SOLTERO
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
DBP
DDIT3
GABPA
GCN4
HLF
MAF
B
F
GRAMO
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Hélice-bucle-hélice básica ( bHLH )
Grupo A
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
MANO
1
2
MESP2
Factores reguladores miogénicos
MyoD
Miogenina
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Neurogeninas
1
2
3
OLIG
1
2
Paraxis
TCF15
Escleraxis
SLC
LYL1
TAL
1
2
Giro
Grupo B
FIGLA
Mi c
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Grupo C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
RELOJ
HIF
1A
EPAS1
3A
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Grupo D
BHLH
2
3
9
Pho4
IDENTIFICACIÓN
1
2
3
4
Grupo E
ÉL ES
1
2
3
4
5
6
7
OYE
1
2
L
Grupo F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
AP-4
MAX
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Mi c
SREBP
1
2
USF1
(1,4) NF-1
NFI
A
B
C
X
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
ESTÁ LOCO
6
7
4 )
(1,5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
ANK
(1.6) Hélice-tramo-hélice básica (bHSH)
AP-2
α
β
γ
δ
ε
(2) Dominios de unión al ADN con dedos de zinc
(2.1) Receptor nuclear (Cys 4 )
subfamilia 1
Hormona tiroidea
α
β
AUTO
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
subfamilia 2
GOLPE-TF
( Yo
II
Oreja-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Receptor testicular
2
4
TLX
subfamilia 3
Hormona esteroide
Andrógino
Estrógeno
α
β
Glucocorticoide
Mineralocorticoide
Progesterona
Relacionado con el estrógeno
α
β
γ
subfamilia 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
subfamilia 5
LRH-1
SF1
subfamilia 6
GCNF
subfamilia 0
DAX1
SHP
(2.2) Otras Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Factores de transcripción generales
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
TFIIF
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3A
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11A
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Familia Krüppel
1
2
3
DESCANSO
S1
S2
YY1
HIC
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
VENDER
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7A
7B
ZBTB
11
dieciséis
17
20
32
33
40
dedo de zinc
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35
41
43
44
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Composición alternante
AIRE
DIDO1
GRLF1
EN G
1
2
4
JARID
1A
1B
1C
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Dominios de hélice-vuelta-hélice
(3.1) Homeodominio
Clase ANTP de Antennapedia
protoHOX Hox-like
ParaHox
Gsx
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
Hox extendido: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
B2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
tipo metaHOX NK
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
ES
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
OTAN
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
otro
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1A
1B
SIN CAJA
CUENTO
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
MEIS
1
2
PBX
1
2
3
PKNOX
1
2
SEIS
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
dieciséis
17
20
21A
Dominio de POU
PIT-1
BRN-3 : A
B
C
Factor de transcripción de octamer : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Caja emparejada
PAZ
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
PHOX
2A
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Bicoide
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Cabeza de horquilla / hélice alada
E2F
1
2
3
4
5
Proteínas FOX
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Factores de choque térmico
HSF
1
2
4
(3.5) Clústeres de triptófano
DUENDE
2
4
5
EGF
ALCE
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ERGIO
SPIB
ETV
1
4
5
6
FLI1
Factores reguladores del interferón
1
2
3
4
5
6
7
8
MI B
MYBL2
(3.6) dominio TEA
factor potenciador transcripcional
1
2
3
4
(4) factores β-andamio con contactos de ranura menores
(4.1) Región de homología rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
RELA
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) ESTADÍSTICA
ESTADÍSTICA
1
2
3
4
5
6
(4.3) similar a p53
p53 p63 p73 familia
p53
TP63
p73
TBX
1
2
3
5
19
21
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Caja MADS
Mef2
A
B
C
D
SRF
(4.6) Proteínas de unión a TATA
TBP
TBPL1
(4.7) Grupo de alta movilidad
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1A
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
TOX
1
2
3
4
(4.9) Granulado
TFCP2
(4.10) Dominio de choque frío
CSDA
YBX1
(4.11) Enano
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Otros factores de transcripción
(0,2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Dominio de bolsillo
Rb
RBL1
RBL2
(0.5) Factores relacionados con AP-2 / EREBP
Apetala 2
EREBP
B3
(0.6) Varios
ÁRIDO
1A
1B
2
3A
3B
4A
GORRA
SI YO
dieciséis
35
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
A
B
C
Rho / Sigma
ver también deficiencias de factor de transcripción / corregulador
Este artículo sobre un gen en el cromosoma 16 humano es un fragmento . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo .